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阿尔及利亚12ALG12α-1,6-核糖基转移酶[小家鼠(家鼠)]

基因ID:223774,更新日期2024年3月5日

总结

官方符号
阿尔及利亚12由提供管理信息
官方全名
ALG12α-1,6-核糖基转移酶由提供管理信息
主要来源
MGI:MGI:2385025
参见相关内容
乐团:ENSMUSG00000035845 联盟基因组:MGI:2385025
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
也称为
电子商务39
总结
预计可激活α-1,6-甘露糖转移酶活性。预计参与蛋白质N-连接糖基化。预计作用于多利考键低聚糖生物合成过程的上游或内部。预计位于内质网腔和膜。预计为膜的组成部分。预计在内质网膜中具有活性。该基因的人类同源基因与先天性糖基化免疫球蛋白紊乱有关。与人ALG12同源(ALG12α-1,6-甘露糖转移酶)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
卵巢成体(RPKM 11.5)、睾丸成体(RTKM 11.0)和28个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源
新的
尝试新的基因表
尝试新的成绩单

基因组背景

参见中的Alg12基因组数据查看器
位置:
15 E3;15 44.3立方厘米
外显子计数:
10
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 15 NC_000081.7(88689448..88703498,补码)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 15 NC_000081.6(88805243..88819318,补码)

染色体15-NC_000081.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene bromodomain containing 1 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_39439 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E9918 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E5507 Neighboring gene zinc finger, BED type containing 4 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_39444 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E391 Neighboring gene cysteine-rich with EGF-like domains 2 Neighboring gene predicted gene, 23144

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:小鼠ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

参考文献

PubMed中的相关文章

变更

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
  • 核酸内切酶介导(3)

PubChem的途径

一般蛋白质信息

首选名称
dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-dolα-1,6-甘露糖基转移酶
姓名
天冬酰胺连接糖基化12(α-1,6-甘露糖基转移酶)
天冬酰胺连接的糖基化12同源物(酵母,α-1,6-甘露糖基转移酶)
天冬酰胺连接糖基化蛋白12同源物
dolichyl-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-寡酰基-α-1,6-甘露糖转移酶
甘露糖转移酶ALG12同源物
NP_001135829.1号
NP_001402946.1号
NP_001402947.1
NP_001402948.1
NP_663452.1号

NCBI参考序列(参考序列)

新的 尝试新的成绩单

独立于注释维护的参考序列基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001142357.2NP_001135829.1号dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-dolα-1,6-甘露糖基转移酶亚型1

    参见NP_001135829.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    转录变体:该变体(1)代表较长的转录,编码较长的亚型(1)。
    源序列
    AC117700型
    共识CDS
    CCDS49694.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    Q3UQK8号,Q8VDB2型
    相关的
    ENSMUSP00000123935.2号,ENSMUST0000012183.8号
    保守领域(1)总结
    第21590条
    位置:17405
    PMT_2;磷酸Dolichyl甘露糖蛋白甘露糖基转移酶
  2. NM_001416017.1NP_001402946.1型dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-dolα-1,6-甘露糖基转移酶亚型1

    状态:已验证

    源序列
    AC117700型
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    Q3UQK8号,Q8VDB2型
  3. NM_001416018.1号NP_001402947.1dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-dolα-1,6-甘露糖基转移酶亚型1

    状态:已验证

    源序列
    AC117700型
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    Q3UQK8号,Q8VDB2型
  4. NM_001416019.1NP_001402948.1dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-dolα-1,6-甘露糖基转移酶亚型3

    状态:已验证

    源序列
    AC117700型
  5. 45477.3纳米NP_663452.1号dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-dolα-1,6-甘露糖基转移酶亚型2

    参见NP_663452.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    转录变异体:与变异体1相比,该变异体(2)使用一个替代剪接位点,在中央编码区缺少两个外显子。与亚型1相比,编码亚型(2)较短。
    源序列
    AC117700型
    共识CDS
    CCDS27732.1号
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q8VCA2问题
    相关的
    ENSMUSP00000043480.9号,ENSMUST00000043087.15号
    保守领域(1)总结
    第21590条
    位置:17232
    PMT_2;多利基磷酸-甘露糖基转移酶

核糖核酸

  1. 编号_183241.1RNA序列

    状态:已验证

    源序列
    AC117700型
  2. 编号:183242.1RNA序列

    状态:已验证

    源序列
    AC117700型
  3. 编号:183243.1RNA序列

    状态:已验证

    源序列
    AC117700型

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定的基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000081.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    88689448.88703498补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)