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肿瘤发生。2023年12月;12(1): 25.
2023年5月6日在线发布。 数字对象标识:10.1038/s41389-023-00471-5
预防性维修识别码:项目编号C10163001
PMID:37147294

miR-137–LAPTM4B通过RhoA-LIMK-Cofilin途径调节骨肉瘤细胞骨架组织和肿瘤转移

关联数据

补充资料
数据可用性声明

摘要

骨肉瘤(OS)是一种罕见的恶性骨肿瘤,但却是儿童和青少年癌症死亡的主要原因之一。癌症转移是OS患者治疗失败的主要原因。细胞骨架的动态组织是细胞运动、迁移和肿瘤转移的基础。溶酶体相关蛋白跨膜4B(LAPTM4B)是一种癌基因,参与癌症生物发生的各种生物学过程。然而,LAPTM4B在OS中的潜在作用及其相关机制尚不清楚。在这里,我们建立了OS中LAPTM4B的高表达,并且它在通过RhoA–LIMK–cofilin信号通路调节应激纤维组织中至关重要。在机制方面,我们的数据表明,LAPTM4B通过抑制泛素介导的蛋白酶体降解途径促进RhoA蛋白的稳定性。此外,我们的数据显示,miR-137,而不是基因拷贝数和甲基化状态,是导致OS中LAPTM4B上调的原因。我们报道miR-137能够通过靶向LAPTM4B调节应激纤维排列、OS细胞迁移和转移。结合细胞、患者组织样本、动物模型和癌症数据库的结果,这项研究进一步表明miR-137–LAPTM4B轴代表了OS进展的临床相关途径和新疗法的可行靶点。

主题术语:细胞骨架,转移

介绍

骨肉瘤(OS)是一种来源于成骨细胞的罕见恶性骨肿瘤,但却是儿童和青少年癌症死亡的主要原因,转移或复发OS患者的5年生存率约为20%[1]. 新技术,例如X射线和磁共振成像(MRI)明显有助于疾病诊断。然而,几乎没有发现OS的潜在靶点,过去几十年来,OS的临床治疗也很少有重大改进[1]新辅助化疗结合手术仍是最常用的治疗方法。癌症转移是OS患者治疗失败的主要原因[2]因此,破译基础分子机制可能会开发针对OS的新型靶向治疗药物。

细胞运动、迁移和癌症转移依赖于动态细胞骨架,该骨架受多个信号通路之间的串扰调节[]. 应力纤维是为细胞迁移和粘附提供力量和支持的细胞骨架结构,其组织据报道促进癌细胞的硬化和增殖[4]. 应力纤维是由肌动蛋白、肌球蛋白以及交联蛋白组成的收缩结构,并经历动态组装和拆卸[5]. 已经确定了几个调节细胞骨架排列的工具分子,小GTPases Rac1、Cdc42和RhoA位于中心位置[68]. Rac1通过激活肌动蛋白成核复合物刺激跛足和膜皱褶的形成,而Cdc42则诱导丝状伪足的形成,指明了细胞迁移的方向[5]. RhoA通过LIM激酶(LIMK)-cofilin途径直接促进应激纤维的形成。具体来说,cofilin作为一种肌动蛋白结合蛋白,对肌动蛋白丝解聚至关重要[8,9]LIMK通过调节cofilin的磷酸化来调节肌动蛋白的动力学。通过促进LIMK磷酸化,RhoA消除了cofilin的肌动蛋白结合活性,并进一步促进应激纤维的形成[9].

溶酶体相关蛋白跨膜4B(LAPTM4B)最初是从肝细胞癌中克隆的[10]. 急性白血病中LAPTM4B表达升高[11]和其他几种实体癌[12,13],并在功能上参与调节茎[11],耐药性[12,14],自噬[13]以及迁移和转移[15]. 在分子水平上,LAPTM4B相互作用并稳定内胚体的表皮生长因子受体(EGFR),抑制EGF诱导的EGFR分选和溶酶体降解,延长EGFR信号传导[16,17]. 已证明LAPTM4B可以调节亚细胞神经酰胺库[1820]并与亮氨酸转运体CD98hc相互作用[21,22],调节细胞营养信号[2123]. 最近,我们发现LAPTM4B促进整合素β1再循环和局部粘附动力学,这是促进皮肤癌发展的关键进展[24]. 然而,尽管两项初步研究表明LAPTM4B在OS中的高表达,但迄今为止对LAPTM4 B在OS的研究还不够深入[25,26]. 支持OS中LAPTM4B失调的详细机制尚不清楚,此外,功能表型和相关机制仍不清楚。

基因组不稳定/基因扩增改变是癌症的新标志之一[27]基因拷贝数变异(CNV)和甲基化状态是导致基因表达异常的主要原因[28,29]. 或者,转录后调控,如MicroRNAs(miRNAs),提供了另一种失调机制。例如,miR-155、miR-944和miR-129*参与肺癌细胞增殖、肿瘤生长[30,31]、癌症转移[32]分别为。miRNAs与癌基因或抑癌基因之间的相互作用被认为是一个复杂的网络,在癌症中普遍存在并发挥作用[33].

在当前的研究中,我们深入挖掘了公开可用的数据库,并检查了OS细胞和组织,以深入了解LAPTM4B在OS中的调节和功能。我们确定miR-137是OS中LAPTM4B表达的生理相关调节因子。MiR-137能够通过靶向LAPTM4B来排列细胞骨架。此外,miR-137–LAPTM4B调控进一步控制体外细胞迁移和体内肺转移。从机制上讲,LAPTM4B在通过RhoA–LIMK–cofilin信号轴刺激细胞骨架组织中至关重要,LAPTM 4B通过抑制泛素介导的蛋白酶体降解途径促进RhoA蛋白的稳定性。我们在本研究中的数据表明,miR-137–LAPTM4B轴代表了OS进展过程中的一种新的信号转导途径,这可能是癌症治疗药物开发的一个可见靶点。

材料和方法

人类细胞系和组织标本

骨肉瘤细胞系U2OS、MG-63、HOS、143B和成骨细胞hFOB1.19来自美国型培养物收集(ATCC)。所有细胞均通过STR图谱鉴定,并通常进行支原体污染检测。

如前所述,由CRISPR/Cas9n生成LAPTM4B KO细胞[2224]. 简言之,分析并选择LAPTM4B(基因ID:55353)第3外显子的编码序列,以设计Cas9缺口酶靶点(http://crispr.mit.edu). 然后我们通过BbsI位点亚克隆导向RNA(sgRNAs)。我们进一步用Cas9缺口酶和sgRNA表达质粒转染细胞,并用含有嘌呤霉素(2µg/ml)的培养基选择细胞48小时。随后,我们分离出单个克隆,并通过Sanger测序和western blotting进行验证。

为了产生稳定的LAPTM4B过表达细胞系,我们用含有LAPTM4 B-24-3xFlag或CD63-3xFlang的pEFIRES-P转染KO细胞/WT细胞,使用Lipofectamine LTX和PLUS试剂。细胞在含有2µg/ml嘌呤霉素的培养基中生长,直到形成抗性细胞池。所有骨肉瘤细胞和成骨细胞hFOB1.19在DMEM+10%FBS+L-谷氨酰胺+青霉素/链霉素、37°C和5%CO中保存2.

