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镁4a甘露糖苷乙酰氨基葡萄糖转移酶4，同工酶A[小家鼠（家鼠）]

基因ID:269181，更新于2024年5月9日

总结

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官方符号
管理层4a由提供MGI公司
官方全名
甘露糖苷乙酰氨基葡萄糖转移酶4，同工酶A由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:2662992
请参阅相关
乐团：ENSMUSG00000026110 联盟基因组：MGI:2662992
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；肌形态；鼠形目；鼠科；穆里奈；Mus公司；穆斯
也称为
GnT-IVa；glcNAc-T-IVa；9530018I07Rik公司
总结
激活乙酰氨基葡萄糖转移酶活性。作用于蛋白质N-连接糖基化的上游或内部。预计位于高尔基体内；胞外区域；和膜。预计为膜的组成部分。预计在高尔基球堆栈中活跃；内质网；和内质网-高尔基体中间室。以多种结构表达，包括消化系统；泌尿生殖系统；神经系统；鼻子；和呼吸系统。与人MGAT4A同源（α-1,3-甘露糖基-糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A）。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
表达式
在大肠成体（RPKM 27.4）、结肠成体（RTKM 23.5）和20个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源
人类 全部的
新款
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基因组背景

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参见中的Mgat4a基因组数据查看器
地点：
1 B类；115.46立方厘米
外显子计数：
19
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 1 NC_000067.7（37478421..37580599，补码）
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 1 NC_000067.6（37439340..37541060，补码）

1号染色体-NC_000067.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene cytochrome C oxidase assembly factor 5 Neighboring gene unc-50 homolog Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:37528102-37528303 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E1540 Neighboring gene G1 to S phase transition pseudogene Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E1541 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_00677 Neighboring gene predicted gene, 39627 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E5748 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:37642841-37643028 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:37643098-37643207 Neighboring gene RIKEN cDNA 4930556I23 gene Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:37671888-37672102 Neighboring gene capping protein inhibiting regulator of actin like Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_00679 Neighboring gene RIKEN cDNA 4930470B04 gene Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_00681

基因组区域、转录物和产物

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表达式

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  • 项目名称：鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述：鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目：PRJNA66167型
  • 出版物：PMID 25409824
  • 分析日期：无

参考文献

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PubMed中的相关文章

  1. 发现调节小鼠N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IVa（MGAT4A）酶活性的凝集素结构域。 Nagae M，等Commun Biol，2022年7月19日。PMID 35854001，免费PMC文章
  2. Let-7c通过靶向甘露糖苷乙酰氨基葡萄糖转移酶4同工酶A抑制小鼠肝癌细胞的转移能力。 郭毅，等《国际生物化学细胞生物学杂志》，2014年8月，PMID 24769441
  3. 饮食和基因控制葡萄糖转运蛋白2糖基化促进胰岛素分泌抑制糖尿病。 大津保K，等.Cell，2005年12月29日。PMID 16377570号
  4. N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IVa和-IVb双缺陷小鼠的生理和糖学特征。 高松S，等.糖生物学，2010年1月PMID 20015870，免费PMC文章
  5. 核心岩藻糖的缺失上调GnT-III和Wnt靶基因：聚糖功能适应性反应的可能机制。 Kurimoto A，等生物化学杂志，2014年4月25日。PMID 24619415，免费PMC文章

查看PubMed中的所有（20）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？
  1. N-乙酰氨基葡萄糖转移酶IVa的N-糖基化增强整合素β1与波形蛋白的相互作用并促进肝癌细胞运动。
    标题：N-乙酰氨基葡萄糖转移酶IVa的N-糖基化增强整合素β1与波形蛋白的相互作用并促进肝癌细胞运动。
  2. 发现调节小鼠N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IVa（MGAT4A）酶活性的凝集素结构域。
    标题：发现调节小鼠N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IVa（MGAT4A）酶活性的凝集素结构域。
  3. 我们的研究结果表明，let-7c可能通过抑制Mgat4a活性，至少部分抑制Hca-F细胞的转移能力。
    标题：Let-7c通过靶向甘露糖苷乙酰氨基葡萄糖转移酶4同工酶A抑制小鼠肝癌细胞的转移能力。
  4. 研究了编码GnT-4a糖基转移酶基因的突变及其与2型糖尿病的关系。
    标题：葡萄糖转运蛋白2糖基化的饮食和基因控制促进胰岛素分泌抑制糖尿病。
提交： 新GenerRIF 更正

变更

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等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载（MGI）
  • 核酸内切酶介导（1）
  • 目标（2）1条引文

一般基因信息

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标记

同源性

基因本体论 由MGI提供

功能 证据代码 酒吧
激活乙酰氨基葡萄糖转移酶活性 IBA公司
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
激活乙酰氨基葡萄糖转移酶活性 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
激活α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶活性 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
激活α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
激活糖基转移酶活性 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
启用金属离子绑定 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
激活转移酶活性 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
过程 证据代码 酒吧
参与N-聚糖加工 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
involved_in蛋白N-连接糖基化 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
acts_upstream_of_or_in蛋白质N-连接糖基化 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
 公共医学 
参与蛋白质糖基化 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
组件 证据代码 酒吧
高尔基体中的位置 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
高尔基球堆栈中的is_active 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
内质网内is_active 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
内质网高尔基体中间室is_active 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
位于细胞外区域 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
定位膜 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  

