美国国旗

美国政府的官方网站

格式

发送至：

选择目的地

美国资产负债管理委员会活化白细胞粘附分子[智人（人类）]

基因ID:214，更新日期2024年5月5日

总结

转到页面顶部 帮助
官方符号
美国资产负债管理委员会由提供HGNC公司
官方全名
活化白细胞粘附分子由提供HGNC公司
主要来源
HGNC:HGNC:400
请参阅相关
乐团：ENSG00000170017 MIM:601662； 联盟基因组：HGNC:400
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
检验过的
有机体
智人
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；灵长类；Haplorhini；卡塔里尼；人科；人类
也称为
MEMD；CD166型
总结
该基因编码活化的白细胞粘附分子（ALCAM），也称为CD166（分化簇166），是免疫球蛋白受体亚家族的一员，在细胞外区域具有五个免疫球蛋白样结构域（VVC2C2C2）。该蛋白与T细胞分化抗原CD6结合，参与细胞粘附和迁移过程。已发现编码不同亚型的多种交替剪接转录变体。[由RefSeq提供，2011年8月]
表达式
在肺（RPKM 33.7）、脑（RPKM28.3）和24个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源
鼠标 全部的
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

转到页面顶部 帮助
请参阅中的ALCAM基因组数据查看器
位置：
2011年第3季度
外显子计数：
16
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 三 NC_000003.12（105366909..105576900）
2003年10月10日 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 三 NC_060927.1（108084937..108294916）
105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 三 NC_000003.11（105085753..105295744）

3号染色体-NC_000003.12描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene uncharacterized LOC107986108 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr3:104415525-104416025 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr3:104623147-104623701 Neighboring gene Neanderthal introgressed variant-containing enhancer experimental_64126 Neighboring gene uncharacterized LOC105374023 Neighboring gene OCT4-NANOG hESC enhancer GRCh37_chr3:104875813-104876646 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr3:105015351-105015980 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 20192 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr3:105072122-105072940 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 14580 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr3:105087774-105088274 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr3:105088275-105088775 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 20195 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 14581 Neighboring gene MED14-independent group 3 enhancer GRCh37_chr3:105120863-105122062 Neighboring gene uncharacterized LOC124906263 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr3:105222974-105223504 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr3:105223505-105224035 Neighboring gene P300/CBP strongly-dependent group 1 enhancer GRCh37_chr3:105438452-105439651 Neighboring gene Cbl proto-oncogene B Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 14582 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 20196 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 20197 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 20198 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 14583 Neighboring gene uncharacterized LOC105374024

基因组区域、转录物和产物

转到页面顶部 帮助

表达式

转到页面顶部 帮助
  • 项目名称：HPA RNA-seq正常组织
  • 描述：对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq，以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
  • 生物项目：项目编号：4337
  • 出版物：邮编24309898
  • 分析日期：2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

转到页面顶部帮助

PubMed上的相关文章

  1. ALCAM在临床结肠癌中的表达及其与患者治疗反应的关系。 方Z，等在维梧，2023年5月-6月。PMID 37103072，免费PMC文章
  2. ALCAM，活化白细胞粘附分子，临床胃癌和患者对化疗的反应。 杨扬，等《抗癌研究》，2023年4月，PMID 36974802
  3. 活化白细胞粘附分子（ALCAM），胃肠道肿瘤腹膜转移中潜在的“种子”和“土壤”受体。 杨扬，等《国际分子科学杂志》，2023年1月3日。PMID 36614319，免费PMC文章
  4. 自身免疫性肝炎中肝内活化的白细胞粘附分子诱导CD6（高）CD4（+）T细胞浸润。 钱Q，等《Front Immunol》，2022年。PMID 36159854，免费PMC文章
  5. 苯扎鲁胺耐药细胞株的蛋白质组分析和血清分析确定ALCAM是去势耐药前列腺癌的耐药标记物。 西兹马里克A，等《国际癌症杂志》，2022年10月15日。PMID 35689436，免费PMC文章