骨肉瘤癌组织来自31名接受切除术的患者。没有患者在手术前接受过治疗。肿瘤样本来自原发肿瘤。所有这些样本都是根据世界卫生组织的分类进行诊断的。将10例患者的父系样本包埋在石蜡中,用于苏木精、伊红(H&E)染色和免疫组织化学(IHC)染色;来自21名患者的其余样本在液氮中进行snap冷冻,用于qPCR和western印迹。本研究得到了当地研究伦理委员会的批准,并按照赫尔辛基宣言的指示从所有患者那里获得了书面知情内容。

试剂、质粒、抗体和siRNA

Alexa Fluor 568 Phalloidin来自分子探针(类别号A-12380),Hiperfect转染试剂来自QIAGEN(类别号301705)。含PLUS试剂的脂质己内酰胺LTX来自Invitrogen(产品目录号15338100)。LAPTM4B-3′UTR荧光素酶质粒(Cat#HmiT014362-MT01)及其阴性对照品(Cat#CmiT000001-MT01)购自GeneCopoire,两个质粒均从pEZX-MT01载体中克隆。Agomir-137-3p(Cat#miR40000429-4-5)和相关对照品由RiboBio合成和纯化。

小鼠单克隆抗Flag(M2)来自Sigma-Aldrich(Cat#F1804),小鼠单克隆抗体LAPTM4B来自Atlas抗体(Cat#AMAb91356)。来自Cell Signaling Technology(Cat#3671)的磷酸肌球蛋白轻链2抗体、来自Covance(Cat#PRB-440P)的非肌肉肌球蛋白重链II-A抗体、来自Abcam(Cat#ab12866)的Cofilin(磷酸S3)抗体、来自于Abcam的Cofillin抗体(Cat#ab 42824)、来自Cell信号技术(Cat#3841)的磷酸LIMK1(Thr508)/LIMK2(Thr50)抗体、,来自Sigma-Aldrich(Cat#F1804)的标记抗体和来自Cell Signaling Technology(Cat#2601S)的磷蛋白-PAK抗体。来自Proteintech的E-cadherin抗体(Cat#20874-1-AP)、来自ZENBIO的Vimentin抗体(Cat#R22775)、来自Cell Signaling Technology的Phospho-AKT抗体(Cat#1060)、来自Santa Cruz的MMP2抗体(Cat#sc-13595)和来自Proteitech的HA抗体(Cat#51064-2-AP)。

来自Santa-Cruz(Cat#sc-418,用于免疫沉淀和免疫荧光)和Proteintech(Cat#66733-1-lg,用于免疫印迹)的RhoA抗体。Santa Cruz的蛋白A/G琼脂糖珠(Cat#sc-2003),Proteintech的泛素抗体(Cat#10201-2-AP)。Proteintect(Cat#60004-1-lg)的GAPDH抗体,Proteintetect(Cat#66031-1-lg)的α-微管蛋白抗体。

第二抗体山羊抗小鼠IgG(H+L)-HRP(猫号1706516)和山羊抗大鼠IgG(H+L)-HRP(猫号1706515)来自BioRad。交叉吸附Alexa Fluor 488山羊反鼠(Cat#A-11001)来自赛默飞世尔科技公司。预先设计的“消音器选择”LAPTM4B siRNA1(GGAUCAGUAACUUUUCATT)、LAPTM4 B siRNA2(CCUACCUGUUUGUCCUUATT)和Ctrl-siRNA来自Ambion。

定量PCR

对于mRNA表达分析,使用RNA隔离器总RNA提取试剂(Vazyme,Cat#R401-01)从细胞或组织中分离总RNA。使用StepOne实时PCR系统(Applied Biosystems,Foster City,CA,USA),通过Hifair®V一步RT-gDNA消化SuperMix进行qPCR(Yeasen,Cat#111141ES60)合成cDNA。

对于miRNA表达分析,使用Hifair®III第一链cDNA合成试剂盒(YEASEN,类别号11139ES10)将总RNA反转录到cDNA中,并根据制造商的说明使用Hieff®qPCR SYBR Green Master Mix(YEASE,类别号11203ES03)进行qRT-PCR分析。我们研究中的所有引物都列在补充表中S1(第一阶段).

体内转移试验

所有异种肿瘤实验均按照动物实验规程进行,并经安徽医科大学伦理委员会批准(批准号:20200490)。

雌性BALB/c裸鼠(4周)购自Vital River Laboratories(中国北京),并在标准条件下饲养。将动物随机分为不同组。

在一个实验中,小鼠静脉植入U2OS细胞或MG-63细胞(1×106–6 × 1060.2ml PBS中的细胞)分别注入尾部外侧静脉。注射后6周处死这些小鼠。

在另一个实验中,20只小鼠(每组5只)静脉植入143B细胞(WT、CD63-Flag稳定表达或LAPTM4B-Flag稳定表达),并用10μmol/kg agomir-137-3p或对照组每三天腹腔注射一次,连续4周。随后处死小鼠,对不同组的肺转移结节进行组织学检查、计数和统计分析。在动物实验中,研究人员在实验期间没有对组分配盲目。

数据挖掘

TARGET数据库(https://ocg.cancer.gov/programs/target)和基因表达综合(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo网站/)研究骨肉瘤中LAPTM4B的表达。CCLE数据库(https://sites.broadinstitute.org/ccle网站/)用于评估OS细胞系中LAPTM4B的表达、拷贝数和甲基化状态。从EWAS数据中心获得OS肿瘤组织和对照正常组织中LAPTM4B启动子的甲基化百分比(https://ngdc.cncb.ac.cn/ewas/datahub/index). 结合TCGA和GTEx数据库研究LAPTM4B表达与癌症患者生存率的关系。为了评估miRNAs和LAPTM4B的表达水平,我们使用python API“xenaPython”以编程方式访问公共Xena数据(Pancan Atlax Hub)中的数据。基因MANIA预测了LAPTM4B和RhoA之间的共表达/物理相互作用(http://genemania.org/). GeneMANIA通过使用大量功能关联数据,包括基因组学和蛋白质组学数据、蛋白质和遗传相互作用、共同表达、共同定位、蛋白质结构域相似性等,预测基因功能和输入基因的关系[34].

