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第10页程序性细胞死亡10[小家鼠(家鼠)]

基因ID:56426,更新于2024年5月12日

总结

官方符号
第10页由提供MGI公司
官方全名
程序性细胞死亡10由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:1928396
请参阅相关
乐团:ENSMUSG00000027835 联盟基因组:MGI:1928396
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
也称为
立方厘米;Tfa15;Tfar15;2410003B13瑞克
总结
预测可启用蛋白质N末端结合活性;蛋白质同二聚体活性;和蛋白激酶结合活性。作用于白血病抑制因子细胞反应的上游或内部。预计位于胞浆中。预计为FAR/SIN/STRIPAK复合体的一部分。预计在高尔基体中很活跃。表达于多种结构,包括心血管系统;中枢神经系统;肠道;视网膜层;和脐动脉。用于研究脑海绵状血管畸形3。该基因的人类直系同源基因与脑海绵状畸形3有关。与人类PDCD10同源(程序性细胞死亡10)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
在胎盘成体(RPKM 13.4)、膀胱成体(RP KM 12.3)和20个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

参见中的Pdcd10基因组数据查看器
地点:
3 E3;33.76立方厘米
外显子计数:
8
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRC立方米39(GCF_000001635.27号) NC_000069.7(75423797..75464159,补体)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) NC_000069.6(75516490..75556852,补码)

3号染色体-NC_000069.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade I, member 2 Neighboring gene WD repeat domain 49 Neighboring gene predicted gene, 17836 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E2071 Neighboring gene serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade I, member 1 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_07971 Neighboring gene pluripotency associated transcript 10

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:邮编25409824
  • 分析日期:无

参考文献

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

变化

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
  • 核酸内切酶介导(3)
  • 目标(6)1个引文

互动

产品 交互作用者 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

克隆名称

  • 毫克102058

基因本体论 由MGI提供

功能 证据代码 酒吧
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
实现蛋白质同二聚体活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使蛋白激酶结合 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
过程 证据代码 酒吧
卷入高尔基重组 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
血管生成中的上游行为 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
acts上游of或在凋亡过程中 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与细胞缺氧反应 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
细胞对白血病抑制因子的反应 IEP公司
从表达式模式推断
更多信息
公共医学 
内皮发育受累 北美
不可追踪的作者声明
更多信息
公共医学 
参与高尔基本地化的建立 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细胞内信号转导 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
过氧化氢对内源性凋亡信号通路的影响 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与凋亡过程的负调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
血管内皮细胞增殖负调控参与新生血管生成 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细胞迁移负调控参与新生血管生成 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与基因表达的负调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与炎症反应的负调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与MAP激酶活性的正调控 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与MAP激酶活性的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与Notch信号通路的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细胞迁移的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细胞群体增殖的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与基因表达的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细胞内蛋白质转运的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与间充质细胞凋亡过程的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与肽基-氨基酸磷酸化的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与应激激活的MAPK级联的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与蛋白质稳定 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与高尔基组织的监管 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与血管生成的调节 北美
不可追踪的作者声明
更多信息
公共医学 
卷入短期记忆 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与伤口愈合、细胞扩散 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 

一般蛋白质信息

首选名称
程序性细胞死亡蛋白10
姓名
TF-1细胞凋亡相关蛋白15

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释维护的参考序列基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_019745.4号NP_062719.2号程序性细胞死亡蛋白10

    参见NP_062719.2的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    源序列
    AC140430、AK075926、BC086778、BY091056
    共识CDS
    CCDS17414.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    Q8VE70型问题9DAR3Q9WV43型
    相关的
    ENSMUSP00000125752.2号ENSMUST0000011137.8号
    保守领域(1)总结
    pfam06840型
    地点:14161
    DUF1241;功能未知的蛋白质(DUF1241)

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000069.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    75423797.75464159补码
    下载
    GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)