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Czib公司含锌结合蛋白的CXXC基序[小家鼠(家鼠)]

基因ID:74098,更新日期2024年3月5日

总结

官方符号
Czib公司由提供MGI公司
官方全名
含锌结合蛋白的CXXC基序由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:1921348
请参阅相关
乐团:ENSMUSG00000028608 联盟基因组:MGI:1921348
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
也称为
0610037L13Rik;1110008H16瑞克
总结
预计可启用锌离子结合活性。与人类CZIB同源(CXXC基序包含锌结合蛋白)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
在成人膀胱(RPKM 22.6)、肢体E14.5(RPKM 18.0)和其他28种组织中普遍表达查看更多
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单

基因组背景

请参阅中的Czib基因组数据查看器
地点:
4 C7;4 50.18立方厘米
外显子计数:
9
注释发布 状态 装配 氯代甲烷 位置
RS_2024_02号 现在的 GRC立方米39(GCF_000001635.27号) 4 NC_000070.7(107746982..107755000)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 4 NC_000070.6(107889785.107897803)

染色体4-NC_000070.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor, opposite strand 2 Neighboring gene low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E4643 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E1649 Neighboring gene mago homolog, exon junction complex core component Neighboring gene carnitine palmitoyltransferase 2 Neighboring gene predicted gene, 40221

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:邮编25409824
  • 分析日期:无

互动

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般蛋白质信息

首选名称
含锌结合蛋白的CXXC基序
姓名
UPF0587蛋白C1orf123同源物

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单

独立于注释维护的参考序列基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此它们的版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001347160.1NP_001334089.1号含锌结合蛋白亚型2的CXXC基序

    状态:已验证

    描述
    转录变体:与变体1相比,该变体(2)在5'UTR和编码序列上有所不同。与亚型1相比,得到的亚型(2)具有较短且独特的N末端。
    源序列
    AL611936型
    共识CDS
    CCDS84769.1号
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    A2A8E3型A2A8E5型问题8BHG2第8季度第7季度6第9季度第1季度问题9DCH5
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A2A8E2型
    相关的
    ENSMUSP00000114234.2号ENSMUST00000135454.8号
    保守领域(1)总结
    pfam05907型
    地点:6157
    DUF866;功能未知的真核蛋白(DUF866)
  2. NM_028754.2号NP_083030.1号含锌结合蛋白亚型1的CXXC基序

    参见NP_083030.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    转录变体:该变体(1)代表较长的转录,编码较长的亚型(1)。
    源序列
    AL611936型
    共识CDS
    CCDS18442.1号机组
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    问题8BHG2
    相关的
    ENSMUSP00000119565.2ENSMUST00000125107.8号
    保守领域(1)总结
    pfam05907型
    地点:42193
    DUF866;功能未知的真核蛋白(DUF866)

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000070.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    107746982..107755000
    下载
    GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. XM_030253839.1号XP_030109699.1号CXXC基序包含锌结合蛋白亚型X3

    UniProtKB/TrEMBL公司
    B7ZC72型
    相关的
    ENSMUSP00000102338.4ENSMUST00000106727.10
    保守领域(1)总结
    pfam05907型
    地点:8136
    DUF866;功能未知的真核蛋白(DUF866)
  2. XM_036164493.1号XP_036020386.1号含锌结合蛋白亚型X5的CXXC基序

    保守领域(1)总结
    pfam05907型
    地点:108
    DUF866;功能未知的真核蛋白(DUF866)
  3. XM_006503440.4号XP_006503503.1型含锌结合蛋白亚型X4的CXXC基序

    保守领域(1)总结
    pfam05907型
    地点:4128
    DUF866;功能未知的真核蛋白(DUF866)
  4. XM_006503437.4号XP_006503500.1型CXXC基序包含锌结合蛋白亚型X1

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A2A8E2型
    保守领域(1)总结
    pfam05907型
    地点:9157
    DUF866;功能未知的真核蛋白(DUF866)
  5. XM_006503439.3号XP_006503502.1型CXXC基序包含锌结合蛋白亚型X2

    UniProtKB/TrEMBL公司
    B7ZC72型
    保守领域(1)总结
    pfam05907型
    地点:9137
    DUF866;功能未知的真核蛋白(DUF866)