统计分析

所有数据均表示为来自至少三个独立实验的平均值±标准误差(SEM)。使用Student的t检验计算两两比较的统计显著性,以及Holm的t吨-多重比较测试。采用皮尔逊相关系数检验确定miRNA水平与基因表达之间的关系。统计学显著性水平设定为0.05*第页 < 0.05.

有关方法的其他详细说明,请参见补充材料和方法.

结果

OS中LAPTM4B的表达升高

为了评估LAPTM4B在OS中的功能作用,我们首先挖掘了癌症细胞系百科全书(CCLE)数据库,发现LAPTM4 B在肉瘤中的表达相对较高(图。(图1a1a个和补充图。第1节a). 肉瘤包括OS、软骨肉瘤、尤因肉瘤、滑膜肉瘤、平滑肌肉瘤等,分析了LAPTM4B在这些细胞系中的详细表达(图。(图1b1亿和补充表S2系列). 我们接下来检查了培养细胞中LAPTM4B蛋白的水平,发现与成骨细胞系hFOB1.19相比,OS细胞系中LAPTM 4B蛋白水平升高(图。(图1c1c个).

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LAPTM4B上调与OS患者的生存概率相关。

CCLE数据库中不同癌症类型细胞系中LAPTM4B mRNA的详细表达。b条OS细胞系中LAPTM4B mRNA的表达。上图:LAPTM4B在肉瘤细胞系不同谱系亚型中的表达,第页(骨肉瘤、软骨肉瘤)=0.04,第页(骨肉瘤、脂肪肉瘤)=0.015。下面板:几个代表性OS单元中的详细表达级别。第页-通过比较各组的表达数据和“骨肉瘤”的表达数据来计算该值。*表示“第页 < 0.05”,“n.s”表示“无意义”。c(c)用蛋白质印迹法测定hFOB1.19、MG-63、HOS和U2OS中LAPTM4B的蛋白水平。左侧面板:代表性实验。右侧面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“hFOB1.19”,第页(hFOB,MG-63)=0.0145,第页(hFOB,HOS)=0.0368,第页(hFOB,U2OS)=0.0226。“长期经验”:“长期暴露”。d日LAPTM4B表达式(Log2来自GEO数据库(GSE99671)的OS肿瘤组织和对照正常组织中的CPM)。平均值±SEM,第页(正常,肿瘤)=0.008。“正常组织”代表“骨组织”。e(电子)LAPTM4B表达式(Log2FPKM)和GEO数据库(GSE126209)中的对照正常组织。平均值±SEM,第页(正常,肿瘤)=0.0005。“正常组织”代表“相邻正常组织”。(f)采用免疫组织化学方法检测手术标本中肿瘤组织和邻近正常组织中LAPTM4B蛋白水平。左图:H&E染色和IHC染色的代表性图像。右侧面板:IHC结果的量化。数据来自10名患者的127张图像。平均值±扫描电镜,数据归一化为“骨肉瘤”,第页(骨肉瘤,骨髓)=0.0125,第页(骨肉瘤,结缔组织)=0.0344,第页(骨肉瘤,骨)=0.0112。比例尺:0.125 mm。通过western blotting检测收集的OS手术标本中肿瘤组织和邻近正常组织中的LAPTM4B蛋白水平。上面板:代表性实验。下面板:量化n个 = 3次技术重复,平均值±SEM,数据标准化为“正常”,第页(正常,肿瘤)=0.0014。T肿瘤组织,N邻近正常组织。小时采用Western blotting法测定7例OS患者肿瘤和配对正常组织中的LAPTM4B蛋白水平。上面板:代表性实验。下面板:量化n个 = 3次技术重复,平均值±SEM,数据标准化为“正常”,第页(正常,肿瘤)=0.000245。T肿瘤组织,N邻近正常组织。从TCGA和GTEx数据库的联合分析中得出肉瘤患者LAPTM4B表达的总体生存概率。

来自基因表达综合数据库(GEO)的分析数据显示,与正常对照组织相比,OS肿瘤组织中LAPTM4B上调(GSE99671、GSE126209)(图。第1天,第5天). 通过免疫组织化学和免疫印迹法,进一步观察到从OS患者收集的手术组织样本中LAPTM4B表达升高(图。1f,克). 此外,我们检测了7例患者肿瘤和配对正常组织中的LAPTM4B水平,结果证实LAPTM4 B在OS肿瘤组织中上调(图。(图1h1小时).

接下来我们研究了LAPTM4B表达增加的临床相关性。来自TCGA和GTEx数据库的联合分析表明,LAPTM4B的表达与两种肉瘤的总体生存预期呈负相关(图。(图1i)1个)泛癌包括33种癌症(附图。S1b类). 来自GEO(GSE16102)和TARGET数据库的进一步分析显示,LAPTM4B的表达与OS的总生存率呈负相关(补充图。第1节c). 表达水平和临床相关性表明,上调的LAPTM4B可能参与OS进展并具有关键功能。

LAPTM4B对应力纤维组织至关重要

由于LAPTM4B在OS中的表达升高,并且在其他癌症中的功能已经确立,我们接下来研究了LAPTM4 B在OS的作用。有趣的是,通过使用两种不同的siRNAs沉默U2OS细胞中的LAPTM4B,诱导了细胞形态和应力纤维模式的类似重塑,如阴茎倍肽染色(图。(图2a)。2a个). 进一步量化显示LAPTM4B下调后细胞面积和横弧数显著减少(图。(图2b)。2亿). 重要的是,在CRISPR-Cas9n产生的LAPTM4B敲除(KO)U2OS细胞中也观察到了这些改变(图。2a–c)表明LAPTM4B在压力纤维组织中发挥着重要的调节作用。

