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当前生物量。作者手稿;PMC 2015年10月6日提供。
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mTORC1/S6K1通路通过eIF4B依赖性控制谷氨酰胺代谢c-Myc公司翻译

关联数据

补充资料

摘要

促生长信号分子包括哺乳动物雷帕霉素复合物靶点1(mTORC1)驱动癌细胞的代谢重编程,以支持其快速生长和增殖的生物合成需求[1]. 谷氨酰胺通过两个脱氨基反应分解为TCA循环中间产物α-酮戊二酸(αKG),第一个反应需要谷氨酰胺酶(GLS)生成谷氨酸,第二个反应通过谷氨酸脱氢酶(GDH)或转氨酶发生[2]. 先前研究表明,mTORC1通路的激活可促进谷氨酰胺通过GDH进入三羧酸(TCA)循环的回复性。此外,mTORC1激活也刺激谷氨酰胺的摄取,但机制尚不清楚[]. 一般认为,谷氨酰胺利用率受线粒体通过GLS摄取的限制,这表明除GDH外,mTORC1还可以调节GLS。在这里,我们证明mTORC1通过该酶正向调节GLS和通量。我们证明,mTORC1通过S6K1依赖性调控c-Myc(Myc)来控制GLS水平。在分子水平上,S6K1通过调节真核生物起始因子eIF4B的磷酸化来提高Myc翻译效率,该因子对解开其结构5'非翻译区(5'UTR)至关重要。最后,我们的数据表明,GLS的药理抑制是胰腺癌表达低水平PTEN的一个有希望的靶点。

结果和讨论

mTORC1通路调节GLS1

mTORC1正向调节进入TCA循环的谷氨酰胺净流量,因此表明GLS可能受mTORC2调节[]. 为了测试这种可能性,我们评估了mTORC1激活条件下的GLS蛋白水平。我们发现了Tsc2型-小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs)的缺陷或Rheb WT或活性突变体(S16H)的稳定表达导致GLS蛋白水平升高,mTORC1抑制后GLS蛋白降低(图1A和1B). 雷帕霉素在治疗6小时后有效降低GLS水平(图1C),与同一时间点减少谷氨酰胺消耗量一致(图1D). 测试的mTOR催化抑制剂包括LY294002和BEZ235,也导致MEF中GLS蛋白水平降低(图1E). 与mTOR抑制剂类似,敲低mTORC1通路的成分,包括猛禽、瑞b、RagA和mTOR本身,导致GLS蛋白水平降低(图S1A).

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mTORC1通路调节GLS1

(A-C、E)全细胞裂解物中的GLS蛋白水平来自:(A) Tsc2型WT和Tsc2型雷帕霉素处理−/−MEF 8h;(B)稳定表达Rheb WT、突变体S16H Rheb或空载体(EV)的HEK293T细胞,用雷帕霉素处理24h;(C) Tsc2型在指定的时间点用雷帕霉素处理−/−MEF;(E) Tsc2型WT和Tsc2型−/−用指定化合物处理8小时的MEFs。化合物的浓度为:雷帕霉素20ng/mL;LY294002 20μM和BEZ235 10μM。

(D)谷氨酰胺消耗的时间进程Tsc2−/−MEF与或不与20ng/mL雷帕霉素孵育24小时。每个时间数据点是三次重复实验的平均值。

(F)细胞内谷氨酰胺水平Tsc2型雷帕霉素处理−/−MEF 24小时。

(G)谷氨酰胺通量Tsc2型−/−表达空载体(EV)或用所示化合物处理24h后再表达TSC2的MEF。化合物的浓度为:雷帕霉素20ng/mL;LY294002 20μM、BEZ235 10μM、BPTES 10μM和DON 1mM。

显示平均值;误差条表示至少三个生物复制品的SEM。免疫印迹图像下方的数字表示根据负荷控制标准化的量化。

另请参见图S1.

