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最后1L类LAS1核糖体生物生成因子[智人（人类）]

基因ID:81887，更新于2024年6月17日

总结

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官方符号
最后1L由提供HGNC公司
官方全名
类LAS1核糖体生物生成因子由提供HGNC公司
主要来源
HGNC:HGNC:25726
请参阅相关
乐团：ENSG0000001497 MIM:300964； 联盟基因组：HGNC:25726
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
智人
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；灵长类；Haplorrhini公司；卡塔里尼；人科；人类
也称为
WTS；Las1；MRXSWTS；类Las1；dJ475B7.2型
总结
启用RNA结合活性。预测参与5.8S rRNA成熟和LSU-rRNA成熟。位于膜中。MLL1综合体的一部分。与Wilson-Turner综合征有关。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
表达式
睾丸（RPKM 11.3）、大脑（RPKM8.2）和25个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源
鼠标 全部的
新款
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基因组背景

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参见中的LAS1L基因组数据查看器
位置：
许继12
外显子计数：
16
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) X（X） NC_000023.11（65512582.65534787，补码）
RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(合同通用条款第009914755.1条) X（X） NC_060947.1（63939027..63961232，补码）
105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) X（X） NC_000023.10（64732462..64754667，补码）

染色体X-NC_000023.11描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene zinc finger CCCH-type containing 12B Neighboring gene NANOG hESC enhancer GRCh37_chrX:64658617-64659137 Neighboring gene OCT4-NANOG-H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chrX:64683306-64683834 Neighboring gene TLE family member 1 pseudogene 1 Neighboring gene OCT4-NANOG hESC enhancer GRCh37_chrX:64713210-64713789 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chrX:64722192-64722692 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chrX:64722693-64723193 Neighboring gene AP1M2 pseudogene 1 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 29713 Neighboring gene FERM domain containing 8 pseudogene 1 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 29714 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 20881 Neighboring gene moesin Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 20882 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 29715 Neighboring gene ReSE screen-validated silencer GRCh37_chrX:64924017-64924189 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 29716 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 13592

基因组区域、转录物和产物

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表达式

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  • 项目名称：HPA RNA-seq正常组织
  • 描述：对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq，以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
  • 生物项目：项目编号：4337
  • 出版物：项目管理标识号24309898
  • 分析日期：2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

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PubMed中的相关文章

  1. Las1L是细胞增殖和核糖体生物生成所需的核仁蛋白。 Castle光盘，等《分子细胞生物学》，2010年9月，PMID 20647540，免费PMC文章
  2. 抑制β-catenin使三阴性乳腺癌的核仁功能丧失。 SE周，等细胞死亡疾病，2021年3月4日。PMID 33664239，免费PMC文章
  3. 微管蛋白酪氨酸连接酶样家族成员4聚谷氨酰胺酶参与胰腺癌细胞中PELP1聚谷氨酰胺化和染色质重塑。 Kashiwaya K，等《癌症研究》，2010年5月15日。PMID 20442285号
  4. LAS1L与哺乳动物Rix1复合物相互作用以调节核糖体的生物发生。 Castle CD、，等《分子生物细胞》，2012年2月，PMID 22190735，免费PMC文章
  5. SARS-CoV-2先导和NSP1的关键特征是病毒逃避NSP1介导的抑制所必需的。 布加尼语L，等.RNA，2022年5月。PMID 35232816，免费PMC文章

查看PubMed中的所有（117）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？
  1. 抑制β-catenin使三阴性乳腺癌的核仁功能丧失。
    标题：抑制β-catenin使三阴性乳腺癌的核仁功能失效。
  2. 蛋白复合物5FMC向锌指转录因子Zbp-89的招募影响其sumoylation状态和反式激活潜能。[5FMC]
    标题：蛋白质-精氨酸-甲基转移酶[prmt]-1（chtop）甲基化染色质靶点的五位朋友，精氨酸甲基化与去甲酰化之间的复合物。
  3. LAS1L与PELP1、TEX10和WDR18（芽殖酵母Rix1复合物的哺乳动物同源物）以及NOL9和SENP3相互作用，形成一种新的核仁复合物，与60S前核糖体亚单位共分馏。
    标题：LAS1L与哺乳动物Rix1复合物相互作用以调节核糖体的生物发生。
  4. 对高分子量RNA的分析证实，Las1L是ITS2处理所必需的，它将5.8S和25S/28S rRNAs分开，因为发现32S积累，12S在Las1L耗尽后减少。
    标题：ITS2两端的前rRNA处理需要进化上保守的蛋白质Las1。
  5. 数据表明，Las1L对60S核糖体亚基的细胞增殖和生物生成至关重要。
    标题：Las1L是细胞增殖和核糖体生物生成所需的核仁蛋白。
提交： 新GenerRIF 更正

