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H3c1型H3聚集组蛋白1[小家鼠（家鼠）]

基因ID:360198，更新日期2024年9月24日

总结

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官方符号
H3c1型由提供MGI公司
官方全名
H3聚集组蛋白1由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:2668828
请参阅相关
乐团：ENSMUSG00000069265 联盟基因组：MGI:2668828
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
检验过的
有机体
小家鼠
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；肌形态；鼠形目；鼠科；穆里奈；穆斯；穆斯
也称为
H3c8；H3c10；H3c11；历史1h3a
总结
组蛋白是真核生物中负责染色体纤维核小体结构的基本核蛋白。该结构由包裹在核小体周围的约146bp的DNA组成，核小体是由四种核心组蛋白（H2A、H2B、H3和H4）中的每一种成对组成的八聚体。染色质纤维通过连接体组蛋白H1与核小体之间的DNA相互作用进一步致密，形成高阶染色质结构。该基因无内含子，编码组蛋白H3家族成员的复制依赖型组蛋白。该基因的转录物缺乏多聚A尾部；相反，它们包含一个回文终止元素。[由RefSeq提供，2015年8月]
直系同源
人类 全部的
新款
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基因组背景

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参见中的H3c1基因组数据查看器
位置：
13 A3.1；13 9.91立方厘米
外显子计数：
1
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 13 NC_000079.7（23945868..23946369，补码）
108.20200622 上一个程序集 GRC第38页第6页(GCF_000001635.26号) 13 NC_000079.6（2376185..23762386，补码）

染色体13-NC_000079.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_33973 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_33974 Neighboring gene H4 clustered histone 2 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E4061 Neighboring gene H4 clustered histone 1 Neighboring gene H1.1 linker histone, cluster member Neighboring gene tripartite motif-containing 38

基因组区域、转录物和产物

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参考文献

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PubMed中的相关文章

  1. 细胞核移植胚胎基因组重构期间组蛋白变体的显著替换。 Nashun B、，等表观遗传学，2011年12月PMID 22139579
  2. 组蛋白在哺乳动物精子发生过程中染色质重塑中的作用。 戈文J，等《欧洲生物化学杂志》，2004年9月，PMID 15317581
  3. 组蛋白H3.1的掺入抑制骨骼肌的谱系潜能。 原田A，等《核酸研究》，2015年1月，PMID 25539924，免费PMC文章
  4. 外周神经损伤后浸润巨噬细胞组蛋白修饰导致CCL2和CCL3表观上调。 Kiguchi北部，等细胞因子，2013年12月PMID 24135048
  5. 半甲基化DNA打开UHRF1的闭合构象以促进其组蛋白识别。 方杰，等Nat Commun，2016年4月5日。PMID 27045799，免费PMC文章

查看PubMed中的所有（23）条引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？
  1. 巨噬细胞MCT4抑制通过组蛋白H3赖氨酸18内酰胺化激活修复基因并保护动脉粥样硬化。
    标题：巨噬细胞MCT4抑制通过组蛋白H3赖氨酸18内酰胺化激活修复基因并保护动脉粥样硬化。
  2. 半甲基化DNA打开UHRF1的闭合构象以促进其H3组蛋白识别。
    标题：半甲基化DNA打开UHRF1的闭合构象以促进其组蛋白识别。
  3. 结果表明，CCL2和CCL3通过巨噬细胞等浸润免疫细胞的表观遗传组蛋白修饰在受损的周围神经中上调。
    标题：外周神经损伤后通过组蛋白修饰浸润巨噬细胞内CCL2和CCL3的表观遗传上调。
  4. 这一结果表明H3.1的掺入对基因组重构过程有不利影响，并导致体细胞核克隆的成功率较低。
    标题：细胞核移植胚胎基因组重构期间组蛋白变体的戏剧性替换。
提交： 新GenerRIF 更正

PubChem的途径

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互动

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产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

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标记

同源性

基因本体论 由MGI提供

组件 证据代码 酒吧
核质定位 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
核小体部分 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
位于核内 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
蛋白质复合物的一部分 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  

一般蛋白质信息

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首选名称
组蛋白H3.1
姓名
组蛋白1，H3a
组蛋白簇1，H3a

NCBI参考序列（RefSeq）

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新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_013550.5→NP_038578.2号组蛋白H3.1

    参见NP_038578.2的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已审阅

    源序列
    AL590388型
    共识CDS
    CCDS26368.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第68433页,Q05A97问题,Q3B7Z8问题,Q3B7Z9问题,Q5T009问题
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A1L0V4系列
    相关的
    ENSMUSP000000089293.3公司,恩斯穆斯特00000091701.3
    保守领域（1）总结
    PTZ00018型
    位置：1→136
    PTZ00018；组蛋白H3；临时的

注释基因组的参考序列：GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000079.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    23945868..23946369补码
    下载
    发电厂银行,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）
核苷酸 蛋白质 应变
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
第68433.2页 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:P68433

基因链接输出

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