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Ttc13型四三肽重复结构域13[小家鼠（家鼠）]

基因ID:234875，更新日期2024年3月5日

总结

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官方符号
Ttc13型由提供管理信息
官方全名
四三肽重复结构域13由提供管理信息
主要来源
MGI:MGI:2384573
参见相关内容
恩森布尔：ENSMUSG0000037300 联盟基因组：MGI:2384573
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；变形肌；鼠形目；鼠科；穆里奈；穆斯；穆斯
总结
与人类TTC13同源（四肽重复域13）。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
表达式
在中枢神经系统E18（RPKM 6.6）、胸腺成体（RPKM6.4）和28个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源
人类 全部的
新的
尝试新的基因表
尝试新的成绩单

基因组背景

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参见中的Ttc13基因组数据查看器
位置：
8 E2；872.81立方厘米
外显子计数：
25
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 8 NC_000074.7（125398066..125448748，补码）
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 8 NC_000074.6（124671327..124722011，补充）

染色体8-NC_000074.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_23008 Neighboring gene calpain 9 Neighboring gene RIKEN cDNA 2310022B05 gene Neighboring gene VISTA enhancer mm1665 Neighboring gene predicted gene, 46058 Neighboring gene predicted gene, 30273 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr8:127246145-127246328 Neighboring gene ARV1 homolog, fatty acid homeostasis modulator Neighboring gene family with sequence similarity 89, member A Neighboring gene general transcription factor IIB pseudogene

基因组区域、转录物和产物

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表达式

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  • 项目名称：小鼠ENCODE转录组数据
  • 描述：鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目：PRJNA66167型
  • 出版物：PMID 25409824
  • 分析日期：无

参考文献

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PubMed中的相关文章

  1. BayGenomics：小鼠胚胎干细胞插入突变资源。 史崔克·D，等《核酸研究》，2003年1月1日。PMID 12520002，免费PMC文章
  2. 富含选择性剪接外显子的文库揭示了黑素细胞和黑色素瘤中的剪接模式。 Watahiki A，等Nat Methods，2004年12月，PMID 15782199
  3. C57BL/6N小鼠胚胎干细胞中的大规模基因捕获。 Hansen总经理，等《基因组研究》，2008年10月，PMID 18799693，免费PMC文章
  4. 归一化和减法：促进基因发现的两种方法。 博纳尔多MF，等《基因组研究》，1996年9月，PMID 8889548
  5. Wnk1激酶缺乏可降低小鼠血压：一种基因陷阱筛查，用于确定治疗干预的潜在靶点。 赞布罗维茨英国石油公司，等美国国家科学院院刊，2003年11月25日。PMID 14610273，免费PMC文章

查看PubMed中的所有（13）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

变更

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等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载（MGI）
  • 核酸内切酶介导（1）

一般基因信息

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标记

同源性

克隆名称

  • MGC28881、MGC105232

基因本体论 由MGI提供

功能 证据代码 酒吧
启用molecular_function ND（无损检测）
无可用生物数据
更多信息
  
过程 证据代码 酒吧
涉及生物过程 ND（无损检测）
无可用生物数据
更多信息
  
组件 证据代码 酒吧
在细胞组件中是活动的 ND（无损检测）
无可用生物数据
更多信息
  

一般蛋白质信息

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首选名称
四三肽重复蛋白13

NCBI参考序列（参考序列）

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新的 尝试新的成绩单

独立于注释维护的参考序列基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001357355.2→NP_001344284.1号四三肽重复蛋白13亚型1前体

    状态：已验证

    源序列
    AC135015、AC151736
    共识CDS
    CCDS90481.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    E9Q723型,第3季度
    相关的
    ENSMUSP00000113383.3号,ENSMUST00000118134.3号
    保守领域（2）总结
    COG0457公司
    位置：130→314
    TPR；四三肽（TPR）重复[仅限一般功能预测]
    sd00006美元
    位置：181→209
    TPR；TPR重复[结构图案]

  2. 纳米_001357356.2→NP_001344285.1型四三肽重复蛋白13亚型2前体

    状态：已验证

    源序列
    AC135015、AC151736
    共识CDS
    CCDS90480.1型
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A338P6N2型,第3季度
    相关的
    ENSMUSP00000156040.2,ENSMUST00000231984.2号
    保守领域（2）总结
    COG0457公司
    位置：71→238
    TPR；四三肽（TPR）重复[仅限一般功能预测]
    sd00006美元
    位置：173→201
    TPR；TPR重复[结构图案]