哺乳动物GLS酶不同染色体编码中的两个不同基因:Gls1号机组肾型(K型)同工酶的基因编码,而Gls2公司基因编码肝脏型(L型)同工酶[4]. 的唯一表达式Gls1号机组,不是Gls2公司在我们的细胞系统中检测到(图S1B). 此外,Gls1号机组雷帕霉素治疗后Tsc2型−/−MEF(图S1C). p53最近被证明调节Gls2公司促进谷氨酰胺代谢,但对Gls1号机组描述了[5]. 一贯地,GLS的mTORC1依赖性调节独立于p53发生(图S1D). mTORC1对GLS水平的调节也应反映在谷氨酰胺转化为谷氨酸的过程中。雷帕霉素治疗增加细胞内谷氨酰胺水平(图1F) []. 此外,mTORC1的抑制降低了Tsc2型−/−MEF表示空向量(EV)或TSC2(图1G).

mTORC1途径通过Myc调节GLS1

致癌Myc被证明能积极刺激谷氨酰胺代谢相关基因的表达[6]. 此外,Myc通过抑制miR-23a/b的转录来调节GLS[7]. 与此一致的是,在人类胰腺癌细胞系BxPC3中使用两个siRNA(#25和26)有效地敲除Myc与GLS蛋白水平降低相关(图2A,车道5和6)。与GLS相似,Myc蛋白水平在Tsc2型与WT对应物相比,−/−MEF对雷帕霉素治疗敏感(图1A&2B型). 这些观察促使我们测试mTORC1是否通过Myc调节GLS水平。引人注目;我们发现Myc的稳定表达可以消除雷帕霉素诱导的GLS下降(图2C).

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mTORC1途径通过Myc调节GLS1

(A-C)全细胞裂解液中GLS和Myc蛋白水平:(A)转染非靶向对照siRNA(NTC)或四个独立的抗Myc siRNA 72小时的BxPC3细胞;(B) Tsc2型WT和Tsc2型雷帕霉素20ng/mL处理−/−MEF 8h;(C) Tsc2型−/−稳定表达Myc或空载体(EV)的MEFs,并用雷帕霉素20ng/mL处理24小时。

mTORC1底物S6K1控制Myc和GLS

尽管早期研究已将mTORC1与Myc联系起来[8],尚未描述机械细节。我们假设mTORC1下游效应器S6激酶1(S6K1)可能调节Myc。我们发现,用PF470861(PF)或雷帕霉素抑制S6K1导致Myc转录活性降低(图3A). 此外,催化活性S6K1(S6K1-F5A/R3A/T389E)的表达[9,10]导致Myc和GLS水平升高,并阻止雷帕霉素诱导的Myc和GLS水平降低(图3B). 雷帕霉素耐药的S6K1也显著降低了雷帕霉素诱导的细胞内谷氨酰胺水平的增加(图3C). 相反,S6K1/2的敲除或PF治疗导致Myc和GLS水平降低(图S2A和S2B). PF-治疗或S6K1/2敲除增加细胞内谷氨酰胺水平(图3DS2C公司)与S6K1/2缺失细胞谷氨酰胺摄取率降低相关(图3E). 重要的是,敲除Myc导致细胞内谷氨酰胺水平增加,与S6K抑制后在细胞内观察到的谷氨酰胺水平相当(图S2D和S2E). 总之,这些显示了S6K1/Myc介导的GLS和谷氨酰胺代谢调节的生物学意义。

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mTORC1底物S6K1通过Myc mRNA翻译控制GLS

(A)归一化荧光素酶光单位Tsc2型−/−稳定表达Myc-responsive萤火虫荧光素酶结构体(Myc-Luc)或载体控制(pCignal Lenti-TRE Reporter)的MEF。用雷帕霉素20ng/mL或PF4708671 10μM处理8h后测定Myc转录活性。

(B)表达HA-S6K1-CA(F5A-R3A-T389E)或经雷帕霉素20ng/mL处理24h的空载体(EV)的HEK293T细胞的全细胞裂解液中GLS和Myc蛋白水平。

(C-D)细胞内谷氨酰胺水平Tsc2型−/−MEF:(C)稳定表达S6KCA(F5A/R5A/T389E;将三种精氨酸或RSPRR基序中的所有残基突变为丙氨酸显示出相同的效果)[10]或空载体,用雷帕霉素20ng/mL或二甲基亚砜处理48h;(D)转染非靶向对照siRNA(NTC)或抗S6K1/2的siRNA。转染24h后,用PF4708671 10μM或DMSO处理转染NTC siRNA的细胞48h。

(E)谷氨酰胺消耗Tsc2型转染非靶向对照siRNA(NTC)或针对S6K1/2的siRNA的−/−MEF。转染72h后,收集培养基,测定培养基中谷氨酰胺的含量。

(F)归一化荧光素酶光单位Tsc2型在肾萤光素酶的控制下,用含有Myc的5’UTR的pDLN报告子构建体转染的WT MEFs。萤火虫荧光素酶用作内部控制。转染48小时后,用雷帕霉素20ng/mL或PF4708671 10μM处理细胞8小时。

