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与DNA结合的蛋白质。该家族包括与双链和单链DNA结合的蛋白质，还包括特异性的DNA结合蛋白血清中可作为恶性疾病的标志物。

引入年份：1984年

最初通过结合DNA序列CCAAT的能力鉴定的一类蛋白质。典型的CCAAT增强子结合蛋白形成二聚体，由一个激活域、一个DNA结合碱性区和一个富含亮氨酸的二聚体域（亮氨酸ZIPPERS）组成。CCAAT-结合因子是一种结构独特的CCAAT增强子结合蛋白，由三个不同亚基组成的三聚体组成。

引入年份：2001

与REL原癌基因蛋白结合并调节其活性的抑制蛋白家族。在细胞质中，I-κB蛋白与转录因子NF-kappa B结合。细胞刺激导致活性NF-κB的分离和转运到细胞核。

引入年份：2006（2000）

同源异型盒基因（genes，homeobox）编码的蛋白质，与某些原核和真核生物具有结构相似性DNA结合蛋白Homeodomain蛋白在形态发生和发育过程中参与基因表达的控制（基因表达调节，发育）。

引入年份：1995年

手机DNA结合蛋白由c-jun基因编码（基因，jun）。它们参与生长相关的转录控制。似乎有三种不同的功能：二聚化（与c-fos）、DNA结合和转录激活。癌基因转化可以通过c-jun的组成性表达进行。

引入年份：1992年

不直接结合DNA的阻遏蛋白的一个亚类。相反，共同阻遏物通常通过与DNA结合蛋白如转录沉默因子或核受体。

引入年份：2010年

有翼螺旋的一个亚类DNA结合蛋白与其创始成员叉头蛋白果蝇有相同的同源性。

引入年份：2006（1989）

最初确定为位点特异性的转录因子DNA结合蛋白对腺病毒DNA复制至关重要。它们在乳腺功能和发育中起着重要作用。

引入年份：2006（1984）

一个家族DNA结合蛋白主要在T淋巴细胞中表达。它们与βCATENIN相互作用，在多种发育过程中充当转录激活剂和阻遏剂。

引入年份：2006

一个家族DNA结合蛋白其羧基末端含有三个锌指。它们是对GC盒具有特异性的转录因子。

引入年份：2006

激活转录因子最初被鉴定为DNA结合蛋白与腺病毒早期启动子相互作用。它们是一个基本亮氨酸拉链转录因子家族，与环腺苷酸反应元件的一致位点TGACGTCA结合，并与环腺苷酸反应DNA结合蛋白密切相关。

引入年份：2006

HELIX-TURN-HELIX的一个亚科DNA结合蛋白包含与HTH图案相邻的可变长度循环。该环连接两条反平行链，与DNA结合时形成一个翅膀。

引入年份：2006

一个家族DNA结合蛋白在细胞分化和凋亡期间调节多种基因的表达。家族成员包含一个高度保守的羧基末端碱性螺旋-螺旋-螺旋基序，参与二聚化和序列特异性DNA结合。

引入年份：2006（1987）

一种鉴定体内与感兴趣的蛋白质结合的特定DNA序列的技术。它涉及染色质的甲醛固定，以交联DNA结合蛋白DNA。将DNA剪切成小片段后，用蛋白特异性抗体通过免疫沉淀分离出特定的DNA-蛋白复合物。然后，从复合物中分离出的DNA可以通过PCR扩增和测序进行鉴定。

引入年份：2005年

细菌噬菌体用来将其DNA结合到宿主细菌DNA中的细菌蛋白质DNA结合蛋白它在基因重组以及转录和翻译调控中发挥作用。

引入年份：2003

HMG-box超家族蛋白质中存在的DNA结合域，包括原型HMGB蛋白质、一些序列特异性转录因子和其他DNA结合蛋白结构域由70-80个氨基酸组成，这些氨基酸从三个字母片段形成L形折叠。该结构域具有识别和/或诱导特定DNA结构的能力，并影响DNA对参与转录、重组或DNA修复的其他蛋白质的可及性。（请注意，并非所有高迁移率组蛋白都包含此结构域。）

引入年份：2002

通过各种核酸酶消化非相互作用的核酸，测量特定核酸与另一核酸或蛋白质相互作用的技术。在通过核酸酶消化消除所有非相互作用区域后，对残留的受保护核酸进行分析。DNA指纹利用这项技术分析DNA结合蛋白.

引入年份：2001

手机DNA结合蛋白由myb基因编码（基因，myb）。它们在包括胸腺细胞和淋巴细胞在内的多种细胞中表达，并调节细胞分化。myb的过度表达与自身免疫性疾病和恶性肿瘤相关。

引入年份：2000

手机DNA结合蛋白由sis基因编码（GENES，sis）。c-sis蛋白构成血小板衍生生长因子的B链。c-sis的过度表达导致肿瘤发生。

引入年份：2000

手机DNA结合蛋白由rel基因（基因，rel）编码。它们主要在造血细胞中表达，可能在淋巴细胞分化中发挥作用。Rel经常与其他相关蛋白（NF-KAPPA B、I-KAPPA B、relA）结合，形成调节转录的异二聚体。c-rel的重新排列或过度表达可导致肿瘤发生。

引入年份：2000