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LAPTM4B对应力纤维组织至关重要。

U2OS细胞中的应力纤维通过所示细胞中的鬼笔肽染色可见。比例尺:50µm。对于siRNA处理的细胞,转染72小时后,固定细胞进行免疫荧光。b条对所示单元格中的单元格面积(左侧面板)和横弧数(右侧面板)进行量化。量化n个 = 3个实验,n个 > 每组53个细胞。平均值±SEM,数据归一化为“NC siRNA”或“WT”。对于单元格区域,第页(NC siRNA,L4B siRNA1)=0.0354,第页(NC siRNA,L4B siRNA2)=0.0238,第页(重量,L4B KO)=0.0395。对于横弧编号,第页(NC siRNA,L4B siRNA1)=0.0093,第页(NC siRNA,L4B siRNA2)=0.0126,第页(重量,L4B KO)=0.0189。WT宽型,L4B LAPTM4B。c(c)通过Western blotting测定LAPTM4B蛋白水平。上面板:代表性实验。下面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“NC siRNA”或“WT”,第页(NC siRNA,L4B siRNA1)=0.0138,第页(NC siRNA,L4B siRNA2)=0.0076,第页(重量,L4B KO)=0.001。d日通过western blotting测定U2OS细胞中NM2A蛋白水平和MLC2磷酸化水平。上面板:代表性实验。下面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“NC siRNA”。对于siRNA处理的细胞,转染72小时后,收集细胞进行Western印迹。e(电子)通过western blotting测定所示细胞中Cofilin的总蛋白水平和磷酸化水平(磷酸S3)。上面板:代表性实验。下面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“NC siRNA”或“WT”,第页(NC siRNA,L4B siRNA1)=0.0256,第页(NC siRNA,L4B siRNA2)=0.0134,第页(重量,L4B-KO)=0.008。(f)通过Western blotting检测所示细胞中LIMK1/2的磷酸化水平。上面板:代表性实验。下面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据标准化为“NC siRNA”或“WT”,第页(NC siRNA,L4B siRNA1)=0.0351,第页(NC siRNA,L4B siRNA2)=0.0242,第页(重量,L4B KO)=0.0213。

应力纤维在对肿瘤进展至关重要的细胞活动中发挥着重要作用,例如细胞增殖和细胞运动[5]. 因此,我们检查了参与应力纤维动力学的主要机械是否受到LAPTM4B的影响。据报道,肌球蛋白轻链(MLC)的磷酸化对应力纤维组装是必要的[35],并且Ser3处的cofilin磷酸化使其肌动蛋白结合能力失活,从而促进应激纤维的分解[9]. 我们发现,LAPTM4B缺失不会导致非肌肉肌球蛋白2A(NM2A)水平或MLC磷酸化状态的任何显著差异(图。(图2d)。二维). 相反,在LAPTM4B siRNA处理的细胞和LAPTM4 B KO细胞中,cofilin的磷酸化显著降低,cofillin是应激纤维分解的关键调节因子,而cofilins总量没有改变(图。(图2e第二版).

因为LIMK可以在Ser3磷酸化cofilin[9],我们假设LAPTM4B通过LIMK-cofilin途径刺激应力纤维排列。事实上,通过沉默或敲除LAPTM4B(图。(图2f2英尺).

LAPTM4B通过抑制泛素蛋白酶体降解促进RhoA稳定性

LIMK的磷酸化受到PAK(p21蛋白活化激酶)、ROCK(Rho-associated protein kinase)和MRCK(myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-结合激酶)的动态调节[8]. 这些分子可以被GTP酶激活,例如.Cdc42和Rac调节PAK[36],Cdc42激活MRCK[37]而RhoA/ROCK/LIMK级联在应力纤维形成和OS开发中起着关键作用[8]. 因此,我们质疑这些关键蛋白是否由LAPTM4B调节。Western blotting报告与PAK的磷酸化水平无差异(补充图S2a、b)这与我们最近的发现一致,即Cdc42(PAK1/2的上游GTPase)活性没有被LAPTM4B调节[24]. 我们进一步研究了LAPTM4B是否对RhoA具有任何调节作用。有趣的是,LAPTM4B缺失的U2OS细胞中RhoA蛋白水平显著降低(图。(图3a),3a年),在另一个OS细胞系MG-63中也发现了类似的减少(补充图。第3章)这与生物信息学预测的LAPTM4B和RhoA之间的潜在共表达/物理相互作用相一致(图。(图3b)。3亿). 在此GeneMANIA预测中,分析了LAPTM4B和RhoA之间的功能关系[34],预测的物理相互作用(蛋白质之间)的网络权重指数表明LAPTM4B可能与RhoA蛋白相互作用。

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LAPTM4B抑制RhoA的泛素蛋白酶体降解。

在LAPTM4B耗竭的U2OS细胞中通过蛋白质印迹法测量RhoA蛋白水平。左侧面板:代表性实验。右侧面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“NC siRNA”或“WT”。第页(NC siRNA、L4B siRNA)=0.0243,第页(重量,L4B KO)=0.007。对于siRNA处理的细胞,转染72小时后,收集细胞进行Western印迹。b条GeneMANIA的生物信息学预测表明,LAPTM4B和RhoA之间存在潜在的共表达/物理相互作用。c(c)用指示的siRNAs转染U2OS细胞,转染48 h后用Q-PCR检测RhoA mRNA的表达。d日U2OS细胞用50µg/mL环己酰亚胺(CHX)处理指定时间,并通过Western blotting评估RhoA蛋白水平。上面板:代表性实验。下面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM。红色虚线表示内源性RhoA降解一半的时间点。e(电子)U2OS细胞用1µmol/L巴菲菌素A1(Baf)或20µmol/L MG-132以及50µg/mL CHX处理指定时间,并通过蛋白质印迹评估RhoA蛋白水平。上面板:代表性实验。下面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM*第页 < 0.05.(f)用指示的siRNA转染U2OS细胞,然后用50µg/mL CHX处理细胞指定的时间,并通过western blotting评估RhoA蛋白水平。上面板:代表性实验。下面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM*第页 < 0.05.用指示的siRNA转染U2OS细胞,72 h后收获进行免疫沉淀,收获前用20µmol/L MG-132处理细胞9 h。用RhoA抗体进行免疫沉淀,然后用泛素抗体对裂解产物进行免疫印迹。左侧面板:代表性实验。右侧面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“NC siRNA”。第页(NC siRNA,L4B siRNA)=0.0231。小时HA标记的LAPTM4B稳定表达细胞和对照细胞被HA抗体免疫沉淀,裂解产物随后被RhoA抗体免疫印迹。左侧面板:代表性实验。右侧面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“Ctrl”。第页(控制,笔记本4B)=0.03687。通过使用抗HA抗体(品红色)和抗RhoA抗体(绿色)在稳定表达HA标记的LAPTM4B的细胞中进行免疫荧光实验。比例尺:20µm。白色虚线框的区域在下面板中放大。

然后我们研究了支持RhoA的LAPMT4B调节的详细机制。Q-PCR实验报告RhoA转录水平没有差异(图。(图3c),3立方厘米),表明LAPTM4B可能反而调节RhoA蛋白的稳定性。接下来,我们用环己酰亚胺处理细胞以抑制蛋白质合成,我们的数据显示RhoA在U2OS细胞中的半衰期约为10小时(图。(图3d三维).