一般蛋白质信息

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首选名称
α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A
姓名
N-乙酰氨基葡萄糖转移酶IVa
N-糖基-寡糖-糖蛋白N-乙酰葡糖胺基转移酶IVa
UDP-N-乙酰氨基葡萄糖：α-1,3-D-甘露醇β-1,4-N-乙酰氨基葡萄糖苷转移酶IVa
NP_001277730.1号
NP_776295.1号
XP_006496085.1型
XP_006496087.1型
XP_006496089.1型
XP_011236828.1号
XP_017176450.1型
XP_017176453.1号
XP_017176454.1号
XP_017176455.1号
XP_017176456.1号
XP_036021327.1号
XP_036021329.1号
XP_036021332.1型
XP_036021335.1号

NCBI参考序列（RefSeq）

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独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来识别版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001290801.1号→NP_001277730.1号α-1,3-氨基葡萄糖基糖蛋白4-β-N-乙酰基葡糖胺基转移酶A亚型2

    参见NP_001277730.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    描述
    转录变体：与变体1相比，该变体（2）在5'编码区中使用了一个替代的帧内拼接位点。编码蛋白（亚型2）比亚型1短。
    源序列
    AC084390、AC140321、AK035332、AK076502、AK155724、AK163327
    共识CDS
    CCDS69882.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    Q812G0型
    相关的
    ENSMUSP0000012111.2公司,ENSMUST00000154819.8号
    保守领域（1）总结
    pfam04666型
    地点：94→371
    糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区

  2. NM_173870.3→NP_776295.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型1

    参见NP_776295.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    描述
    转录变体：该变体（1）代表较长的转录，编码较长的蛋白质（亚型1）。
    源序列
    AC084390、AC140321、AK035332、AK076502、AK155724、AK163327
    共识CDS
    CCDS14893.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第三季度第1季度,Q80UI0,Q812G0型
    相关的
    ENSMUSP00000114175.2,ENSMUST0000051952.8
    保守领域（2）总结
    pfam04666型
    地点：103→380
    糖转移54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区
    cd21105
    地点：287→302
    类PGAP4；推测TM2螺旋[结构基序]

注释基因组的参考序列：GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000067.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    37478421..37580599补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. XM_036165442.1号→XP_036021335.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X4

    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第三季度第1季度,Q80UI0型,Q812G0型
    保守领域（2）总结
    pfam04666型
    地点：103→380
    糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区
    cd21105
    地点：287→302
    类PGAP4；推测TM2螺旋[结构基序]

  2. XM_017320964.2号→XP_017176453.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X8

    保守领域（1）总结
    pfam04666型
    地点：1→135
    糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区

  3. XM_017320966.1号→XP_017176455.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X8

    保守领域（1）总结
    pfam04666型
    地点：1→135
    糖转移54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区

  4. XM_006496026.2号→XP_006496089.1型α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X8

    参见XP_006496089.1的相同蛋白质及其注释位置

    保守领域（1）总结
    pfam04666型
    地点：1→135
    糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区

  5. XM_017320961.2号→XP_017176450.1型α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X7

    保守领域（1）总结
    pfam04666型
    地点：94→371
    糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区

  6. XM_017320965.1号→XP_017176454.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X8

    保守领域（1）总结
    pfam04666型
    地点：1→135
    糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区

  7. XM_017320967.1号→XP_017176456.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X9

    保守领域（1）总结
    pfam04666型
    地点：1→135
    糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区

  8. XM_006496024.3号→费用_006496087.1α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X5

    保守领域（1）总结
    pfam04666型
    地点：103→380
    糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区

  9. XM_006496022.5→XP_006496085.1型α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X4

    参见XP_006496085.1的相同蛋白质及其注释位置

    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第三季度第1季度,Q80UI0型,Q812G0型
    保守领域（2）总结
    pfam04666型
    地点：103→380
    糖转移54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区
    cd21105
    地点：287→302
    类PGAP4；推测TM2螺旋[结构基序]

  10. XM_036165436.1号→XP_036021329.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X2

    保守领域（2）总结
    pfam04666型
    地点：140→417
    糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区
    cd21105
    地点：324→339
    类PGAP4；推测TM2螺旋[结构基序]

  11. XM_036165439.1号→XP_036021332.1型α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X3

    保守领域（2）总结
    pfam04666型
    地点：131→408
    糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区
    cd21105
    地点：315→330
    类PGAP4；推测TM2螺旋[结构基序]

  12. XM_036165434.1号→XP_036021327.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X1

    保守领域（2）总结
    辉瑞04666
    地点：140→417
    糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区
    cd21105
    地点：324→339
    类PGAP4；推测TM2螺旋[结构基序]

  13. XM_011238526.3号→XP_011236828.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X6

    参见XP_011236828.1的相同蛋白质及其注释位置

    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    Q812G0型
    保守领域（1）总结
    pfam04666型
    地点：94→371
    糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区
核苷酸 蛋白质 应变
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
Q812G0.1型 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q812G0

基因链接输出

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