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斯普茨布丝氨酸棕榈酰转移酶,小亚基B[小家鼠(家鼠)]

基因ID:66183,更新于2024年4月30日

总结

官方符号
斯普茨布由提供MGI公司
官方全名
丝氨酸棕榈酰转移酶,小亚基B由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:1913433
请参阅相关
乐团:ENSMUSG00000043461 联盟基因组:MGI:1913433
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
也称为
ADMP;Sssptb;1110032A04瑞克
总结
有助于丝氨酸C-棕榈酰转移酶活性。作用于神经酰胺生物合成过程的上游或内部;内质网组织;丝氨酸C-棕榈酰转移酶活性的调节。丝氨酸C-棕榈酰转移酶复合物的一部分。在中枢神经系统中表达;眼睛;泌尿生殖系统;和内脏。与人SPTSSB(丝氨酸棕榈酰转移酶小亚基B)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
膀胱成人(RPKM 217.4)和胃成人(RPKM 59.8)中的偏倚表达查看更多
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

参见Sptssb in基因组数据查看器
地点:
3 E2;3 32.3立方厘米
外显子计数:
5
注释发布 状态 装配 氯代甲烷 位置
RS_2024_02号 现在的 GRC立方米39(GCF_000001635.27号) NC_000069.7(69726871..69768697,补码)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) NC_000069.6(69819538..69861363,补体)

3号染色体-NC_000069.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene NMD3 ribosome export adaptor Neighboring gene predicted gene, 52662 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_07931 Neighboring gene ribosome production factor 2 homolog pseudogene Neighboring gene predicted gene, 52608 Neighboring gene predicted gene, 35817 Neighboring gene nucleophosmin 1 pseudogene

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:邮编25409824
  • 分析日期:无

变化

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
  • 化学诱导(ENU)(1)1个引文
  • 目标(2)

一般基因信息

标记

基因本体论 由MGI提供

一般蛋白质信息

首选名称
丝氨酸棕榈酰转移酶小亚基B
姓名
小鼠前列腺雄激素下调
丝氨酸棕榈酰转移酶B的小亚基

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释维护的参考序列基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此它们的版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001164210.2号NP_001157682.1号丝氨酸棕榈酰转移酶小亚基B亚型a

    参见NP_001157682.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    转录变体:该变体(1)代表最长的转录,编码较长的亚型(a)。变体1和2编码相同的蛋白质(亚型a)。
    源序列
    AC122009、AK004017、AK009973、BC022628
    共识CDS
    CCDS38453.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    Q925E8型
    相关的
    ENSMUSP00000131241.2ENSMUST00000171529.4号
    保守领域(1)总结
    pfam11779型
    地点:760
    SPT_ssu类;丝氨酸棕榈酰转移酶样小亚基
  2. 纳米_001286959.1库存_001273888.1丝氨酸棕榈酰转移酶小亚基B亚型B

    状态:已验证

    描述
    转录变体:该变体(3)在5'UTR中有所不同,并且具有不同的3'结构,与变体1相比,该结构会导致移码。产生的亚型(b)有一个独特的C末端,比亚型a短。
    源序列
    AC122009型
    保守领域(1)总结
    pfam11779型
    地点:757
    DUF3317;功能未知的蛋白质(DUF3317)
  3. NM_133675.3NP_598436.1号丝氨酸棕榈酰转移酶小亚基B亚型a

    参见NP_598436.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    成绩单变体:与变体1相比,该变体(2)在5'UTR上有所不同。变体1和2编码相同的蛋白质(亚型a)。
    源序列
    AC122009、AK004017、BC022628
    共识CDS
    CCDS38453.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    Q925E8型
    相关的
    ENSMUSP00000062794.8ENSMUST00000051239.13
    保守领域(1)总结
    pfam11779型
    地点:760
    SPT_ssu类;丝氨酸棕榈酰转移酶样小亚基

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000069.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    69726871..69768697补码
    下载
    GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. XM_030252751.2XP_030108611.1号丝氨酸棕榈酰转移酶小亚基B亚型X1