为了进一步分析RhoA降解的关键途径,将U2OS细胞与V-ATP酶抑制剂bafilomycin-A1培养以抑制自噬/溶酶体降解途径,或与MG-132培养以阻止蛋白酶体降解。我们的数据显示,MG-132处理,而不是巴菲菌素-A1处理,可以显著减弱放线菌酮处理的细胞中的蛋白质降解(图。(图3e),第三版),表明蛋白酶体系统是RhoA在U2OS细胞中的主要降解途径,与之前在MLE12细胞中的报道一致[38]. 然后我们研究了RhoA的蛋白酶体降解途径是否受到LAPTM4B的调控,有趣的是,LAPTM4 B的缺失增强了放线菌酮处理细胞中RhoA降解(图。(图3f),第3页)表明LAPTM4B可以通过抑制其蛋白酶体降解来稳定RhoA蛋白。我们通过RhoA抗体免疫沉淀法进一步评估了LAPTM4B对RhoA泛素化的影响,随后测量泛素水平。正如预期的那样,发现LAPTM4B抑制RhoA泛素化(图。(图3g3克).

为了排除细胞特异性效应的可能性,我们接下来利用另一个OS细胞系143B进行进一步实验。LAPTM4B KO 143B细胞中的应力纤维组织发生改变,定量分析表明,LAPTM4 B的下调显著减少了应力纤维数量和细胞面积(补充图。S4a系列). 此外,RhoA以及LIMK和cofilin的磷酸化在LAPTM4B KO 143B细胞中下调(补充图。S4b系列). 重要的是,在143B细胞中,LAPTM4B抑制了RhoA的泛素化水平(补充图。S4c系列). 这些结果表明,LAPTM4B显示了OS细胞中应激纤维的重要调节功能。

接下来我们询问了LAPTM4B是否与RhoA相互作用。为此,我们在HA标记的LAPTM4B稳定表达细胞中通过HA抗体拉下进行免疫沉淀实验,然后通过western blotting测量RhoA水平。我们的结果发现,与对照细胞相比,RhoA在稳定表达的LAPTM4B细胞中显著富集(图。(图3h)。3小时). 免疫荧光实验进一步观察到LAPTM4B和RhoA之间的部分共定位(图。(图3i)。第3页). 我们预计这种相互作用可能是LAPTM4B调节RhoA稳定性功能的潜在机制。

miR-128和miR-137低表达诱导LAPTM4B上调

由于LAPTM4B在OS中的表达显著升高,并在细胞骨架排列中发挥作用,我们接下来研究了支持LAPTM4 B失调的分子机制。由于大多数癌细胞经历基因组不稳定和基因扩增[27],我们检查了CCLE数据库中的拷贝数变化(CNV),发现OS细胞系没有显示增加的LAPTM4B拷贝数(图。(图4a),第4页)LAPTM4B CNV在收集的OS肿瘤样本中与正常对照组织相比没有任何显著变化(图。(图4b4b个).

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miRNAs诱导LAPTM4B的高表达。

CCLE数据库中不同OS细胞系的LAPTM4B拷贝数得分(CNV得分)。b条收集的OS肿瘤组织样本和邻近正常组织样本中的LAPTM4B拷贝数得分。c(c)来自GEO数据库(GSE125645,探针cg22581831)的OS肿瘤组织和对照正常组织中LAPTM4B的甲基化百分比。d日来自CCLE数据库的代表性OS细胞系中LAPTM4B的甲基化百分比。e(电子)EWAS数据中心分析数据得出的组织样本(OS组织和正常对照组织)中LAPTM4B表达与甲基化百分比之间的相关性。(f)通过TargetScan预测靶向LAPTM4B的miRNAs的生物信息学。利用其他生物信息学工具预测靶向LAPTM4B的miRNAs。“1”表示“正预测”,“0”表示“负预测”。小时用指示的miRNA模拟物处理U2OS细胞,转染72 h后,用western blotting检测LAPTM4B蛋白水平。左侧面板:代表性实验。右侧面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“模拟NC”,第页(模拟NC,miR-128模拟)=0.0239,第页(模拟NC,miR-137模拟)=0.0341。用指示的miRNA ASO处理U2OS细胞,转染72 h后,用western blotting检测LAPTM4B蛋白水平。左侧面板:代表性实验。右侧面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“ASO NC”,第页(ASO NC,miR-128 ASO)=0.0457,第页(ASO NC,miR-137 ASO)=0.0386。j个双荧光素酶分析表明miRNAs直接靶向LAPTM4B的3′UTR。左图:用LAPTM4B-3′UTR和不同的miRNA模拟物联合转染细胞,转染后32h,测定相对荧光素酶活性。量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“模拟NC”,第页(模拟NC,miR-128模拟)=0.0374,第页(模拟NC,miR-137模拟)=0.0211,第页(模拟NC,miR-139模拟)=0.0405。右面板:与空载体和不同miRNA模拟物共转染后的相对荧光素酶活性。k个通过q-PCR测定收集的OS手术样本中miR-128、miR-137和LAPTM4B的表达水平。红色代表“OS肿瘤组织”,蓝色代表“邻近正常组织”。左面板:miR-137和LAPTM4B mRNA水平的相关性分析(实线,皮尔逊法,R(右) = − 0.6038,第页 = 0.03656),miR-128和LAPTM4B mRNA水平(虚线,皮尔逊法,R(右) = − 0.1093,第页 = 0.7491). 右图:miR-128和miR-137在OS肿瘤组织(肿瘤)和邻近正常组织(正常)中的表达。对于miR-137,第页(肿瘤,正常)=0.0008。从TCGA数据库和GTEx数据库中获得组织样本(肿瘤组织和正常对照组织)中miR-128、miR-137和LAPTM4B的表达水平。