(G)的相对水平Myc公司,Gls公司肌动蛋白mRNA在每个多体梯度部分。用qPCR测定mRNA水平,并将其归一化为5S rRNA水平。用雷帕霉素20ng/mL处理HEK293T细胞24h,在蔗糖密度梯度上分离多聚体。

(H-I)全细胞裂解液中GLS和Myc蛋白水平:(H) Tsc2型转染非靶向对照siRNA(NTC)或针对eIF4B的两个独立siRNA 72小时的−/−MEF;(一) Tsc2型稳定表达eIF4B WT、突变S422D或空载体(EV)的−/−MEF,并用雷帕霉素处理24h。

显示平均值;误差条表示至少三个生物复制品的SEM。星号(*)表示非特定带。免疫印迹图像下方的数字表示根据负荷控制标准化的量化。

另请参见图S2和S3.

Myc由S6K1通过eIF4B进行监管

雷帕霉素治疗抑制Myc公司信使核糖核酸[11],在其5'非翻译区域(5'UTR)中包含一个二级结构[12]. 与此一致,翻译抑制剂环己酰亚胺的治疗降低了Myc蛋白水平,这与雷帕霉素治疗24小时的效果相当(图S3A). S6K1促进具有高度结构5'UTR的mRNA翻译[13],建议对Myc公司mRNA翻译。为了评估这种可能性,我们使用了一个荧光素酶报告子,该报告子包含Myc公司我们发现雷帕霉素和PF显著降低Myc公司荧光素酶报告子,而荧光素素酶mRNA水平不受影响(图3FS3B型). 雷帕霉素诱导的内源性Myc公司信使核糖核酸向较轻的多糖体部分转移(图3G) [14],证明了这一点Myc公司在mTORC1抑制条件下,翻译减少。相比之下GLS公司肌动蛋白mRNAs不含高度结构化的5'UTRs,不受雷帕霉素处理的影响(图3G).

S422上依赖S6K1的eIF4B磷酸化导致翻译前启动复合物中eIF4B-eIF4A的关联增加[15]eIF4A解旋酶活性的增强[16]. 重要的是,击倒eIF4B或eIF4A导致GLS和Myc水平降低(图3HS3C系列). 一贯地,当eIF4B过度表达时,Myc公司mRNA向较重的多体部分移动,而eIF4B的敲除导致Myc公司较轻多体组分中的mRNA存在(图S3D) [17]. 为了进一步评估S6K1/eIF4B对Myc的影响,我们使用了一个eIF4B(S422D)的拟磷酸突变体。引人注目的是,该残基的突变抑制了雷帕霉素诱导的GLS和Myc的减少(图3I).

抑制GLS降低胰腺癌细胞的生长

最近的研究表明谷氨酰胺在支持癌细胞代谢方面起着重要作用,这表明GLS的mTORC1依赖性调节可能与癌细胞有关。我们测量了三种胰腺癌肿瘤细胞系(BxPC3、MIAPaCa-2和AsPC-1)中GLS和Myc的水平。BxPC3和MIAPaCa-2均显示S6的基础磷酸化水平较高(图4A),与PTEN的低水平一致[18]. 在BxPC3和MIAPaCa-2细胞中GLS和Myc的水平都较高,并且在雷帕霉素或BEZ235抑制mTORC1后,GLS和Myc的水平降低(图4A). 有趣的是,BEZ235对GLS的影响在BxPC3细胞中更为明显(图4A). 与AsPC-1细胞相比,BxPC3细胞中GLS水平较高与谷氨酰胺消耗增加相关(图4B). 鉴于谷氨酰胺代谢在推动癌细胞生长中的重要性,我们推测抑制谷氨酰胺代谢可能会通过增加mTORC1信号降低胰腺细胞的生长。为了验证这一想法,我们使用GLS-1抑制剂BPTES进行了凤尾鱼非依赖性生长试验。我们发现BPTES显著降低了BxPC3细胞在软琼脂中的生长能力,同时不影响AsPc-1细胞的生长(图4C和4D). 最近研究表明,胰腺导管腺癌的生长对GLS-1抑制剂敏感[19]. 添加TCA循环中间产物草酰乙酸(OAA)能够在GLS抑制后挽救BxPC3细胞的生长(图4C). OAA通过维持NADPH/NADP在胰腺癌细胞生长中发挥重要作用+比率[19]. 我们一直观察到抗氧化剂N-乙酰半胱氨酸(NAC)可以挽救在BPTES存在下培养的BxPC3细胞的生长下降(图4D). 总之,这些数据表明,mTORC1介导的GLS调控对谷氨酰胺补体、氧化还原稳态和胰腺癌细胞生长至关重要。

