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维姆波形蛋白[小家鼠(家鼠)]

基因ID:22352,更新于2024年9月24日

总结

官方符号
维姆由提供MGI公司
官方全名
波形蛋白由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:98932
请参阅相关
乐团:ENSMUSG00000026728 联盟基因组:MGI:98932
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
总结
启用RNA结合活性。细胞骨架的结构成分和晶状体的结构成分。参与中间丝组织和基因表达的正调控。作用于多个过程的上游或内部,包括SMAD蛋白信号转导;星形胶质细胞分化;以及细胞对干扰素-γ的反应。位于多个蜂窝组件中,包括蜂窝前缘;中间丝;和吞噬囊泡。以多种结构表达,包括消化系统;脑;泌尿生殖系统;心脏;和感觉器官。用于研究白内障30。与动脉粥样硬化相关的该基因的人类同源基因;自身免疫性疾病(多发);白内障30例。与人类VIM(vimentin)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
在皮下脂肪垫成人(RPKM 622.6)、乳腺成人(RPKM 524.7)和24个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源
新款
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基因组背景

请参阅中的Vim基因组数据查看器
位置:
2 A1;2 10.04立方厘米
外显子计数:
9
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 2 NC_000068.8(13579122..13587637)
108.20200622 上一个程序集 GRC第38页第6页(GCF_000001635.26号) 2 NC_000068.7(13574311..13582826)

染色体2-NC_000068.8描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_03709 Neighboring gene predicted gene, 54102 Neighboring gene predicted gene 9875 Neighboring gene ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_03712 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_03715 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E3359 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E10082 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E7793 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_03717 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_03718 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_03719 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_03720 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_03721 Neighboring gene 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:邮编61617
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

参考文献

PubMed中的相关文章

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

变更

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

PubChem的途径

相互作用

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

克隆名称

  • MGC102095型

基因本体论 MGI提供

功能 证据代码 酒吧
启用RNA结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
支持双链RNA结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
公共医学 
实现相同的蛋白质结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
实现相同的蛋白质结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使角蛋白丝结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
使角蛋白丝结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
启用激酶结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
启用分子适配器活动 国际标准化组织
从序列正交推断
更多信息
 
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
实现蛋白质域特异性结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
实现蛋白质域特异性结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使蛋白磷酸酶2A结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使蛋白质酪氨酸激酶结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使支架蛋白结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
使支架蛋白结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使细胞骨架的结构成分成为可能 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
使细胞骨架的结构成分成为可能 进口
由突变表型推断
更多信息
公共医学 
使细胞骨架的结构成分成为可能 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使眼睛晶状体的结构成分 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
过程 证据代码 酒吧
acts_upstream_of_or_within Bergmann胶质细胞分化 进口
由突变表型推断
更多信息
公共医学 
星形胶质细胞发育中的上游活动 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
参与细胞对脂多糖的反应 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细胞对脂多糖的反应 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
参与细胞对胞壁二肽的反应 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细胞对胞壁二肽的反应 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
acts_upstream_of_or细胞内对II型干扰素的反应 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
涉及中间纤维组织 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
acts _上游_of _或中间纤维组织内 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
涉及中间纤维组织 进口
由突变表型推断
更多信息
公共医学 
acts_upstream_of_or中间丝状流程内 进口
由突变表型推断
更多信息
公共医学 
acts_upstream_of_or透镜内纤维细胞开发 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
acts_upstream_of_or对神经元投射发育的负调控 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
神经元投射发展的上游行为 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
参与胶原生物合成过程的正调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与胶原生物合成过程的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与上皮细胞迁移的正调控 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
参与基因表达的正调控 进口
由突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与胶质细胞增殖的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与雪旺细胞迁移的调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与轴突发生的调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与mRNA稳定性的调节 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与mRNA稳定性的调节 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
组件 证据代码 酒吧
轴突活动 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于轴突中 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于单元格体中 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于单元格前沿 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
在单元格投影中定位 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
在单元格投影中定位 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
细胞质中有活性 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于细胞质中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
位于细胞质中 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位于细胞骨架 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
公共医学 
定位于胞浆中 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
定位于胞浆中 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
中间灯丝中的is_active 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于中间灯丝中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
位于中间灯丝中 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位于中间丝细胞骨架 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位神经元投射 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
在核矩阵中定位 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
位于细胞质核周区 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位于过氧化物酶体 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
定位于过氧化物酶体 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于吞噬小泡内 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
血浆中的is_active 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
定位于质膜 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
位于III型中间灯丝中 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_011701.4号NP_035831.2号波形蛋白

    参见NP_035831.2的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    源序列
    133726肯尼亚先令
    共识CDS
    CCDS15696.1号
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    O08704号,第20152页,问题8CCH1
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3U6S1型,Q3V2S4系列,Q5FWJ3号机组
    相关的
    ENSMUSP00000028062.3,ENSMUST00000028062.8号
    保守领域(2)总结
    pfam00038型
    位置:102410
    长丝;中间丝蛋白
    pfam04732型
    位置:14101
    灯丝头;中间丝头(DNA结合)区

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000068.8参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    13579122..13587637
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)