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温度25跨膜蛋白25[小家鼠（家鼠）]

基因ID:71687，更新日期2024年3月5日

总结

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官方符号
温度25由提供管理信息
官方全名
跨膜蛋白25由提供管理信息
主要来源
MGI:MGI:1918937
参见相关内容
乐团：ENSMUSG00000002032 联盟基因组：MGI:1918937
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；肌形态；鼠形目；鼠科；穆里奈；穆斯；穆斯
也称为
0610039J01瑞克
总结
参与兴奋性突触后电位的负调节和蛋白质稳定性的调节。位于晚期内体和溶酶体中。在枕基骨中表达；眶蝶；颞骨岩部。与人类TMEM25（跨膜蛋白25）同源。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
表达式
在成人小脑（RPKM 44.3）、成人肝脏（RPKM27.1）和17个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源
人类 全部的
新的
尝试新的基因表
尝试新的成绩单

基因组背景

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参见中的Tmem25基因组数据查看器
位置：
9 A5.2；9 24.84立方厘米
外显子计数：
8
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 9 NC_000075.7（44705069..44710821，补码）
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 9 NC_000075.6（44793772..44799524，补体）

染色体9-NC_000075.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene archain 1 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E9756 Neighboring gene intraflagellar transport 46 Neighboring gene tetratricopeptide repeat domain 36 Neighboring gene lysine (K)-specific methyltransferase 2A Neighboring gene predicted gene, 39326 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E6728 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_23986 Neighboring gene predicted gene, 30883

基因组区域、转录物和产物

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表达式

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  • 项目名称：小鼠ENCODE转录组数据
  • 描述：鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目：PRJNA66167型
  • 出版物：PMID 25409824
  • 分析日期：无

参考文献

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PubMed中的相关文章

  1. TMEM25在基础状态下抑制单体EGFR-介导的STAT3激活，以抑制三阴性乳腺癌的进展。 毕J，等《国家通讯》，2023年4月24日。PMID 37095176，免费PMC文章
  2. 电子版中人类TMEM25和小鼠TMEM25基因的鉴定和表征。 加藤M，等Oncol Rep，2004年8月PMID 15254712
  3. TMEM25调节神经元兴奋性和NMDA受体亚单位NR2B降解。 张赫，等《临床投资杂志》，2019年9月3日。PMID 31424425，免费PMC文章
  4. 使用15000只小鼠发育cDNA微阵列对中期妊娠胎盘和胚胎进行全基因组表达谱分析。 田中TS，等美国国家科学院院刊，2000年8月1日。PMID 10922068，免费PMC文章
  5. 归一化和减法：促进基因发现的两种方法。 博纳尔多MF，等《基因组研究》，1996年9月，PMID 8889548

查看PubMed中的所有（16）条引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？
  1. TMEM25在基础状态下抑制单体EGFR-介导的STAT3激活，以抑制三阴性乳腺癌的进展。
    标题：TMEM25在基础状态下抑制单体EGFR-介导的STAT3激活，以抑制三阴性乳腺癌进展。
  2. 这些结果为TMEM25在大脑中的生物学以及TMEM25与癫痫之间的功能关系提供了一些见解。
    标题：TMEM25调节神经元兴奋性和NMDA受体亚单位NR2B降解。
提交： 新GenerRIF 更正

一般基因信息

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标记

同源性

基因本体论 由MGI提供

功能 证据代码 酒吧
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
过程 证据代码 酒吧
参与兴奋性突触后电位的负调控 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
参与兴奋性突触后电位的负调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与蛋白质稳定性的调节 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
组件 证据代码 酒吧
定位于内体 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
位于细胞外区域 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
位于晚期内体 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
位于溶酶体中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
定位膜 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
定位于质膜 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  

一般蛋白质信息

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首选名称
跨膜蛋白25

NCBI参考序列（参考序列）

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新的 尝试新的成绩单

独立于注释维护的参考序列基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001357383.1→NP_001344312.1号跨膜蛋白25亚型a

    状态：已验证

    描述
    转录变体：该变体（1）编码最长的亚型（a）。
    源序列
    AC142113型
    UniProtKB/TrEMBL公司
    第3季度第4季度
    保守领域（1）总结
    第11960条
    位置：51→142
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  2. NM_001357384.1→NP_001344313.1号跨膜蛋白25亚型b前体

    状态：已验证

    描述
    转录变体：与变体1相比，该变体（3）在5’UTR和编码序列上有所不同。与同种型a相比，得到的同种型（b）在N末端更短。变体2、3和4都编码相同的同种型（b）。
    源序列
    AC142113型
    共识CDS
    CCDS23120.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第3季度MP3,Q6PAK7问题,问题9DCF1
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3U4J4型
    保守领域（2）总结
    cd00096
    位置：30→34
    免疫球蛋白；Ig链A'[结构基序]
    第11960条
    位置：27→118
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  3. NM_001357385.1→NP_001344314.1号跨膜蛋白25亚型b前体