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抑制GLS降低胰腺癌细胞的生长

(A)用雷帕霉素20ng/mL或BEZ235 1μM处理24小时的BxPC3、MIAPaCa-2或AsPC-1细胞的全细胞裂解物中的GLS和Myc蛋白水平。

(B)电镀48小时后BxPC3或AsPC-1细胞的谷氨酰胺消耗。

(C-D)软琼脂分析:(C)经BPTES(10μM)处理的BxPC3或AsPC-1细胞,以及经BPTES+OAA(2mM)联合处理的细胞;(D)用BPTES处理的BxPC3或AsPC-1细胞,以及BPTES(10μM)+NAC(10mM)的组合。

显示平均值;误差条表示至少三个生物复制品的SEM。

在本研究中,我们确定GLS是参与能量代谢的mTORC1/S6K1信号的下游效应器。我们证明S6K1通过提高癌基因Myc mRNA的翻译效率,在分子水平上积极控制GLS;我们发现S6K1通过磷酸化起始因子eIF4B调节Myc(图3). 我们的数据扩展了我们先前的模型,证明eIF4B的磷酸化促进了翻译前启动复合体(PIC)中eIF4B-eIF4A的关联[15]. 这种相互作用增强了eIF4A解旋酶活性Myc公司mRNA翻译是通过提高PIC转移到翻译起始位点的能力和/或暴露隐藏在结构5'UTR内的可能的内部核糖体进入位点(IRES)来实现的[20,21]. 通过这种方式,mTORC1/S6K1调节的解旋酶刺激增加了参与Myc公司信使核糖核酸翻译。始终如一地Myc公司通过雷帕霉素或eIF4B敲除,观察到mRNA从较重到较轻的多聚体分布,并与之前的多聚体形貌一致(图3GS3D系列) [14,17]. 尽管S6K1介导的Myc蛋白稳定性调节也被提出[22,23],在我们分析中使用的条件下,MG132治疗未发现Myc水平的显著变化(图S3E). 此外,外源性Myc;没有5'UTR的雷帕霉素没有显著降低(图2C)与内源性Myc及其5'UTR相比(图2B). 总之,这些数据与mTORC1/S6K1通过调节其mRNA翻译起始效率来控制Myc表达的模型一致。先前的研究表明,致癌Myc通过抑制miR-23a/b表达,在转录后积极调节GLS水平[7]. 重要的是,雷帕霉素对mTORC1的抑制增加了miR-23a/b水平(图S3F),通过Myc-介导的miR-23a/b控制将mTORC1调节GLS表达联系起来。有趣的是,我们观察到mTORC1/S6K1在蛋白和mRNA水平上对GLS表达的调节。然而,Gls公司Myc基因敲除对转录没有显著影响(图S3G)这与之前的工作一致,表明Gls公司mRNA水平对P493-6细胞Myc水平的改变没有反应[7]. 因此,尽管Myc介导的GLS表达控制在mTORC1下游发挥主要作用,但mTORC1可能具有其他机制来调节Gls公司mRNA水平。

通过GLS的调节,S6K1首次与谷氨酰胺摄取和代谢直接相关。有趣的是,最近的两项研究表明S6K1控制核苷酸的合成[24,25],这一过程需要谷氨酰胺衍生的氮。因此,结合这些研究和本文提供的数据,揭示了mTORC1/S6K1信号通过GLS促进谷氨酰胺摄取的正反馈机制的存在,为创造细胞生长所需的遗传物质提供了基础。除了为蛋白质和核苷酸合成提供氮外,谷氨酰胺还可作为生长和增殖的燃料[26]. 有趣的是,mTORC1还刺激谷氨酰胺衍生的αKG通过GDH进入TCA循环[]证明mTORC1的激活涉及谷氨酰胺补体的各个方面。

