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M图成熟素,神经祖细胞分化调节器同源物(爪蟾)[小家鼠(家鼠)]

基因ID:68235,更新日期2024年4月30日

总结

官方符号
M图由提供管理信息
官方全名
成熟素,神经祖细胞分化调节器同源物(爪蟾)由提供管理信息
主要来源
MGI:MGI:1915485
参见相关内容
乐团:ENSMUSG00000038065 联盟基因组:MGI:1915485
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
也称为
2410066E13Rik;B230212L03Rik公司
总结
参与巨核细胞分化的正向调节。预计位于细胞质中。表达于多种结构,包括中枢神经系统;回肠;男性生殖腺或器官;脊索;和视网膜。与人类MTURN同源(成熟素,神经祖细胞分化调节器同源物)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
在CNS E18(RPKM 30.4)、CNS E14(RPKM17.3)和19个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源
新的
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

请参见Mturn in基因组数据查看器
位置:
6 B3;6 27.07立方厘米
外显子计数:
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 6 NC_000072.7(54658609..54680840)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 6 NC_000072.6(54681624..54703855)

染色体6-NC_000072.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene FK506 binding protein 14 Neighboring gene pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 8 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_15954 Neighboring gene predicted gene, 34249 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_15956 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_15957 Neighboring gene predicted gene, 44008 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr6:54760023-54760206 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E10381 Neighboring gene zinc and ring finger 2 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_15969 Neighboring gene nucleotide-binding oligomerization domain containing 1

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:小鼠ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

变更

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
  • 目标(2)

一般基因信息

一般蛋白质信息

首选名称
成熟素
姓名
UPF0452蛋白C7orf41同源物
成熟素神经祖细胞分化调节蛋白同源物

NCBI参考序列(参考序列)

新的 尝试新的成绩单表

独立于注释维护的参考序列基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001289740.1NP_001276669.1号成熟蛋白亚型a

    参见NP_001276669.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    转录变体:该变体(1)代表较长的转录,编码较短的亚型(a)。
    源序列
    AC084800、BC052467、BY266709
    共识CDS
    CCDS20158.2号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    Q8CGA4问题
    相关的
    ENSMUSP00000140586.2号,ENSMUST00000190641.7
    保守领域(1)总结
    pfam15167型
    位置:4131
    DUF4581;未知函数域(DUF4581)
  2. 纳米_001289741.1NP_001276670.1成熟蛋白亚型b

    参见NP_001276670.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    转录变体:与变体1相比,该变体(2)包含交替的3'外显子结构。编码的亚型(b)有一个独特的C末端,比亚型a长。
    源序列
    AC084800、BC052467、BY266709
    共识CDS
    CCDS80537.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A087WQV4
    相关的
    ENSMUSP00000140358.2号,ENSMUST00000187701.2
    保守领域(1)总结
    pfam15167型
    位置:4129
    DUF4581;未知函数域(DUF4581)

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定的基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000072.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    54658609..54680840
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. XM_011241447.3号XP_011239749.1号成熟蛋白亚型X1

    参见XP_011239749.1的相同蛋白质及其注释位置

    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A087WQV4
    保守领域(1)总结
    pfam15167型
    位置:4129
    DUF4581;未知函数域(DUF4581)

抑制的参考序列

以下参考序列已被抑制。解释

  1. NM_026629.3号:抑制的序列

    描述
    NM_026629.3:此RefSeq被永久抑制,因为目前对蛋白质的支持不足。