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NFKB2型核因子κB亚基2[智人(人类)]

基因ID:4791,更新日期2024年4月11日

总结

官方符号
NFKB2型由提供HGNC公司
官方全名
核因子κB亚单位2由提供HGNC公司
主要来源
HGNC:HGNC:7795
请参阅相关
乐团:ENSG0000077150 MIM:164012; 联盟基因组:HGNC:7795
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
检验过的
有机体
智人
血统
真核生物;后生动物;弦线;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡塔里尼;人科;人类
也称为
第52页;第100页;H2TF1;LYT10;CVID10;LYT-10;NF-kB2;第49页/第100页
总结
该基因编码转录因子复合物核因子-κB(NFkB)的一个亚单位。NFkB复合物在多种细胞类型中表达,并作为炎症和免疫功能相关基因的中心激活物发挥作用。由该基因编码的蛋白质可以作为转录激活物或阻遏物,这取决于其二聚体伴侣。p100全长蛋白被共同翻译成p52活性形式。在B细胞淋巴瘤中观察到该位点的染色体重排和移位,其中一些可能导致融合蛋白的形成。该基因在第18号染色体上有一个假基因。选择性剪接导致多个转录变体。[由RefSeq提供,2013年12月]
表达式
阑尾(RPKM 21.5)、骨髓(RPKM20.6)和25个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源
新款
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基因组背景

请参阅中的NFKB2基因组数据查看器
位置:
10季度24.32
外显子计数:
24
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 10 NC_000010.11(102394110..102402529)
RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0版本(GCF_009914755.1号) 10 NC_060934.1(103279058..103287478)
105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 10 NC_000010.10(104153867..104162286)

染色体10-NC_000010.11描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2752 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2753 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2754 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3925 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3926 Neighboring gene paired like homeodomain 3 Neighboring gene golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr10:104029238-104029738 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr10:104029739-104030239 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 13217 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 15234 Neighboring gene uncharacterized LOC107984263 Neighboring gene MPRA-validated peak1080 silencer Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr10:104147078-104147638 Neighboring gene NANOG hESC enhancer GRCh37_chr10:104151284-104151791 Neighboring gene NANOG-H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr10:104151792-104152298 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3927 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2755 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3928 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3929 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 13585 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2756 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr10:104160632-104161328 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 3575 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2757 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr10:104169870-104170552 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr10:104170553-104171234 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2758 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3930 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 2759 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3931 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3932 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3933 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 3934 Neighboring gene pleckstrin and Sec7 domain containing Neighboring gene F-box and leucine rich repeat protein 15

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
  • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
  • 生物项目:项目编号:4337
  • 出版物:邮编24309898
  • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

PubMed中的相关文章

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

HIV-1相互作用

蛋白质相互作用

蛋白质 基因 互动 酒吧
包膜表面糖蛋白gp120 环境价值 HIV-1 gp120治疗后,人类神经细胞中α-管蛋白、TRADD、IFN-gamma R2、GAS1、MADD、NF-kappaB、I-kappa B、14-3-3蛋白、APaf1、PARP、IGF-1受体、RB1、Rb2/p130、ARC和caspase 6的mRNA表达水平上调 公共医学
包膜跨膜糖蛋白gp41 环境价值 HIV-1 gp41细胞质域诱导的NFkappaB活化需要TAK1、RelA和NEMO蛋白 公共医学
环境价值 HIV-1 gp41的细胞质域(残基704-773)诱导NFkappaB活化。gp41中12个氨基酸序列(762CLFSYHRLRDLL)的缺失导致NFkappaB活性的显著丧失,酪氨酸766尤其重要 公共医学
Tat公司 塔特 HIV-1 Tat与IFN-γ和TNF-α联合通过激活p38、Jnk和Akt信号通路及其下游转录因子NF-kappaB和STAT-1α,增加人类星形胶质细胞中CXCL10 mRNA和蛋白 公共医学
塔特 用细胞透性超氧化物歧化酶(SOD)处理星形胶质细胞可降低Tat诱导的ROS生成和NF-kappaB活化 公共医学
塔特 在HIV-1 Tat表达和HIV感染的星形胶质细胞中,内皮素-1(ET-1)通过ET-1启动子中的NF-kappaB(NF-kabpaB)反应位点显著升高 公共医学
塔特 在凝胶转移、GST下拉和亲和矩阵分析中,HIV-1 Tat已在体外与NFkappaB结合 公共医学
塔特 NFkappaB将p160核受体辅激活物GRIP1连接到HIV-1 LTR启动子,从而通过HIV-1 Tat调节该启动子的完全激活 公共医学
塔特 HIV-1 Tat通过细胞干扰素诱导的双链RNA依赖性蛋白激酶PKR激活NFkappaB 公共医学
塔特 p56-lck在HIV-1 Tat激活NFkappaB中起关键作用 公共医学
塔特 一氧化氮抑制HIV-1 Tat激活NFkappaB 公共医学
Vpr(Vpr) 虚拟专用数据库 HIV-1 Vpr通过诱导丝氨酸866处NFKappaB2(p100)的磷酸化来刺激非规范NFKappa B途径,从而将p100加工成RelB/p52及其随后的核转位 公共医学