    状态：已验证

    描述
    转录变体：与变体1相比，该变体（4）在5’UTR和编码序列上有所不同。与亚型a相比，生成的亚型（b）在N末端较短。变体2、3和4都编码相同的亚型。
    源序列
    AC142113型
    共识CDS
    CCDS23120.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第三季度第三季度,Q6PAK7问题,问题9DCF1
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3U4J4型
    保守领域（2）总结
    cd00096
    位置：30→34
    免疫球蛋白；Ig链A'[结构基序]
    第11960条
    位置：27→118
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  4. 纳米_001357386.1→NP_001344315.1跨膜蛋白25亚型c前体

    状态：已验证

    描述
    转录变体：该变体（5）在5’UTR和编码序列上不同，与变体1相比，缺少一个交替的框架内外显子。产生的亚型（c）在N末端较短，与亚型a相比，缺少交替的内部片段。
    源序列
    AC142113、AK090375、AW457301
    共识CDS
    CCDS90554.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A1N9MYB8系列
    相关的
    ENSMUSP00000110353.3,ENSMUST00000114705.9
    保守领域（2）总结
    cd00096
    位置：30→34
    Ig；Ig链A'[结构基序]
    第11960条
    位置：27→118
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  5. NM_027865.3号→NP_082141.1号跨膜蛋白25亚型b前体

    参见NP_082141.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    描述
    转录变体：与变体1相比，该变体（2）在5'UTR和编码序列上有所不同。与亚型a相比，生成的亚型（b）在N末端较短。变体2、3和4都编码相同的亚型。
    源序列
    AK165199，AW457301
    共识CDS
    CCDS23120.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第三季度第三季度,Q6PAK7问题,问题9DCF1
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3U4J4型
    相关的
    ENSMUSP00000002100.8号,ENSMUST00000002100.8
    保守领域（2）总结
    cd00096
    位置：30→34
    免疫球蛋白；Ig链A'[结构基序]
    第11960条
    位置：27→118
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

核糖核酸

  1. 编号：151678.1RNA序列

    状态：已验证

    描述
    转录变异体：与变异体1相比，该变异体（6）在5'端不同，并且缺乏替代的内部外显子。这种变体被表示为非编码，因为使用5’-最预期的翻译起始密码子会使转录物成为非传感介导的mRNA衰变（NMD）的候选者。
    源序列
    AC142113型

  2. 151679.1尼泊尔卢比RNA序列

    状态：已验证

    描述
    转录变体：该变体（7）在5'端不同，与变体1相比，缺少替代的内部外显子。这种变体被表示为非编码，因为使用5’-最预期的翻译起始密码子会使转录物成为非传感介导的mRNA衰变（NMD）的候选者。
    源序列
    AC142113型
    相关的
    ensmust公司00000132020.2

注释基因组的参考序列：GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000075.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    44705069..44710821补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. XM_030244613.1号→费用_030100473.1跨膜蛋白25亚型X4

    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3U4J4型
    保守领域（1）总结
    第11960条
    位置：52→143
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  2. XM_030244612.1号→XP_030100472.1号跨膜蛋白25亚型X3

    保守领域（1）总结
    第11960条
    位置：127→218
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  3. XM_030244611.1号→XP_030100471.1号跨膜蛋白25亚型X2

    保守领域（1）总结
    第11960条
    位置：128→219
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  4. XM_030244609.1号→XP_030100469.1号跨膜蛋白25亚型X1

    保守领域（1）总结
    第11960条
    位置：128→219
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  5. XM_030244614.2号→XP_030100474.1号跨膜蛋白25亚型X7

    保守领域（1）总结
    第11960条
    位置：51→142
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  6. XM_036155294.1号→XP_036011187.1号跨膜蛋白25亚型X9

  7. XM_036155292.1号→XP_036011185.1号跨膜蛋白25同种型X6

    保守领域（2）总结
    cd00096
    位置：55→59
    免疫球蛋白；Ig链A'[结构基序]
    第11960条
    位置：52→143
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  8. XM_011242601.3号→XP_011240903.1号跨膜蛋白25亚型X9

    参见XP_011240903.1的相同蛋白质及其注释位置

  9. XM_030244615.2号→XP_030100475.1号跨膜蛋白25亚型X9

  10. XM_036155293.1号→XP_036011186.1号跨膜蛋白25亚型X8

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A1N9MYB8系列
    保守领域（2）总结
    cd00096
    位置：30→34
    免疫球蛋白；Ig链A'[结构基序]
    第11960条
    位置：27→118
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  11. XM_006510610.4号→XP_006510673.1号跨膜蛋白25亚型X5

    参见XP_006510673.1的相同蛋白质及其注释位置

    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第三季度第三季度,Q6PAK7问题,第9季度
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3U4J4型
    保守领域（2）总结
    cd00096
    位置：30→34
    免疫球蛋白；Ig链A'[结构基序]
    第11960条
    位置：27→118
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  12. 圣诞节_036155295.1→XP_036011188.1型跨膜蛋白25亚型X9

  13. 圣诞节_011242602.1→XP_011240904.1号跨膜蛋白25亚型X9

    参见XP_011240904.1的相同蛋白质及其注释位置

  14. XM_030244616.1号→XP_030100476.1号跨膜蛋白25亚型X9

  15. XM_011242603.2号→XP_011240905.1号跨膜蛋白25亚型X9

    参见XP_011240905.1的相同蛋白质及其注释位置

核苷酸 蛋白质 应变
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
问题9DCF1.1 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q9DCF1

基因链接输出

以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

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分子生物学数据库
研究材料
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其他