查看PubMed中的所有（198）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？
  1. CD166和HER-2在不同类型胃癌中的临床意义。
    标题：CD166和HER-2在不同类型胃癌中的临床意义。
  2. 人类少突胶质细胞上的ALCAM介导CD4 T细胞粘附。
    标题：人类少突胶质细胞上的ALCAM介导CD4 T细胞粘附。
  3. ALCAM在临床结肠癌中的表达及其与患者治疗反应的关系。
    标题：ALCAM在临床结肠癌中的表达及其与患者治疗反应的关系。
  4. ALCAM，活化白细胞粘附分子，临床胃癌和患者对化疗的反应。
    标题：ALCAM，活化白细胞粘附分子，用于临床胃癌和患者对化疗的反应。
  5. 血浆中ALCAM和VCAM-1的增加可预测阿尔茨海默病。
    标题：血浆中ALCAM和VCAM-1的增加预示着阿尔茨海默病。
  6. 活化白细胞粘附分子（ALCAM），胃肠道肿瘤腹膜转移中潜在的“种子”和“土壤”受体。
    标题：活化白细胞粘附分子（ALCAM），胃肠道肿瘤腹膜转移中潜在的“种子”和“土壤”受体。
  7. 自身免疫性肝炎中肝内活化的白细胞粘附分子诱导CD6（高）CD4（+）T细胞浸润。
    标题：自身免疫性肝炎中肝内激活的白细胞粘附分子诱导CD6（高）CD4（+）T细胞浸润。
  8. 苯扎鲁胺耐药细胞株的蛋白质组分析和血清分析确定ALCAM是去势耐药前列腺癌的耐药标记物。
    标题：苯扎鲁胺耐药细胞株的蛋白质组分析和血清分析确定ALCAM是去势耐药前列腺癌的耐药标记物。
  9. 基因变异对前列腺癌进展的影响：淋巴细胞调节剂、活化和细胞粘附基因变异的贡献。
    标题：基因变异对前列腺癌进展的影响：淋巴细胞调节剂、活化和细胞粘附基因变异的贡献。
  10. 尿ALCAM、PF4和VCAM-1在识别儿童发病的系统性红斑狼疮的肾炎疾病活动性方面超过常规指标。
    标题：尿ALCAM、PF4和VCAM-1在识别儿童发作性系统性红斑狼疮肾炎疾病活动性方面超过了传统指标。
提交： 新GenerRIF 更正 查看所有GenerRIF（147）

表型

转到页面顶部 帮助

在NIH基因检测注册中心（GTR）查找该基因的测试

使用PheGenI回顾该区域的eQTL和表型关联数据

EBI GWAS目录

说明
中国汉族人群典型散发性肌萎缩侧索硬化症的基因组关联研究结合通路分析。
EBI GWAS目录
基因组流行病学协会心脏和衰老研究队列中血浆N6多不饱和脂肪酸的全基因组关联研究。
EBI GWAS目录
使用DCCT/EDIC研究队列，初步全基因组关联搜索确定了1型糖尿病勃起功能障碍风险的潜在位点。
EBI GWAS目录

变更

转到页面顶部 帮助

参见ClinVar中的变量

参见dbVar中的研究和变体

参见变体查看器（GRCh37.p13）

参见变体查看器（GRCh38）

基因型

HIV-1相互作用

转到页面顶部 帮助

复制交互

互动 酒吧
siRNA敲除活化的白细胞粘附分子（ALCAM）可增强感染病毒假型HIV89.6R和HIV8.2N的HeLa-CD4细胞中HIV-1复制的早期阶段 公共医学

转到HIV-1人类交互数据库

PubChem的途径

转到页面顶部

互动

转到页面顶部 帮助
产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 说明

一般基因信息

转到页面顶部 帮助

标记

同源性

克隆名称

  • FLJ38514、MGC71733

基因本体论 GOA提供

功能 证据代码 酒吧
实现相同的蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
启用信号受体结合 TAS公司
可追踪作者声明
更多信息
 公共医学 
过程 证据代码 酒吧
参与适应性免疫反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与轴突延伸参与轴突引导 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  
参与细胞粘附 IBA公司
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
参与细胞粘附 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  
通过质膜细胞粘附分子参与异质性细胞间粘附 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与运动神经元轴突引导 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与神经元投射延伸 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  
参与视网膜神经节细胞轴突引导 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  
参与信号转导 TAS公司
可追踪作者声明
更多信息
 公共医学 
组件 证据代码 酒吧
T细胞受体复合体的一部分 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
位于轴突中 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  
在枝晶中定位 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
位于质膜外侧 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
定位于胞外外体 HDA公司 公共医学 
局部粘着 HDA公司 公共医学 
定位免疫突触 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
定位于神经元细胞体 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
血浆中的is_active IBA公司
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
定位于质膜 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
定位于质膜 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  