转到HIV-1人类交互数据库

PubChem的途径

互动

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

基因本体论 GOA提供

过程 证据代码 酒吧
参与典型NF-kappaB信号转导 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与典型NF-kappaB信号转导 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与细胞应激反应 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与细胞外基质组织 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与滤泡树突状细胞分化 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与生发中心形成 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与炎症反应 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与先天性免疫反应 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与非规范NF-kappaB信号转导 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与RNA聚合酶II对转录的正调控 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与RNA聚合酶II对转录的正调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与DNA模板转录的调节 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与细胞因子反应 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与对脂多糖的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与节奏过程 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与脾脏发育 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
组件 证据代码 酒吧
Bcl3/NF-kappaB2复合物的一部分 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
部分染色质 ISA公司
根据序列比对推断
更多信息
 
细胞质中有活性 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于细胞质中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
位于细胞质中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 
位于细胞质中 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
核质定位 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 
核质定位 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
在核心中是活动的 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于核内 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 

一般蛋白质信息

首选名称
核因子NF-kappa-B p100亚单位
姓名
DNA-结合因子KBF2
NFKB,p52/p100亚单位
淋巴细胞易位染色体10蛋白
核因子Kappa-B亚单位2
核因子NF-kappa-B p52亚单位
B细胞中Kappa轻链基因增强子的核因子2
B细胞2κ轻多肽基因增强子核因子(p49/p100)
癌基因Lyt-10
转录因子NFKB2

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

基因组学

  1. NG_033874.2参考序列基因

    范围
    6596..13415
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形),轻轨_1347

mRNA和蛋白质

  1. NM_001077494.3号NP_001070962.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型a

    参见NP_001070962.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:该变体(1)编码最长的亚型(a)。变体1和5编码相同的亚型(a)。
    源序列
    AL121928、S76638
    共识CDS
    CCDS41564.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    A8K9D9型,D3DR83型,Q00653问题,Q04860问题,Q9BU75型,第9季度第471季度,第9季度第472次
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A1P8C958型
    相关的
    ENSP0000358983.3号,ENST00000369966.8号
    保守领域(7)总结
    cd07934
    位置:38221
    RHD-n_NFkB2;核因子κB2(NF-kappa B2)Rel同源结构域(RHD)的N末端亚结构域
    cd08798
    地点:774849
    死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
    cd00204号
    位置:483620
    ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
    cd01177号
    位置:228327
    IPT_NFkappaB;转录因子NF-κB的IPT结构域和相关转录因子。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
    pfam12796型
    位置:531629
    Ank_2;Ankyrin重复(3份)
    pfam13637型
    位置:488547
    Ank_4;Ankyrin重复(多份)
    sd00045美元
    位置:599630
    ANK;ANK重复[结构图案]
  2. NM_001261403.3号NP_001248332.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型B

    参见NP_001248332.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体1相比,该变体(4)在5'UTR中有所不同,并且在3'编码区域中使用了一个替代的帧内拼接位点。编码的亚型(b)比亚型a短。变体2、3和4编码相同的亚型。
    源序列
    AL121928号
    共识CDS
    邮编41565.1
    UniProtKB/TrEMBL公司
    a0a1第8c958页
    相关的
    ENSP0000498308.1标准,ENST00000652277.1标准
    保守领域(7)总结
    cd07934
    位置:38221
    RHD-n_NFkB2;核因子κB2(NF-kappa B2)Rel同源结构域(RHD)的N末端亚结构域
    cd08798
    位置:774849
    死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
    cd00204号
    位置:483620
    ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
    cd01177号
    位置:228327
    IPT_NFkappaB;转录因子NF-κB的IPT结构域和相关转录因子。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
    pfam12796型
    位置:531629
    Ank_2;Ankyrin重复(3份)
    pfam13637型
    位置:488547
    Ank_4;Ankyrin重复(多份)
    sd00045美元
    位置:599630
    ANK;ANK重复[结构图案]
  3. NM_001288724.1NP_001275653.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型B