DNA甲基化是癌症的主要表观遗传调控[29]. 我们分析了来自GEO数据库(GSE125645,GSE161407)和EWAS数据中心的数据,发现与正常对照组织相比,OS肿瘤组织中LAPTM4B甲基化百分比没有显著改变(图。(图4c,4c类,补充图。步骤S5a-c). CCLE数据库进一步支持了这一观点,即在OS细胞系中未发现LAPTM4B启动子区域内有意义的甲基化(图。(图4d)。第4天). 此外,EWAS数据中心的数据分析表明,LAPTM4B的表达与OS肿瘤组织和对照正常组织的甲基化状态没有显著相关性(图。(图4e)。第四版). 这些数据表明,DNA甲基化不太可能诱导OS中LAPTM4B的失调。

由于LAPTM4B的CNV和DNA甲基化状态在OS中未发生改变,我们接下来质疑是否涉及转录后调控,例如miRNA。MiRNAs通过直接结合3'非翻译区(UTR)中的“种子序列”抑制基因表达[33]. 我们对靶向LAPTM4B的潜在miRNAs进行了生物信息学分析。在TargetScan的电子分析中,发现了四个最有潜力的候选者(图。(图4f),第4页)其他生物信息学工具,即DIANAmT、miRanda、miRDB、miRWalk和PICTAR5,同时预测了这些信息(图。(图4g4克).

为了确定这些miRNAs是否下调LAPTM4B的表达,我们用miRNAs-mimics转染细胞,发现miR-128/miR-137-mimices诱导了LAPTM4 B蛋白水平的显著降低(图。(图4h),4小时)接下来,我们用miRNA反义寡核苷酸(ASO)转染细胞,发现miR-128或miR-137的抑制适度增加了LAPTM4B水平(图。(图4i)。第4页). 这些数据表明miR-128和miR-137可以下调LAPTM4B蛋白水平。为了进一步验证miRNA是否直接与LAPTM4B mRNA 3'UTR结合,我们通过与miRNA模拟物共同转染LAPTM4 B 3'UTR-荧光素酶载体进行了双重荧光素素酶检测。我们的数据表明,miR-128、miR-137和miR-139模拟物转染诱导了相对荧光素酶活性的显著降低(图。(图4j),第4节),但与空载体共转染时,荧光素酶活性没有下降(图。(图4j),第4节)表明这些miRNAs直接与LAPTM4B mRNA 3'UTR结合。总之,我们通过western blotting和双荧光素酶分析的实验证实,miR-128和miR-137直接靶向LAPTM4B并调节蛋白表达。

在收集的临床OS样本中,miR-137而非miR-128与LAPTM4B表达呈负相关。此外,OS肿瘤样本中miR-137下调(图。(图4k),4公里),这与之前的报道一致,即miR-137是OS中最下调的miRNA之一[39,40]. 由于我们收集的组织样本数量有限,我们接下来进行了数据挖掘,以从更多样本中探索关系。通过对TCGA和GTEx数据库的联合分析,我们发现miR-137和LAPTM4B之间存在显著的负相关(图。(图4l)。4升). 然而,miR-128与LAPTM4B无明显相关性(图。(图4l4升).

这些数据表明,miRNAs而非DNA CNV或甲基化状态有助于OS中LAPTM4B的上调,靶向LAPTM4 B的miR-137可能参与OS癌症的进展。

miR-137对应力纤维的调节依赖于LAPTM4B

由于miR-128和miR-137直接靶向LAPTM4B并调节其表达,因此我们在此质疑这两种miRNAs是否对应激纤维有任何影响。为此,我们用miRNA模拟物转染细胞,鬼笔环肽染色报告了过表达miR-128和miR-137,但不表达miR-139和miR-590后显著不同的应激纤维模式、细胞面积和横弧数减少(图。5a、b). 然后,我们测量了cofilin和LIMK的磷酸化水平,我们的数据表明miR-128和miR-137的过度表达都降低了磷酸化cofillin的量(图。(图5c)5厘米)和磷酸化LIMK(图。(图5d5天).

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miR-128和miR-137调节应激纤维的排列。

用指示的miRNA模拟物处理U2OS细胞,转染72小时后,用指骨样蛋白染色观察应力纤维。比例尺:50µm。b条量化所示单元格中的单元格面积(上面板)和横弧数(下面板)。量化n个 = 3个实验,n个 > 每组46个细胞。平均值±SEM,数据归一化为“模拟NC”。对于单元格区域,第页(模拟NC,miR-128模拟)=0.0125,第页(模拟NC,miR-137模拟)=0.0341。对于横弧编号,第页(模拟NC,miR-128模拟)=0.0082,第页(模拟NC,miR-137模拟)=0.0114。c(c)通过指示的miRNA模拟物转染的U2OS细胞中cofilin的总蛋白和磷酸化水平(磷酸S3)。转染72小时后收集细胞进行western blotting。左侧面板:代表性实验。右侧面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“模拟NC”,第页(模拟NC,miR-128模拟)=0.0162,第页(模拟NC,miR-137模拟)=0.0243。d日通过指示的miRNA模拟物转染的U2OS细胞中的磷酸化LIMK1/2。左侧面板:代表性实验。右侧面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“模拟NC”,第页(模拟NC,miR-128模拟)=0.0342,第页(模拟NC,miR-137模拟)=0.0224。

一种特定的miRNA能够靶向多种转录物,因此参与调节各种细胞功能[33]. 因此,我们询问这些miRNA对应激纤维的影响是否依赖于LAPTM4B,而不是通过其他靶点。为此,从KO背景中产生了缺乏LAPTM4B的3′UTR的稳定表达LAPTM4B的U2OS细胞。在LAPTM4B稳定表达的细胞中转染miR-128/miR-137模拟物后,我们没有记录到细胞形态和应激纤维模式的任何显著变化(图。6a–c段)表明这些miRNAs调节细胞骨架的功能是通过LAPTM4B介导的。因此,在稳定表达LAPTM4B的U2OS细胞中,miRNAs没有改变cofilin和LIMK的磷酸化水平(图。第6天,第5天).