一般蛋白质信息

转到页面顶部 帮助
首选名称
CD166抗原

NCBI参考序列（RefSeq）

转到页面顶部 帮助

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

基因组学

  1. NG_029729.2参考序列基因

    范围
    5002..214993
    下载
    GenBank（基因银行），美国金融服务贸易协会，序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. NM_001243280.2→NP_001230209.1号CD166抗原亚型2前体

    参见NP_001230209.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已审阅

    说明
    转录变体：与变体1相比，该变体（2）在3'CDS中缺少一个框架内外显子。与同种型1相比，得到的同种型（2）在C末端区域缺乏内部片段。
    源序列
    AC023602、AC078806
    共识CDS
    CCDS58841.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    B3KNN9型
    相关
    ENSP0000419236.2号机组，ENST00000472644.6号
    保守领域（5）总结
    智能00406
    位置：38→113
    IGv；免疫球蛋白V型
    智能00410
    位置：255→329
    IG_类；免疫球蛋白样
    pfam08205型
    位置：137→231
    C2-set_2；CD80样C2-set免疫球蛋白结构域
    pfam13927型
    位置：256→313
    Ig_3；免疫球蛋白结构域
    第11960条
    位置：415→488
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  2. NM_001243281.2→NP_001230210.1号CD166抗原亚型3前体

    状态：已审阅

    说明
    转录变体：与变体1相比，该变体（3）具有更短且不同的3'序列。与亚型1相比，生成的亚型（3）在C末端被截断。
    源序列
    AC023602、AC078806、KF457664
    UniProtKB/TrEMBL公司
    B3KNN9英镑
    保守领域（5）总结
    智能00406
    位置：38→113
    IGv；免疫球蛋白V型
    智能00410
    位置：255→329
    IG_类；免疫球蛋白样
    pfam08205型
    位置：137→231
    C2-set_2；CD80样C2-set免疫球蛋白结构域
    pfam13927型
    位置：256→313
    Ig_3；免疫球蛋白结构域
    第11960条
    位置：415→488
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

  3. NM_001243283.2号→NP_001230212.1型CD166抗原亚型4前体

    参见NP_001230212.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已审阅

    说明
    转录变体：与变体1相比，该变体（4）缺少多个3'外显子，并且具有交替的3'序列。得到的亚型（4）最短；与亚型1相比，它在C末端被截断。
    源序列
    AY644765、BC041127、DA318514
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    问题13740
    相关
    ENST00000470756.5标准
    保守领域（2）总结
    智能00406
    位置：38→113
    IGv；免疫球蛋白V型
    智能00410
    位置：36→130
    IG_类；免疫球蛋白样

  4. NM_001627.4→NP_001618.2号CD166抗原亚型1前体

    参见NP_001618.2的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已审阅

    说明
    转录变体：该变体（1）编码最长的亚型（1）。
    源序列
    AC023602、AC078806
    共识CDS
    CCDS33810.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RNS3型，B4DTU0，O60892号机组，问题13740，Q1HGM8问题，问题1HGM9，问题6PEY4，Q6ZS95型
    UniProtKB/TrEMBL公司
    B3KNN9型
    相关
    ENSP00000305988.5标准，ENST00000306107.9标准
    保守领域（6）总结
    智能00406
    位置：38→113
    IGv；免疫球蛋白V型
    智能00409
    位置：255→329
    IG；免疫球蛋白
    智能00410
    位置：339→393
    IG_类；免疫球蛋白样
    pfam08205型
    位置：137→231
    C2-set_2；CD80样C2-set免疫球蛋白结构域
    pfam13927型
    位置：415→489
    Ig_3；免疫球蛋白结构域
    cd00096
    位置：128→132
    免疫球蛋白；Ig链A[结构基序]

注释基因组的参考序列：GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCh38.p14一次组件

基因组学

  1. NC_000003.12参考GRCh38.p14主要组件

    范围
    105366909..105576900
    下载
    GenBank（基因银行），美国金融服务贸易协会，序列查看器（图形）

备选T2T-CHM13v2.0

基因组学

  1. NC_060927.1替代T2T-CHM13v2.0

    范围
    108084937..108294916
    下载
    GenBank（基因银行），美国金融服务贸易协会，序列查看器（图形）
核苷酸 蛋白质
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
问题13740.2 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q13740

基因链接输出

以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

化学信息
分子生物学数据库
研究材料
工具
其他