越来越多的证据支持谷氨酰胺代谢在推动肿瘤生长中的主要作用。例如,GLS的敲除或抑制会损害多种癌细胞的生长,包括前列腺癌、胶质瘤、淋巴瘤和胰腺癌[7,19,27,28]. 沿着这些路线,我们观察到,在用BPTES抑制GLS-1后,由于mTORC1过度激活,表达较高水平GLS的胰腺癌细胞的锚定非依赖性生长减少。鉴于正在开发临床级GLS抑制剂,这一发现可能具有重要的治疗意义[29]因为谷氨酰胺代谢增加对正常分化细胞并不重要。GLS抑制剂的使用可以提供更大的疗效,同时具有更少和更少的毒性副作用。

实验程序

细胞系和培养

Tsc2−/−p53−/–,Tsc2重量p53−/-、Tsc1−/-p53−/−和Tsc1–/-p53+/+MEF由Brendan Manning博士和David Kwiatkowski博士(哈佛医学院)提供。所有其他细胞系(HT-29、BxPC3、MIAPaCa-2、AsPC-1、HEK293T)均来自ATCC。MEF、HT-29和HEK293T在DMEM中培养。在RPMI培养基(Mediatech)中培养BxPC3、MIAPaCa-2和AsPC-1细胞。DMEM或RPMI补充10%FBS(透析剥夺实验,Gibco)。不包括通常添加到某些DMEM配方中的所有额外含能添加剂,如丙酮酸钠和琥珀酸钠。

细胞裂解和免疫印迹

用冷PBS清洗过一次的细胞,然后将其溶解在常规的溶解缓冲液中(40mM HEPES[pH 7.4],1mM EDTA,120mM NaCl,10mMβ-甘油磷酸盐,1mM NaF,1mM钠4和0.3%CHAPS)或低盐溶解缓冲液(40mM HEPES[pH7.4],1mM EDTA,10mMβ-甘油磷酸,1mM NaF,1mM钠4和0.3%CHAPS)添加蛋白酶抑制剂(250μM PMSF、5μg/ml Pepstatin A、10μg/ml Leupeptin和5μg/ml Aprotin)。通过在4°C下以10000rpm离心10分钟获得清除的细胞裂解物,并使用30μg裂解物进行免疫印迹。简而言之,蛋白质通过8-12%的SDS-PAGE溶解,然后转移到硝化纤维素膜上。初级抗体在4°C下培养过夜。红外荧光IRDye二级抗体用于在LI-COR/Odyssey系统中形成带强度。使用Adobe Photoshop CS3 Extended软件量化波段强度。

谷氨酰胺消耗量和谷氨酰胺流量

使用黄泉仪器(YSI)7100测量新鲜和废培养基中的谷氨酰胺浓度(在没有药物的情况下培养24-48小时后)。谷氨酰胺水平被标准化为细胞数量。用于这些实验的培养基不含丙酮酸,并补充有10%的透析FBS。根据谷氨酰胺摄取率和谷氨酸分泌率计算谷氨酰胺净通量。

统计

数据表示为至少三次独立实验平均值(SEM)的平均±标准误差(一式三份)。一个不成对的双尾学生t吨-测试用于确定两组之间的差异。

集锦

  • mTORC1通路正向调节GLS和谷氨酰胺的流量。
  • mTORC1控制Myc mRNA的翻译效率。
  • S6K1通过eIF4B磷酸化调节Myc翻译。
  • 抑制GLS可降低胰腺癌细胞的生长。

补充材料

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致谢

我们感谢Greg Hoffman、Sarah Mahoney、Gwen Buel、Sang Gyun Kim、Jeannie Li、Emrah Er和布莱尼实验室其他成员的批判性讨论和技术援助。我们还感谢Chi V.Dang和Takashi Tsukamoto(约翰·霍普金斯)提供试剂。我们感谢Alexandra R.Grassian和Jonathan Coloff(Brugge lab-HMS)对谷氨酰胺测量的帮助。我们感谢Jonathan Hurov和Agios Pharmaceuticals为GLS提供特异性抗体。AC是LAM基金会博士后研究员。GL是LAM基金会和结节性硬化症联盟博士后研究员。德国劳埃德船级社由韩国国家研究基金会资助2012R1A6A3A03039825。JB是LAM基金会的资深研究员。NIH拨款GM51405和CA46595为布莱斯实验室提供研究支持。

脚注

出版商免责声明:这是一份未经编辑的手稿的PDF文件,已被接受出版。作为对客户的服务,我们正在提供这份早期版本的手稿。手稿在以最终可引用的形式出版之前,将经过编辑、排版和校对结果证明。请注意,在制作过程中可能会发现可能影响内容的错误,适用于该期刊的所有法律免责声明均适用。

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