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miR-137对应力纤维的调节依赖于LAPTM4B。

用所示的miRNA模拟物处理稳定表达的LAPTM4B U2OS细胞,转染后72小时,通过鬼笔肽染色观察应激纤维。比例尺:50µm。b条对所示单元格中的单元格面积(左侧面板)和横弧数(右侧面板)进行量化。量化n个 = 3个实验,n个 > 每组42个细胞。平均值±SEM,数据归一化为“模拟NC”。c(c)用指示的miRNA模拟物转染LAPTM4B稳定表达U2OS细胞,转染72 h后,用抗病毒抗体进行western blotting检测LAPTM4 B水平。上面板:代表性实验。下面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“模拟NC”。d日通过指示的miRNA模拟物转染的稳定表达的U2OS细胞LAPTM4B中cofilin的总蛋白和磷酸化水平(磷酸S3)。上面板:代表性实验。下面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“模拟NC”。e(电子)通过指示的miRNA模拟物转染LAPTM4B稳定表达U2OS细胞,然后通过western blotting检测磷酸化的LIMK1/2。上面板:代表性实验。下面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“模拟NC”。(f)从WT背景稳定表达LAPTM4B的U2OS细胞,对照细胞用模拟NC或miR-137模拟物处理。转染72h后,用指骨蛋白染色观察应力纤维。比例尺:50µm。上面板:代表性图像。下面板:量化所示单元格中的单元格面积和横弧数。量化n个 = 3个实验,n个 > 每组31个细胞。平均值±SEM,数据标准化为“Ctrl(模拟NC)”。从WT背景稳定表达LAPTM4B的U2OS细胞,对照细胞用模拟NC或miR-137模拟物处理。转染72小时后收集细胞进行Western blotting。上面板:代表性实验。下面板:量化n个 = 3个实验,平均值±SEM,数据归一化为“Ctrl(Mimic NC)”。

由于收集的OS样本中miR-137和LAPTM4B之间存在显著的负相关(图。(图4k),4公里)接下来,我们将重点介绍miR-137–LAPTM4B在操作系统过程中的功能角色。为了进一步证实miR-137–LAPTM4B信号轴确实对维持应力纤维至关重要,我们从WT背景中生成了稳定表达LAPTM4 B的U2OS细胞。在对照细胞中,miR-137转染能够诱导失调的应力纤维(图。(图6f),第6页),并且相应地观察到RhoA、p-LIMK和p-cofilin的水平降低(图。(图6g)。6克). 然而,miR-137似乎对稳定表达的LAPTM4B U2OS细胞中的应激纤维组织和相关信号通路没有影响(图。6f,克).

此外,我们从WT背景中生成了稳定表达143B细胞的LAPTM4B。在143B细胞中也可以观察到miR-137–LAPTM4B对应激纤维及其相关分子调节的影响(补充图。S6a、b系列). 这些实验表明,miR-137–LAPTM4B轴通过LIMK-cofilin信号通路对OS细胞中的应力纤维组织具有显著的调节作用。

miR-137通过靶向LAPTM4B抑制OS细胞迁移和肺转移

miR-137是OS中调节最下调的miRNA之一[40]在我们收集的OS肿瘤样本中也观察到了这种情况(图。(图4k)。4公里). 我们和其他人以前的研究表明,LAPTM4B促进各种癌症的细胞迁移和转移[24,41,42]. 我们质疑LAPTM4B在OS细胞中是否显示类似功能。因此,我们通过无标签实时xCELLige测量系统检测了LAPTM4B对OS细胞迁移的影响[43],我们的数据显示LAPTM4B的缺失显著减弱了U2OS和143B细胞的迁移能力(补充图。S7a、b). 先前的研究报道,LAPTM4B通过调节上皮-间充质转化(EMT)促进癌细胞迁移[44],AKT磷酸化[45]基质金属蛋白(MMP)的释放[46]接下来,我们检查了这些分子是否受到OS细胞中LAPTM4B的调节。有趣的是,在LAPTM4B WT和KO OS细胞之间未观察到这些蛋白的显著差异(补充图。S7c公司),提示细胞骨架排列可能是操作系统中LAPTM4B迁移刺激功能的一种新机制。

我们假设miR-137可能通过靶向LAPTM4B抑制细胞迁移和肿瘤转移。为此,我们检测了miR-137模拟转染WT或LAPTM4B稳定表达细胞中的细胞迁移。我们的数据显示,miR-137模拟治疗,而不是模拟NC,显著抑制U2OS细胞的迁移能力。此外,过度表达LAPTM4B而非对照蛋白CD63可以挽救这种表型(图。(图7a)。第7页). 通过伤口愈合实验获得了类似的结果(补充图。S8a、b). 总之,这些数据表明miR-137通过靶向LAPTM4B抑制OS细胞迁移。

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miR-137通过靶向LAPTM4B抑制细胞迁移和肺转移。

使用xCELLigence系统实时无标签测量转染miR-137模拟物或模拟NC的WT、LAPTM4B或CD63稳定表达U2OS细胞的细胞迁移。6 × 104将无血清培养基中的细胞接种在顶部培养箱中,每隔15分钟连续25小时测量细胞迁移指数。对四个独立实验中每组12孔以上的细胞进行分析,平均值±SEM。b条20只小鼠(每组5只)静脉植入143B细胞(WT、CD63稳定表达或LAPTM4B稳定表达),每三天腹腔注射10μmol/kg agomir-137-3p或对照组,连续4周。随后处死小鼠,对器官进行成像,以观察转移结节。箭头:转移性结节。比例尺:1厘米。c(c)肺切片的代表性组织病理学图像。箭头:转移瘤。d日本实验中不同参数的数据分析。左:肺转移结节数,第页(WT_Control,WT_Agomir-137)=0.0375,第页(WT_控制,CD63_Agomir-137)=0.0412;右:不同组小鼠的重量(g)。e(电子)描述操作系统中LAPTM4B功能和机制的示意图。LAPTM4B被miR-137特异性抑制,通过抑制泛素介导的蛋白酶体降解促进RhoA稳定性,稳定的RhoA蛋白随后通过LIMK-cofilin途径促进应激纤维组织。通过这种方式,LAPTM4B刺激细胞迁移和癌症转移。

为了进一步深入了解miR-137–LAPTM4B在肿瘤转移中的作用,我们采用裸鼠异种移植模型。1×10系列6–6 × 106将U2OS细胞或MG-63细胞注入BABL/c雌性裸鼠尾静脉。注射6周后处死小鼠,但未观察到转移结节(补充图。S9a、b). 由于我们无法通过使用U2OS和MG-63细胞获得必要的体内数据,因此我们使用了143B,这是在研究肺转移中报告和使用的[47]. 在本实验中,小鼠首先静脉植入4×106我们的数据表明,与模拟对照组相比,腹腔注射agomir-137-3p的小鼠显示出明显较少的可见转移结节(图。(图7b)。7亿). 有趣的是,在植入稳定表达143B细胞的LAPTM4B的小鼠中,未观察到agomir-137-3p的转移抑制作用,但在植入稳定表示143B细胞CD63的小鼠中仍能观察到该作用(图。(图7b)。7亿). 组织学检查进一步证实转移(图。图7c第7页c)进一步的统计分析表明,miR-137通过靶向LAPTM4B抑制肺转移(图。(图7d7天).