表型

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在NIH基因检测注册中心（GTR）查找该基因的测试

使用PheGenI回顾该区域的eQTL和表型关联数据

相关条件

说明 测验
威尔逊-特纳综合征
MedGen公司：1839736元 OMIM公司：309585 基因评论：无法使用的
比较实验室

变更

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参见ClinVar中的变量

参见dbVar中的研究和变体

参见变体查看器（GRCh37.p13）

参见变体查看器（GRCh38）

基因型

PubChem的途径

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相互作用

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产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 说明

一般基因信息

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标记

同源性

克隆名称

  • FLJ12525、FLJ30133、FLJ45274

基因本体论 GOA提供

功能 证据代码 酒吧
启用RNA结合 HDA公司 公共医学 
启用内切酶活性 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
过程 证据代码 酒吧
参与5.8S rRNA的成熟 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
参与LSU-rRNA的成熟 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
参与rRNA处理 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
组件 证据代码 酒吧
Las1复合体的一部分 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
MLL1复合体的一部分 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
  
位于膜内 HDA公司 公共医学 
核仁定位 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
核质定位 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
  
前核糖体的一部分，大亚单位前体 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  

一般蛋白质信息

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首选名称
核糖体生物发生蛋白LAS1L
姓名
内核糖核酸酶LAS1L
蛋白LAS1同源物

NCBI参考序列（RefSeq）

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新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组学

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

基因组学

  1. NG_016369.1参考序列基因

    范围
    5020..27225
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. NM_001170649.2号→NP_001164120.1核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型2

    参见NP_001164120.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    说明
    转录变异体：与变异体1相比，该变异体（2）在编码区的中部缺少一个交替的框内外显子。这导致与亚型1相比，蛋白质（亚型2）更短。
    源序列
    AF116730，DA619280
    共识CDS
    CCDS55434.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V3Q3型
    相关的
    ENSP0000363940.5号,ENST00000374807.9
    保守领域（1）总结
    4月31日
    位置：43→187
    Las1；类Las1

  2. NM_001170650.2→NP_001164121.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型3

    参见NP_001164121.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    说明
    转录变体：与变体1相比，该变体（3）在编码区中缺少两个交替的框架内外显子。这导致与亚型1相比，蛋白质（亚型3）更短。
    源序列
    AF116730，DA619280
    共识CDS
    CCDS55433.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V4E5型
    相关的
    ENSP0000363937.5号,ENST00000374804.9标准
    保守领域（1）总结
    pfam04031型
    位置：43→145
    Las1；类Las1

  3. NM_001375328.1→NP_001362257.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型4

    状态：已验证

    源序列
    AL050306号
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V3Q3型
    保守领域（1）总结
    pfam04031型
    位置：43→187
    Las1；类Las1

  4. NM_001375329.1→NP_001362258.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型5

    状态：已验证

    源序列
    AL050306号
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型
    保守领域（1）总结
    pfam04031型
    位置：43→187
    Las1；类Las1

  5. NM_001375330.1→NP_001362259.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L同种型6

    状态：已验证

    源序列
    AL050306号
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型
    保守领域（1）总结
    4月31日
    位置：43→187
    Las1；类Las1

  6. NM_001375331.1号→NP_001362260.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型7

    状态：已验证

    源序列
    AL050306号
    共识CDS
    CCDS94620.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V3R6型,A0A7I2V5R7型
    相关的
    ENSP0000503577.1标准,ENST00000676986.1号
    保守领域（1）总结
    pfam04031型
    位置：43→187
    Las1；类Las1

  7. NM_001375332.1→NP_001362261.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型8

    状态：已验证

    源序列
    AL050306号

  8. NM_001375333.1→NP_001362262.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型9

    状态：已验证

    源序列
    AL050306号
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V3Q3
    相关的
    ENSP0000503410.1标准,ENST00000677969.1标准
    保守领域（1）总结
    pfam04031型
    位置：43→187
    Las1；类Las1

