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MBP公司髓鞘碱性蛋白[智人(人类)]

基因ID:4155,更新日期2024年6月17日

总结

官方符号
MBP公司由提供HGNC公司
官方全名
髓鞘碱性蛋白由提供HGNC公司
主要来源
HGNC:HGNC:6925
请参阅相关
乐团:ENSG00000197971 MIM:159430; 联盟基因组:HGNC:6925
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
检验过的
有机体
智人
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡塔里尼;人科;人类
总结
由经典MBP基因编码的蛋白质是神经系统中少突胶质细胞和施旺细胞髓鞘的主要组成部分。然而,MBP相关转录物也存在于骨髓和免疫系统中。这些mRNA来自长MBP基因(也称为“Golli-MBP”),该基因包含位于经典MBP外显子上游的3个额外外显子。Golli和MBP转录起始位点的选择性剪接产生2组MBP相关转录物和基因产物。Golli mRNA包含3个Golli-MBP特有的外显子,在框架内拼接到1个或多个MBP外显子。它们编码具有与MBP-aa序列相连的N-末端Golli-aa序列的杂交蛋白质。第二个转录家族仅包含MBP外显子,并产生特征良好的髓磷脂碱性蛋白。这种复杂的基因结构在物种之间是保守的,这表明MBP转录单元是Golli转录单元的一个组成部分,这种排列对这些基因的功能和/或调节很重要。[由RefSeq提供,2008年7月]
注释信息
注:MBP(基因ID:4155)和MBL2(基因ID:4153)共享MBP符号/别名。MBP是广泛使用的甘露糖结合凝集素2(MBL2)的替代名称,它可能与MBP(髓磷脂碱性蛋白,GeneID 4155)的官方符号混淆。[2018年6月1日]
表达式
大脑(RPKM 287.3)和甲状腺(RPKM 8.9)中的偏向性表达查看更多
直系同源
新款
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基因组背景

参见中的MBP基因组数据查看器
位置:
18季度23
外显子计数:
15
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(总金额000001405.40) 18 NC_000018.10(76978833..77133708,补码)
RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 18 NC_060942.1(77209381..77365381,补码)
105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 18 NC_000018.9(74690789..74844739,补码)

染色体18-NC_000018.10描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene uncharacterized LOC105372214 Neighboring gene zinc finger protein 236 Neighboring gene exportin for tRNA pseudogene Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74651502-74652002 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 9562 Neighboring gene NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74678461-74679129 Neighboring gene uncharacterized LOC105372217 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13516 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74694849-74695698 Neighboring gene CDK7 strongly-dependent group 2 enhancer GRCh37_chr18:74700218-74701417 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74704741-74705313 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74709764-74710264 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74710265-74710765 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74717425-74718324 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74718325-74719223 Neighboring gene BRD4-independent group 4 enhancer GRCh37_chr18:74748403-74749602 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74757338-74757860 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74765055-74765555 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74766661-74767562 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74770546-74771179 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13521 Neighboring gene MED14-independent group 3 enhancer GRCh37_chr18:74776675-74777874 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13522 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13523 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13524 Neighboring gene uncharacterized LOC124904328 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74802305-74802806 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74802807-74803306 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74804211-74804718 Neighboring gene OCT4-NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74808602-74809360 Neighboring gene OCT4-NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74809361-74810118 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74811635-74812393 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13527 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13526 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 9563 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13528 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74823367-74823868 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74823869-74824370 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74825481-74826028 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr18:74830525-74831025 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74831608-74832216 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74832217-74832825 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74835311-74836244 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13529 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13530 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13531 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13532 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13533 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 9564 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr18:74870262-74870762 Neighboring gene NANOG hESC enhancer GRCh37_chr18:74872399-74872969 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 13534 Neighboring gene MED14-independent group 3 enhancer GRCh37_chr18:74938546-74939745 Neighboring gene uncharacterized LOC124904329 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74961440-74962111 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:74962783-74963454 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:75002506-75003006 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:75003007-75003507 Neighboring gene galanin receptor 1 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:75050846-75051397 Neighboring gene MED14-independent group 3 enhancer GRCh37_chr18:75065347-75066546 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr18:75079064-75079568 Neighboring gene CDK7 strongly-dependent group 2 enhancer GRCh37_chr18:75115171-75116370 Neighboring gene uncharacterized LOC107985171

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
  • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
  • 生物项目:项目编号:4337
  • 出版物:邮编24309898
  • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

