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Nfkb2号B细胞中κ轻多肽基因增强子的核因子2,p49/p100[小家鼠(家鼠)]

基因ID:18034,更新日期2024年5月12日

总结

官方符号
Nfkb2号由提供MGI公司
官方全名
B细胞中κ轻多肽基因增强子的核因子2,p49/p100由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:1099800
请参阅相关
乐团:ENSMUSG00000025225 联盟基因组:MGI:1099800
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
也称为
lyt;第49页;第52页;p50B;第49页/第100页;NF-kappaB2
总结
预测可启用DNA-结合转录激活物活性、RNA聚合酶II特异性和RNA聚合物II顺调控区序列特异性DNA结合活性。作用于多个过程的上游或内部,包括NIK/NF-kappaB信号;滤泡树突状细胞分化;和生发中心的形成。位于核心。以多种结构表达,包括早期概念;泌尿生殖系统;肌肉组织;胸腺原基;三叉神经节。用于研究常见变量免疫缺陷。该基因的人类同源基因与常见变量免疫缺陷有关。与人NFKB2(核因子κB亚单位2)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
在成年脾脏(RPKM 67.0)、成年乳腺(RPKM 33.7)和其他15种组织中广泛表达查看更多
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

请参阅中的Nfkb2基因组数据查看器
位置:
19 C3;19 38.8厘米
外显子计数:
23
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 19 NC_000085.7(46285478..46300839)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 19 NC_000085.6(46300994..46312400)

染色体19-NC_000085.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E11034 Neighboring gene ELOVL fatty acid elongase 3 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E101 Neighboring gene paired-like homeodomain transcription factor 3 Neighboring gene golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1 Neighboring gene U1 small nuclear ribonucleoprotein C pseudogene Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_46298 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E11035 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_46300 Neighboring gene RIKEN cDNA 4833438C02 gene Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E9457 Neighboring gene pleckstrin and Sec7 domain containing Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E973 Neighboring gene F-box and leucine-rich repeat protein 15 Neighboring gene CUE domain containing 2 Neighboring gene predicted gene, 36493 Neighboring gene microRNA 146b

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

参考文献

PubMed中的相关文章

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

变更

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

PubChem的途径

互动

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 说明

一般基因信息

标记

基因本体论 由MGI提供

过程 证据代码 酒吧
参与典型NF-kappaB信号转导 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与典型NF-kappaB信号转导 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细胞应激反应 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
acts_upstream_of_or细胞外基质组织内 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
acts上游或滤泡内树突状细胞分化 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
acts上游of或在生发中心形成内 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与炎症反应 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与先天性免疫反应 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
淋巴结发育中的上游活动 塔斯
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
参与非规范NF-kappaB信号转导 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与非规范NF-kappaB信号转导 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与RNA聚合酶II对转录的正调控 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与RNA聚合酶II对转录的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与DNA模板转录的调节 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细胞因子反应 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
动作_上游_of_或节律过程中 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与信号转导 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
脾脏发育中的上游活动 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
组件 证据代码 酒吧
Bcl3/NF-kappaB2复合物的一部分 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
细胞质中有活性 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于细胞质中 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位于胞浆中 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
核质定位 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
在核心中是活动的 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于核内 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
位于核内 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 

一般蛋白质信息

首选名称
核因子NF-kappa-B p100亚单位
姓名
DNA-结合因子KBF2
NF-κB2

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001177369.1NP_001170840.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型a

    参见NP_001170840.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    说明
    转录变体:与变体1相比,该变体(2)表示使用替代启动子和5'UTR。变体1和2编码相同的亚型(a),比亚型b短。
    源序列
    AC114539、AK137680、AK150012
    共识CDS
    CCDS29874.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    Q9重量5
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3UG25问题,第3季度ULT8,2015年第三季度
    相关的
    ENSMUSP00000072859.6号,ENSMUST00000073116.13
    保留域(7)总结
    cd07934
    位置:38221
    RHD-n_NFkB2;核因子κB2(NF-kappa B2)Rel同源结构域(RHD)的N末端亚结构域
    人民币08798元
    位置:774849
    死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
    cd00204号
    位置:483620
    ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
    cd01177号
    位置:228327
    IPT_NFkappaB;转录因子NFkappaB和相关转录因子的IPT结构域。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
    辉瑞12796
    位置:531628
    Ank_2;Ankyrin重复(3份)
    pfam13637型
    位置:488547
    Ank_4;Ankyrin重复(多份)
    sd00045美元
    位置:599630
    ANK;ANK重复[结构图案]
  2. NM_001177370.1NP_001170841.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型B

    参见NP_001170841.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    说明
    转录变体:与变体1相比,该变体(3)在3'编码区域中使用了一个替代的帧内拼接位点。尚未确定此变体的5'UTR范围。与亚型a相比,产生的亚型(b)在C末端区域包含一个额外的残基。
    源序列
    AC114539型
    UniProtKB/TrEMBL公司
    第3季度ULT8,2015年第三季度,Q4U105问题
    相关的
    ENSMUSP00000158143.2公司,ENSMUST00000237791.2
    保守领域(5)总结
    cd07934
    位置:38221
    RHD-n_NFkB2;核因子κB2(NF-kappa B2)Rel同源结构域(RHD)的N末端亚结构域
    cd08798
    位置:774849
    死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
    PHA03095型
    位置:459705
    PHA03095;锚蛋白样蛋白;临时的
    cd01177号
    位置:228327
    IPT_NFkappaB;转录因子NFkappaB和相关转录因子的IPT结构域。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
    sd00045美元
    位置:599630
    ANK;ANK重复[结构图案]
  3. NM_019408.3号NP_062281.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型a

    参见NP_062281.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    说明
    成绩单变体:该变体(1)代表最长的成绩单。变体1和2编码相同的亚型(a),比亚型b短。
    源序列
    AC114539、AK137680、AK150012、BY147052、CJ134893
    共识CDS
    CCDS29874.1号文件
    UniProtKB/瑞士Prot
    Q9重量5
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3UG25问题,第3季度ULT8,2015年第3季度
    相关的
    ENSMUSP00000107512.3,ENSMUST0000011881.4
    保守领域(7)总结
    cd07934
    位置:38221
    RHD-n_NFkB2;核因子κB2(NF-kappa B2)Rel同源结构域(RHD)的N末端亚结构域
    cd08798
    位置:774849
    死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
    cd00204号
    位置:483620
    ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
    cd01177号
    位置:228327
    IPT_NFkappaB;转录因子NFkappaB和相关转录因子的IPT结构域。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
    pfam12796型
    位置:531628
    Ank_2;Ankyrin重复(3份)
    pfam13637型
    位置:488547
    Ank_4;Ankyrin重复(多份)
    sd00045美元
    位置:599630
    ANK;ANK重复[结构图案]

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000085.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    46285478..46300839
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. XM_006526743.5号XP_006526806.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型X1

    参见XP_006526806.1的相同蛋白质及其注释位置

    UniProtKB/TrEMBL公司
    第3季度ULT8,2015年第三季度,Q4U105问题
    保守领域(5)总结
    cd07934
    位置:38221
    RHD-n_NFkB2;核因子κB2(NF-kappa B2)Rel同源结构域(RHD)的N末端亚结构域
    人民币08798元
    位置:774849
    死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
    PHA03095型
    位置:459705
    PHA03095;锚蛋白样蛋白;临时的
    cd01177号
    位置:228327
    IPT_NFkappaB;转录因子NF-κB的IPT结构域和相关转录因子。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
    sd00045美元
    位置:599630
    ANK;ANK重复[结构图案]