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图1

图1。来源:匈牙利罗姆人听力损伤位点异质性和PLS1作为新常染色体显性基因的鉴定。

匈牙利罗姆族已知HI基因的家系和变异。10个分离已知HI基因变异的罗姆人家系图。圆圈表示雌性,正方形表示雄性。填充符号表示HI患者,而清晰符号表示未受影响的患者。基因型显示在每个DNA样本可用的个体下面。星号(*)表示DNA样本经过外显子组测序的家族成员,磅号(#)表示MDS和ADMIXTURE分析中包含的外显子序列数据。6003家系和6008家系(I:1)的HI状态和基因型尚不清楚

Isabelle Schrauwen等人,《欧洲人类遗传学杂志》。2019年6月;27(6):869-878.
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图4

图4。来源:匈牙利罗姆人听力损伤位点异质性和PLS1作为新常染色体显性基因的鉴定。

外加剂分析。结果与K(K) = 显示了5个假设的祖先。每列代表一个人。个人[GJB2型:c.71G>A;p.(Trp24*)]和[曼巴:c.2158-2A>G]变体已标记。为了进行比较,还绘制了五个主要的1000个基因组祖先中每一个的十个随机个体。PJL(旁遮普)被选为SAS的代表,因为西北印度人口在罗姆人的南亚血统构成中起着重要作用[]。人口代码:ROMA:本研究中包括的罗姆人听力障碍家庭成员,AFR:非洲;AMR:混合美国人(拉丁裔);EAS:东亚;欧元:欧洲;SAS:南亚。亚群:CHB:中国北京汉族;GBR:英国人在英格兰和苏格兰;PEL:来自秘鲁利马的秘鲁人;PJL:来自巴基斯坦拉合尔的旁遮普语;YRI:尼日利亚伊巴丹的约鲁巴

Isabelle Schrauwen等人,《欧洲人类遗传学杂志》。2019年6月;27(6):869-878.
三。
图2

图2。来源:匈牙利罗姆人听力障碍基因座的异质性和PLS1作为一种新的常染色体显性基因的鉴定。

6012家族分离出一个常染色体显性变异PLS1(PLS1).6012家系系谱图PLS1(PLS1)该变体适用于那些有可用DNA样本的家庭成员。圆圈表示女性,正方形表示男性。填充符号表示患有HI的个体,而清除符号表示未受影响的个体。星号(*)表示其DNA样本经过外显子组测序的家族成员,磅号(#)表示MDS分析中包含的外显子序列数据。父亲方面没有HI家族史。b6012名受累家庭成员的右空气(O)和骨骼([)传导,以及左耳空气(x)和骨骼传导。二: 2:年龄34岁;三: 1:年龄8岁;三: 2:11岁c(c)PLS1的三维表示。残留物用棒状模型表示。p.(Leu363)的变体位置以红色突出显示。d日放大野生型(左)和突变型(右)PLS1蛋白363位的疏水相互作用。e(电子)带有变异体p(Leu363Phe)的PLS1蛋白的结构域表明

Isabelle Schrauwen等人,《欧洲人类遗传学杂志》。2019年6月;27(6):869-878.
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图3

图3。来源:匈牙利罗姆人听力损伤位点异质性和PLS1作为新常染色体显性基因的鉴定。

多维标度分析。此图显示了前两个MDS组件。表中HI基因变异的样本标记在右侧缩放插页中。人口代码:ROMA:本研究中包括的罗姆人听力障碍家庭成员,AFR:非洲;AMR:美国移民(拉丁裔);EAS:东亚;欧元:欧洲;SAS:南亚。亚群:ACB:巴巴多斯的非洲加勒比;ASW:美国西南部非洲裔美国人;BEB:孟加拉语,来自孟加拉国;CDX:中国西双版纳傣族;CEU:具有北欧和西欧血统的犹他州居民(CEPH);CHB:中国北京的汉族;CHS:南方汉族;CLM:哥伦比亚麦德林的哥伦比亚人;ESN:尼日利亚的Esan;FIN:芬兰芬兰语;GBR:英国人在英格兰和苏格兰;GIH:来自休斯顿的古吉拉特邦印第安人;GWD:冈比亚西部地区的冈比亚人;德克萨斯州;IBS:西班牙的伊比利亚人口;国际电联:来自英国的印度泰卢固语;JPT:日本东京的日语;KHV:Kinh在越南胡志明市;LWK:肯尼亚韦布耶的卢哈亚;MSL:塞拉利昂门德;MXL:来自美国洛杉矶的墨西哥祖先;PEL:来自秘鲁利马的秘鲁人;PJL:来自巴基斯坦拉合尔的旁遮普语;PUR:来自波多黎各的波多黎各人;STU:来自英国的斯里兰卡泰米尔人;TSI:意大利托斯卡尼;YRI:尼日利亚伊巴丹的约鲁巴

Isabelle Schrauwen等人,《欧洲人类遗传学杂志》。2019年6月;27(6):869-878.

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