    参见NP_001275653.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体1相比,该变体(3)在5'UTR中有所不同,并且在3'编码区域中使用了一个替代的帧内拼接位点。编码的亚型(b)比亚型a短。变体2、3和4编码相同的亚型。
    源序列
    AL121928、BC002844、DB091090
    共识CDS
    CCDS41565.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    a0a1第8c958页
    相关的
    ENSP00000410256.1,ENST00000428099.6
    保守领域(7)总结
    cd07934
    位置:38221
    RHD-n_NFkB2;核因子κB2(NF-kappa B2)Rel同源结构域(RHD)的N末端亚结构域
    cd08798
    位置:774849
    死亡_NFkB2_p100;核因子κB2前体蛋白p100的死亡结构域
    cd00204号
    位置:483620
    ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
    cd01177号
    位置:228327
    IPT_NFkappaB;转录因子NF-κB的IPT结构域和相关转录因子。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
    pfam12796型
    位置:531629
    Ank_2;Ankyrin重复(3份)
    pfam13637型
    位置:488547
    Ank_4;Ankyrin重复(多份)
    sd00045美元
    位置:599630
    ANK;ANK重复[结构图案]
  4. NM_001322934.2NP_001309863.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型a

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:该变体(5)和变体1编码相同的亚型(a)。
    源序列
    AK098415,AL121928,KT935449
    共识CDS
    CCDS41564.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    A8K9D9型,D3DR83型,Q00653问题,Q04860问题,第9季度第75季度,第9季度第471季度,Q9H472型
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A1P8C958型
    相关的
    ENSP0000499294.1标准,ENST00000661543.1标准
    保守领域(7)总结
    cd07934
    位置:38221
    RHD-n_NFkB2;核因子κB2的Rel同源结构域(RHD)的N-末端亚结构域
    cd08798
    位置:774849
    死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
    cd00204号
    位置:483620
    ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
    cd01177号
    位置:228327
    IPT_NFkappaB;转录因子NF-κB的IPT结构域和相关转录因子。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
    pfam12796型
    位置:531629
    Ank_2;Ankyrin重复(3份)
    pfam13637型
    位置:488547
    Ank_4;Ankyrin重复(多份)
    sd00045美元
    位置:599630
    ANK;ANK重复[结构图案]
  5. NM_001322935.1NP_001309864.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型c

    状态:已审阅

    源序列
    AL121928、BC002844
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A1P8C958型
  6. NM_002502.6号NP_002493.3型核因子NF-κB p100亚单位亚型B

    参见NP_002493.3的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体1相比,该变体(2)在5'UTR中有所不同,并且在3'编码区域中使用了一个替代的帧内拼接位点。编码的亚型(b)比亚型a短。变体2、3和4编码相同的亚型。
    源序列
    AL121928号
    共识CDS
    CCDS41565.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A1P8C958型
    相关的
    ENSP00000189444.6,ENST00000189444.11号机组
    保守领域(7)总结
    cd07934
    位置:38221
    RHD-n_NFkB2;核因子κB2(NF-kappa B2)Rel同源结构域(RHD)的N末端亚结构域
    cd08798
    位置:774849
    死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
    cd00204号
    位置:483620
    ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
    cd01177号
    位置:228327
    IPT_NFkappaB;转录因子NF-κB的IPT结构域和相关转录因子。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
    pfam12796型
    位置:531629
    Ank_2;Ankyrin重复(3份)
    pfam13637型
    位置:488547
    Ank_4;Ankyrin重复(多份)
    sd00045美元
    位置:599630
    ANK;ANK重复[结构图案]

注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCh38.p14一次组件

基因组学

  1. NC_000010.11参考GRCh38.p14初级组件

    范围
    102394110…102402529
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

备选T2T-CHM13v2.0

基因组学

  1. NC_060934.1替代T2T-CHM13v2.0

    范围
    103279058..103287478
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)