  3. NM_001357357.2→NP_001344286.1号四肽重复蛋白13亚型3前体

    状态：已验证

    源序列
    AC135015、AC151736
    共识CDS
    CCDS90482.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    D3YVV0型,第3季度
    相关的
    ENSMUSP00000114043.3公司,ENSMUST00000117624.9号
    保守领域（2）总结
    COG0457公司
    位置：99→260
    TPR；四三肽（TPR）重复[仅限一般功能预测]
    sd00006美元
    位置：164→189
    TPR；TPR重复[结构图案]

  4. NM_001373939.1号→NP_001360868.1号四三肽重复蛋白13亚型4前体

    状态：已验证

    源序列
    AC135015、AC151736
    UniProtKB/TrEMBL公司
    第3季度
    保守领域（2）总结
    老虎02917
    位置：104→403
    PEP_TPR_lipo；推测的PEP-CTERM系统TPR-重复脂蛋白
    sd00006美元
    位置：234→262
    TPR；TPR重复[结构图案]

  5. NM_001373940.1→NP_001360869.1号四三肽重复蛋白13亚型6前体

    状态：已验证

    源序列
    AC135015、AC151736
    UniProtKB/TrEMBL公司
    第3季度
    保守领域（2）总结
    COG0457公司
    位置：130→314
    TPR；四三肽（TPR）重复[仅限一般功能预测]
    sd00006美元
    位置：181→209
    TPR；TPR重复[结构图案]

  6. 纳米_001373941.1→NP_001360870.1号四三肽重复蛋白13亚型7前体

    状态：已验证

    源序列
    AC135015、AC151736
    UniProtKB/TrEMBL公司
    第3季度
    相关的
    ENSMUSP000000038484.9号,ENSMUST0000004161.15
    保守领域（2）总结
    COG0457公司
    位置：71→238
    TPR；四三肽（TPR）重复[仅限一般功能预测]
    sd00006美元
    位置：173→201
    TPR；TPR重复[结构图案]

  7. NM_001373943.1号→NP_001360872.1号四三肽重复蛋白13亚型5前体

    状态：已验证

    源序列
    AC135015、AC151736
    共识CDS
    CCDS90483.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A1L1SSC7型,第3季度第4季度
    相关的
    ENSMUSP00000149848.2,ENSMUST00000214828.2
    保守领域（2）总结
    钨极氩弧焊R02917
    位置：104→403
    PEP_TPR_首次公开募股；推测的PEP-CTERM系统TPR-重复脂蛋白
    sd00006美元
    位置：234→262
    TPR；TPR重复[结构图案]

注释基因组的参考序列：GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000074.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    125398066..125448748补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. XM_036153978.1号→XP_036009871.1号四三肽重复蛋白13亚型X2

    UniProtKB/TrEMBL公司
    第3季度
    保守领域（2）总结
    钨极氩弧焊R02917
    位置：104→372
    PEP_TPR_lipo；推测的PEP-CTERM系统TPR-重复脂蛋白
    sd00006美元
    位置：203→231
    TPR；TPR重复[结构图案]

  2. XM_006530966.5号→XP_006531029.1号四三肽重复蛋白13亚型X1

    UniProtKB/TrEMBL公司
    第3季度
    保守领域（2）总结
    钨极氩弧焊R02917
    位置：104→372
    PEP_TPR_首次公开募股；推测的PEP-CTERM系统TPR-重复脂蛋白
    sd00006美元
    位置：203→231
    TPR；TPR重复[结构图案]

  3. XM_017312765.1号→XP_017168254.1号四三肽重复蛋白13亚型X4

    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q68FG8号机组
    保守领域（1）总结
    sd00006美元
    位置：26→56
    TPR；TPR重复[结构图案]

  4. XM_036153979.1号→XP_036009872.1号四三肽重复蛋白13亚型X3

    保守领域（2）总结
    钨极氩弧焊R02917
    位置：104→403
    PEP_TPR_首次公开募股；推测的PEP-CTERM系统TPR-重复脂蛋白
    sd00006美元
    位置：234→262
    TPR；TPR重复[结构图案]

核糖核酸

  1. XR_001778436.2号RNA序列

  2. XR_878807.4号RNA序列

  3. XR_004934821.1号RNA序列

抑制的参考序列

以下参考序列已被抑制。解释

  1. NM_145607.3：抑制的序列

    描述
    NM_145607.3:此RefSeq被删除，因为当前对转录物和蛋白质的支持不足。
核苷酸 蛋白质 应变
标题 访问和版本

基因链接输出

以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

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