表型

EBI GWAS目录

描述
评估晚期年龄相关性黄斑变性亚型之间遗传差异的遗传性和全基因组关联研究。
血统和常见遗传变异对非裔美国人QT间期的影响。

PubChem的途径

互动

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

克隆名称

  • 毫克99675

基因本体论 GOA提供

功能 证据代码 酒吧
启用钙调素结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
启用蛋白酶绑定 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
使髓鞘的结构成分 IBA公司
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
组件 证据代码 酒吧
单元格外围的活动 IBA公司
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于单元格表面 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
致密髓磷脂的活性 IBA公司
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
定位于胞浆中 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
轴突节间区is_active IBA公司
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于髓鞘内 伊达
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
神经元细胞体中的is_active IBA公司
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于核内 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
位于质膜中 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
蛋白质复合物的一部分 伊达
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
定位于突触 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 

一般蛋白质信息

首选名称
髓鞘碱性蛋白;戈尔利-MBP
姓名
髓磷脂A1蛋白
髓鞘膜致脑蛋白

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001025081.2号NP_001020252.1号髓磷脂碱性蛋白亚型1

    参见NP_001020252.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:该变体(1)编码最长的经典MBP亚型(1)。
    源序列
    AK098402、AK128770、BC080654、BG766942、M30515
    共识CDS
    CCDS32847.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A8K1H8型
    相关的
    ENSP0000372025.3号文件,ENST00000382582.7标准
    保守领域(1)总结
    辉瑞01669
    位置:16196
    髓磷脂_MBP;髓磷脂碱性蛋白
  2. NM_001025090.2号NP_001020261.1号髓磷脂碱性蛋白亚型3

    参见NP_001020261.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与转录变体1相比,该变体(3)缺少外显子2,编码一种经典MBP亚型(3),与亚型1相比,它缺少26 aa片段。
    源序列
    AK098402、AK128770、BC080654
    共识CDS
    CCDS42449.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A8MZH3型
    相关的
    ENSP0000380964.4标准,ENST00000397866.8号
    保守领域(1)总结
    辉瑞01669
    位置:16170
    髓磷脂_MBP;髓磷脂碱性蛋白
  3. NM_001025092.2号NP_001020263.1型髓鞘碱性蛋白亚型4

    参见NP_001020263.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与转录变体1相比,该变体(4)缺少外显子2和5,编码一种经典MBP亚型(4),与亚型1相比,它缺少26 aa和11 aa片段。
    源序列
    AK098402、AK128770、BC080654、BG766942
    共识CDS
    CCDS42448.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    B4DF42型
    相关的
    ENSP0000380963.5标准,ENST00000397865.9号
    保守领域(1)总结
    辉瑞01669
    位置:16159
    髓磷脂_MBP;髓磷脂碱性蛋白
  4. 纳米_001025100.2NP_001020271.1号Golli-MBP亚型2

    参见NP_001020271.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:该变体(8)包含Golli-MBP特有的3个外显子和经典MBP的外显子1。它编码较短的Golli-mbp亚型(2),也称为造血mbp。
    源序列
    AB208986、AC018529、AK093588、BM977768、BU430656、N20370
    共识CDS
    CCDS42450.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    J3KS94型
    相关的
    ENSP00000380958.3,恩斯特00000397860.7
    保守领域(1)总结
    辉瑞01669
    位置:149191
    髓磷脂_MBP;髓磷脂碱性蛋白
  5. NM_001025101.2号NP_001020272.1号Golli-MBP亚型1

    参见NP_001020272.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:该变体(7)包含Golli MBP特有的3个外显子以及经典MBP的外显子1和3-7。它编码较长的Golli-mbp亚型(1)。
    源序列
    AB208986、AC018529、AK098402、AK128770、BC080654
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    A4FU54型,A6NI84型,A8车型年款86,A8车型年款4,B3KY66型,B7ZKS2号,B7ZKS4号,P02686号,问题15337,问题15338,问题15339,问题15340,每59克x3,Q65ZS4型,Q6AI64问题,Q6FH37型,Q6FI04型,Q6PK23型
    相关的
    ENSP0000348273.2号文件,ENST00000355994.7标准
    保守领域(1)总结
    辉瑞01669
    位置:149303
    髓磷脂_MBP;髓磷脂碱性蛋白
  6. NM_002385.3号NP_002376.1号髓鞘碱性蛋白亚型2