  9. NM_001375334.1→NP_001362263.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型10

    状态：已验证

    源序列
    AL050306号
    共识CDS
    CCDS94622.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型,A0A7I2V653型
    相关的
    ENSP0000504653.1标准,ENST00000678956.1号机组
    保守领域（1）总结
    4月31日
    位置：43→187
    Las1；类Las1

  10. NM_001375335.1→NP_001362264.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型10

    状态：已验证

    源序列
    AL050306号
    共识CDS
    CCDS94622.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型,A0A7I2V653型
    保守领域（1）总结
    pfam04031型
    位置：43→187
    Las1；类Las1

  11. NM_001375336.1号→NP_001362265.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型11

    状态：已验证

    源序列
    AL050306号
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型
    保守领域（1）总结
    pfam04031型
    位置：43→187
    Las1；类Las1

  12. 纳米_001375337.1→NP_001362266.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型11

    状态：已验证

    源序列
    AL050306号
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型
    保守领域（1）总结
    pfam04031型
    位置：43→187
    Las1；类Las1

  13. NM_001410733.1号→NP_001397662.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型12

    状态：已验证

    源序列
    AL050306号
    共识CDS
    CCDS94621.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型,一年一次
    相关的
    ENSP0000503795.1标准,ENST00000678823.1号机组

  14. 纳米_031206.7→NP_112483.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型1

    参见NP_112483.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    说明
    转录变体：这个变体（1）代表最长的转录，编码最长的亚型（1）。
    源序列
    AF116730，DA619280
    共识CDS
    CCDS14381.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    A9X410型,Q5JXQ0型,问题8TEN5,Q9H9V5型,Q9Y4W2型
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V4E5型
    相关的
    ENSP0000363944.3号,ENST00000374811.8号机组
    保守领域（1）总结
    pfam04031型
    位置：43→187
    Las1；类Las1

核糖核酸

  1. 164681.1尼泊尔卢比RNA序列

    状态：已验证

    源序列
    AL050306号

注释基因组的参考序列：GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCh38.p14一次组件

基因组学

  1. NC_000023.11参考GRCh38.p14初级组件

    范围
    65512582..65534787补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. XM_011531045.3分→XP_011529347.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X1

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V4E5型
    保守领域（1）总结
    pfam04031型
    位置：43→145
    Las1；类Las1

  2. XM_047442542.1号→XP_047298498.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X8

  3. XM_047442537.1号→XP_047298493.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X2

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型

  4. 圣诞节_047442540.1→XP_047298496.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X6

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7

  5. XM_047442539.1号→XP_047298495.1型核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X5

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型

  6. XM_047442541.1号→XP_047298497.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X7

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型
    保守领域（1）总结
    pfam04031型
    位置：43→187
    Las1；类Las1

  7. XM_011531046.3号→XP_011529348.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X3

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型
    保守领域（1）总结
    pfam04031型
    位置：43→187
    Las1；类Las1

  8. XM_047442538.1号→XP_047298494.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L异构体X4

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型,A0A7I2V653型
    保守领域（1）总结
    pfam04031型
    位置：43→187
    Las1；类Las1

核糖核酸

  1. XR_007068201.1号RNA序列

  2. XR_938412.3号RNA序列

备选T2T-CHM13v2.0

基因组学

  1. NC_060947.1替代T2T-CHM13v2.0

    范围
    63939027..63961232补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. XM_054327919.1号→XP_054183894.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X1

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V4E5型

  2. 圣诞节_054327926.1→XP_054183901.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X8

  3. 圣诞节_054327920.1→XP_054183895.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X2

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型

  4. XM_054327924.1号→XP_054183899.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X6

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型

  5. XM_054327923.1号→XP_054183898.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X5

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型

  6. XM_054327925.1号→XP_054183900.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X7

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型

  7. XM_054327921.1号→XP_054183896.1号核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X3

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型

  8. XM_054327922.1号→费用_054183897.1核糖体生物发生蛋白LAS1L亚型X4

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A7I2V5R7型,A0A7I2V653型

核糖核酸

  1. XR_008485509.1号RNA序列

  2. XR_008485508.1号RNA序列

核苷酸 蛋白质
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
Q9Y4W2.2型 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q9Y4W2

基因链接输出

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