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杂交研究中使用的物种或亚种特异性DNA（包括互补DNA；保守基因、全染色体或全基因组），用于鉴定微生物、测量DNA-DNA同源性、将亚种分组等。DNA探针与特定的mRNA杂交（如果存在）。用于检测杂交产物的传统技术包括斑点杂交分析、Southern杂交分析和DNA:RNA杂交特异性抗体测试。DNA探针的常规标记包括放射性同位素标记32P和125I以及化学标记生物素。使用DNA探针为诊断感染提供了一种特异、敏感、快速和廉价的细胞培养技术替代品。

引入年份：1989

DNA探针用于人乳头瘤病毒的特异性鉴定。

引入年份：1991年（1989年）

DNA探针特定于人类白细胞抗原基因，它代表了人类主要的组织相容性决定因素。这四个已知基因座被指定为A、B、C和D。特定抗原通过基因座标记和编号进行识别，例如HLA-A11。某些HLA等位基因的遗传与某些疾病（如胰岛素依赖型糖尿病）的风险增加有关。

引入年份：1991年（1989年）