    参见NP_002376.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与转录变体1相比,该变体(2)缺少外显子5,编码一种经典MBP亚型(2),与亚型1相比,它缺少11 aa片段。
    源序列
    AK098402、AK128770、BC080654、BG766942、M30516
    共识CDS
    CCDS12011.1中
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A8K1H8型
    相关的
    ENSP0000352667.3号文件,恩斯特00000359645.7
    保守领域(1)总结
    辉瑞01669
    位置:16185
    髓磷脂_MBP;髓磷脂碱性蛋白

注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCh38.p14一次组件

基因组学

  1. NC_000018.10参考GRCh38.p14初级组件

    范围
    76978833..77133708补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. XM_047437533.1号XP_047293489.1号Golli-MBP亚型X5

    UniProtKB/TrEMBL公司
    J3QQK6型
  2. XM_047437532.1号XP_047293488.1号Golli-MBP亚型X5

    UniProtKB/TrEMBL公司
    J3QQK6型
  3. XM_047437530.1号XP_047293486.1号Golli-MBP亚型X3

  4. XM_047437529.1号XP_047293485.1号Golli-MBP亚型X2

  5. 圣诞节_047437536.1XP_047293492.1号Golli-MBP亚型X8

    UniProtKB/TrEMBL公司
    J3QQK6型
    相关的
    ENSP0000463780.1号,ENST00000579129.5号机组
  6. 圣诞节_047437535.1XP_047293491.1号Golli-MBP亚型X7

    UniProtKB/TrEMBL公司
    J3QQK6型
  7. XM_047437534.1号XP_047293490.1号Golli-MBP亚型X6

    UniProtKB/TrEMBL公司
    J3QQK6型
  8. XM_047437531.1号XP_047293487.1号Golli-MBP亚型X4

    UniProtKB/TrEMBL公司
    J3QQK6型
  9. XM_047437523.1号电话_047293479.1Golli-MBP亚型X1

  10. XM_047437521.1XP_047293477.1号Golli-MBP亚型X1

  11. XM_047437528.1号XP_047293484.1号Golli-MBP亚型X1

  12. XM_047437522.1号XP_047293478.1号Golli-MBP亚型X1

  13. XM_047437524.1号电话_047293480.1Golli-MBP亚型X1

  14. XM_047437525.1号XP_047293481.1号Golli-MBP亚型X1

  15. XM_047437527.1号XP_047293483.1号Golli-MBP亚型X1

  16. XM_047437526.1号XP_047293482.1号Golli-MBP亚型X1

备选T2T-CHM13v2.0

基因组学

  1. NC_060942.1替代T2T-CHM13v2.0

    范围
    77209381.77365381补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. XM_054318652.1号XP_054174627.1号Golli-MBP亚型X5

    UniProtKB/TrEMBL公司
    J3QQK6型
  2. XM_054318651.1号XP_054174626.1号Golli-MBP亚型X5

    UniProtKB/TrEMBL公司
    J3QQK6型
  3. XM_054318649.1号支出_054174624.1Golli-MBP亚型X3

  4. XM_054318648.1XP_054174623.1号Golli-MBP亚型X2

  5. XM_054318655.1号XP_054174630.1号Golli-MBP亚型X8

    UniProtKB/TrEMBL公司
    J3QQK6型
  6. XM_054318654.1号XP_054174629.1号Golli-MBP亚型X7

    UniProtKB/TrEMBL公司
    J3QQK6型
  7. XM_054318653.1号XP_054174628.1号Golli-MBP亚型X6

    UniProtKB/TrEMBL公司
    J3QQK6型
  8. XM_054318650.1号XP_054174625.1号Golli-MBP亚型X4

    UniProtKB/TrEMBL公司
    J3QQK6型
  9. XM_054318643.1号XP_054174618.1号Golli-MBP亚型X1

  10. XM_054318642.1号XP_054174617.1号Golli-MBP亚型X1

  11. XM_054318647.1号费用_054174622.1Golli-MBP亚型X1

  12. XM_054318644.1号XP_054174619.1号Golli-MBP亚型X1

  13. XM_054318645.1号XP_054174620.1号Golli-MBP亚型X1

  14. XM_054318646.1号XP_054174621.1号Golli-MBP亚型X1

抑制的参考序列

以下参考序列已被抑制。解释

  1. NM_001025094.1号:抑制序列

    描述
    NM_001025094.1:此RefSeq被永久性抑制,因为它是非传感介导的mRNA衰变(NMD)候选基因。
  2. NM_001025098.1号:抑制序列

    描述
    NM_001025098.1:RefSeq被永久抑制,因为它是一种无义介导的信使核糖核酸衰变(NMD)候选物。