总之,我们的研究确定了LAPTM4B在OS中的高表达和临床相关性。我们确定miR-137靶向LAPTM4B,调节应激纤维组织,进一步抑制OS细胞迁移和肺转移。这些效应由失调的RhoA-LIMK-cofilin信号通路介导。此外,我们发现LAPTM4B通过抑制泛素蛋白酶体降解途径稳定RhoA蛋白(图。(图7e)。第7页). OS患者组织样本和癌症数据库中miR-137和LAPTM4B表达之间的相关性,以及细胞骨架排列、癌细胞迁移和肺转移的调节功能,强调了当前发现的临床意义。

讨论

尽管在过去的几十年里,OS的分子谱已经取得了巨大的进展,但目前的标准治疗方法主要是切除结合化疗。破译OS进展和转移的分子机制是开发靶向治疗和提高患者生存概率的迫切需要。细胞骨架在调节细胞迁移和肿瘤转移中起着至关重要的作用,而肿瘤转移是OS患者死亡的主要原因。在目前的研究中,我们发现LAPTM4B通过RhoA-LIMK-cofilin途径调节应激纤维组织和细胞形态,这可能是OS治疗发展的新靶点。

本研究中一个有趣的发现是LAPTM4B在细胞骨架排列中的非规范功能。据我们所知,这是首次研究溶酶体蛋白LAPTM4B在应激纤维组织中的功能。我们的数据揭示了LAPTM4B抑制RhoA的蛋白酶体降解并促进下游LIMK-cofilin信号传导。免疫沉淀和免疫荧光证实了LAPTM4B和RhoA之间的潜在蛋白相互作用。我们预计这种相互作用可能解释RhoA稳定性的潜在LAPTM4B调节功能。然而,确切的机制和相互作用的基序仍然是开放的,值得进一步研究。本研究提供了一种方案,即溶酶体蛋白可能通过调节某些关键蛋白的蛋白酶体降解或自噬/溶酶体降解参与细胞骨架组织,进而影响细胞运动和最终患者的生存概率。

先前的研究表明,LAPTM4B通过上皮-间充质转化(EMT)促进癌细胞迁移[44],AKT磷酸化[45],以及基质金属蛋白(MMP)的释放[46],我们最近发现LAPTM4B显示部分丝状体分布,通过刺激整合素β1再循环和局部粘附动力学促进癌细胞迁移[24]. 在这项研究中,我们发现了另一种相关的分子机制,LAPTM4B可以通过调节OS中的细胞骨架排列来增强细胞迁移和肿瘤转移。

LAPTM4B在癌症中的表达升高[11,45]. 然而,尽管已经报道了一些转录调控,但其潜在的分子机制尚未被充分理解[48,49]. LAPTM4B基因定位于染色体8q.22.1,该区域含有MYC癌基因,在乳腺癌中扩增[50]和前列腺癌[51],这促使我们调查操作系统中LAPTM4B拷贝数是否增加。令人惊讶的是,操作系统中没有放大LAPTM4B拷贝数。同时,在OS中LAPTM4B启动子区的甲基化状态没有改变。Zhang等人之前的一项研究发现,miR-188下调LAPTM4B并调节前列腺癌的发展[15]. 在本研究中,我们确定miR-137与LAPTM4B 3'UTR结合并下调其表达,为研究癌症中LAPTM4 B的失调提供了新的机制。此外,观察到的OS肿瘤样本中miR-137的低表达,以及体外和体内的功能检测表明,这种miRNA通过控制LAPTM4B的表达在迁移和转移中发挥了工具性调节作用。这些发现可能成为未来OS靶向治疗药物开发的理论基础。

尽管我们来自临床OS患者样本和癌症数据库的数据支持细胞和异种移植模型的发现,但包括PDX模型或转基因小鼠(例如LAPTM4B KO小鼠)在内的其他方法可以保证在未来的研究中阐明LAPTM4 B在骨肉瘤进展中的功能和作用。

补充信息

补充信息(420万,docx)

补充材料和方法(34K,docx)

补充表2(22K,xlsx)

鸣谢

我们感谢Carol Norris博士(赫尔辛基大学)对这份手稿的语言编辑。我们感谢HiLIFE光学显微镜的技术支持。我们承认本研究中使用的所有公共可用数据库,尤其是TARGET数据库、CCLE数据库、基因表达总表以及GTEx和TCGA项目。我们感谢参与研究的所有患者。本研究得到了安徽省自然科学基金(KZ 2108085QC100)、中国国家自然科学基金会(KZ 32100623、ZY 81960488)和芬兰科学院(TB 303771和266092)的支持。

作者贡献

KZ和TB构思了该项目并监督了该研究。RY、DL、JW、ML、HG和JB设计并进行了实验。ZY(姚志宏)、ZY(杨作章)、SY和JC采集临床组织样本。RY、DL和SY进行了H&E和IHC实验。KZ和TB根据所有作者的意见撰写了手稿。

数据可用性

在本研究期间生成的所有数据均可根据合理要求从相应作者处获得。

竞争性利益

作者声明没有相互竞争的利益。

道德认可

获取供体OS肿瘤组织和邻近正常组织,以及以下实验程序经安徽医科大学伦理委员会批准,并按照赫尔辛基宣言的指示执行。所有动物实验均按照动物实验规程进行,并经安徽医科大学伦理委员会批准(日期:2020年3月1日;批准文号:20200490)。

知情同意书

所有捐赠者都提供了在科学研究中使用捐赠者组织的书面同意书。

脚注

出版商备注Springer Nature在公布的地图和机构关联中的管辖权主张方面保持中立。

这些作者贡献均等:严如玉、刘丹。

参与者信息

托马斯·布洛姆,if.iknisleh@molb.samot.

周克诚,nc.ude.umha@gnehcekuohz.

补充信息

在线版本包含补充材料,请访问10.1038/s41389-023-00471-5。

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