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与RNA或DNA中的互补序列杂交的RNA分子改变了后者的功能。内源性反义RNA通过多种机制调节基因表达。合成反义RNA用于影响特定基因的功能，以用于研究或治疗目的。

引入年份：1991年

小的双链非蛋白编码RNA，长度为21-25个核苷酸，由同一核糖核酸酶III（Dicer）的单链microRNA基因转录物生成，产生小干扰RNA（RNA，Small interfering）。它们成为RNA-诱导沉默复合物的一部分，并通过结合同源3'UTR区域作为不完全匹配抑制目标RNA的翻译（翻译，遗传）。秀丽线虫的小时间RNA（stRNAs）let-7和lin-4是最早发现的2个miRNAs，来自一类参与发育时间的miRNAs。

引入年份：2003

RNA的短片段，用于改变其杂交的靶RNA或DNA的功能。

引入年份：1999年