(一)使用软件工具Multalign对包含人类COL4A6蛋白的甘氨酸-591和其他物种的同源蛋白的80个氨基酸进行多序列比对(http://multalin.toulouse.inra.fr/multalin网站/). 甘氨酸-591是完全保守的(黑色垂直条;注意,由于其他物种COL4A6中的插入,氨基酸591在排列中移动了19个位置到610;红色字母:高一致性,蓝色:低一致性,黑色:中性)。(b条)野生型COL4A6(上部)与Gly591Ser变体(下部)的结构比较。左下图显示了沿COL4A6氨基酸序列的估计熔化温度(摄氏度)。相应的突变位点用箭头高亮显示。Gly591Ser突变严重影响自然模型的熔化温度。在三维模型(右侧子图)中,COL4A6链显示为蓝色,而白色丝带是异三方结构中相应的COL4A5链。原子和键被涂成红色,以防它们与其他螺旋的原子发生碰撞或发生不利接触(范德瓦尔斯重叠>0.6º)。碰撞原子的配对用黄线表示。在野生型COL4A6的591位,Gly完全没有侧链,并且生成了三条链的无碰撞构象。相比之下,Ser的突变在相同位置产生非典型的大侧链结构。在三螺旋胶原蛋白结构模型中,该侧链有几个硬碰撞,降低了链间构象的稳定性,并可能触发四级结构的破坏。