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Krt77号公路角蛋白77[小家鼠(家鼠)]

基因ID:406220,更新日期2024年4月30日

总结

官方符号
Krt77号公路由提供MGI公司
官方全名
角蛋白77由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:3588209
请参阅相关
乐团:ENSMUSG00000067594 联盟基因组:MGI:3588209
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;Euarchontoglires语;闪光;啮齿动物;变形肌;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
也称为
K77;mK1b;CK-1B;K1emb;Krt239;4732484G22里克
总结
预测位于细胞骨架中。在表皮中表达;掌垫;和皮肤。与人类同源的KRT77(角蛋白77)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
乳腺成人(RPKM 6.1)、肢体E14.5(RPKM5.5)和6个其他组织中的偏倚表达查看更多
直系同源
新的
尝试新的基因表
尝试新的成绩单

基因组背景

参见中的Krt77基因组数据查看器
位置:
15层;15 57.08立方厘米
外显子计数:
10
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 15 NC_000081.7(101767166..101778141,补码)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 15 NC_000081.6(101858731..101869706,补码)

染色体15-NC_000081.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene predicted gene, 35972 Neighboring gene keratin 1 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_39807 Neighboring gene keratin 76 Neighboring gene keratin 4

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

参考文献

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?
提交: 新GenerRIF 更正

变更

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
  • 核酸内切酶介导(4)

互动

产品 交互作用剂 其他基因 综合体 来源 酒吧 描述

一般蛋白质信息

首选名称
角蛋白,II型细胞骨架1b
姓名
细胞角蛋白-1B
胚胎II型角蛋白1
角蛋白1b
角蛋白复合物2,碱性,基因39
Ⅱ型角蛋白Kb39
II型中间丝蛋白

NCBI参考序列(RefSeq)

新的 尝试新的成绩单

独立于注释维护的参考序列基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001003667.2号NP_001003667.1号角蛋白,II型细胞骨架1b

    参见NP_001003667.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    源序列
    AA880500、AC104862、AK132513、BK003993
    共识CDS
    CCDS27865.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    Q6IFZ6型
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q08EK4问题,Q08EK5问题
    相关的
    ENSMUSP00000085311.6,ENSMUST00000087996.7号
    保守领域(2)总结
    pfam00038型
    位置:166479
    长丝;中间丝蛋白
    pfam16208型
    位置:51163
    角蛋白2_head;角蛋白II型头部

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000081.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    101767166..101778141补码
    下载
    发电厂银行,美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. XM_006521140.1号XP_006521203.1号角蛋白,II型细胞骨架1b亚型X1

    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q08EK4问题
    保守领域(2)总结
    pfam00038型
    位置:166479
    长丝;中间丝蛋白
    pfam16208型
    位置:51163
    角蛋白2_head;角蛋白II型头部
  2. XM_017316690.1号XP_017172179.1号角蛋白,II型细胞骨架1b亚型X2

    保守领域(1)总结
    pfam00038型
    位置:1234
    长丝;中间丝蛋白
  3. XM_030248628.1号XP_030104488.1号角蛋白,II型细胞骨架1b亚型X3

    保守领域(1)总结
    pfam00038型
    位置:1234
    长丝;中间丝蛋白