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梅斯2梅斯同源盒2[小家鼠(家鼠)]

基因ID:17536,更新日期2024年5月12日

总结

官方符号
梅斯2由提供管理信息
官方全名
梅斯同源盒2由提供管理信息
主要来源
MGI:MGI:108564
请参阅相关
乐团:ENSMUSG00000027210 联盟基因组:MGI:108564
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
检验过的
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;Mus公司
也称为
Mrg1;Stra10;A430109D20里亚克
总结
该基因编码属于同源域蛋白TALE(“三氨基酸环延伸”)家族的同源盒蛋白。TALE同源盒蛋白是高度保守的转录调节因子,一些成员已被证明是发育程序的重要贡献者。在小鼠中,该基因敲除导致胚胎第14天死亡,并伴有出血。缺乏该基因的胚胎在神经嵴组织中表现出缺陷,这表明该基因在颅骨和心脏神经嵴细胞发育中起着关键作用。选择性剪接导致多个转录变体。[由RefSeq提供,2016年9月]
表达式
在成人额叶(RPKM 31.3)、中枢神经系统E14(RPKM21.9)和17个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

参见中的Meis2基因组数据查看器
位置:
2 E4-E5;258.28立方厘米
外显子计数:
19
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 2 NC_000068.8(115691745..115897925,补遗)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 2 NC_000068.7(115861264..116067537,补体)

染色体2-NC_000068.8描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene CDAN1 interacting nuclease 1 Neighboring gene predicted gene, 52524 Neighboring gene predicted gene, 31590 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_05429 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_05430 Neighboring gene RIKEN cDNA G630016G05 gene Neighboring gene RIKEN cDNA 2810405F15 gene Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_05431 Neighboring gene predicted gene, 57693

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

参考文献

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

变更

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

互动

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

基因本体论 由MGI提供

组件 证据代码 酒吧
位于细胞质中 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
在核心中是活动的 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于核内 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 

一般蛋白质信息

首选名称
同源盒蛋白Meis2
姓名
Cbp/p300与Glu/Asp-富含羧基末端结构域2相互作用的反式激活子
meis1相关蛋白1
髓系嗜生态病毒整合位点相关基因1

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

信使核糖核酸和蛋白质

  1. NM_001136072.2号NP_001129544.1号同源盒蛋白Meis2亚型1

    参见NP_001129544.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(1)在5'和3'UTR中不同,并且在编码区域中有多重差异。与亚型9相比,编码亚型(1)较短,具有不同的N和C末端。
    源序列
    AK146633,铝929037
    共识CDS
    CCDS50666.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题,Q3UJ35型
    相关的
    ENSMUSP00000106533.3公司,ENSMUST00000110908.9
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:294333
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:110194
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  2. NM_001159567.1NP_001153039.1号同源盒蛋白Meis2亚型3

    参见NP_001153039.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(3)在5'和3'UTR中不同,并且在编码区域中有多重差异。与亚型9相比,编码亚型(3)较短,具有不同的N和C末端。
    源序列
    AK146633、AK158839、AL929037
    共识CDS
    CCDS50668.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题
    相关的
    ENSMUSP00000106532.2号机组,库存00000110907.8
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:294333
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:110194
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  3. NM_001159568.1NP_001153040.1号同源盒蛋白Meis2亚型4

    参见NP_001153040.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(4)在5’UTR中不同,并且在编码区域中有多个差异。与亚型9相比,编码亚型(4)较短,并且具有明显的N末端。
    源序列
    AK146633、AL929037、CX568764
    共识CDS
    CCDS50667.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    O35676号,O35677号机组,第97367页,第97403页,第97404页
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题
    相关的
    ENSMUSP000000028639.7号,ENSMUST00000028639.13号
    保守领域(2)总结
    辉瑞05920
    位置:294333
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:110194
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  4. NM_001159569.2号NP_001153041.1号同源盒蛋白Meis2亚型5

    参见NP_001153041.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(5)在编码区域有多个差异,在3'UTR上也有所不同。与亚型9相比,编码亚型(5)较短,并且具有独特的C末端。
    源序列
    AK146633、AK158839、AL929037、CJ143034
    共识CDS
    CCDS50665.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    B1AWK4号机组,第3季度73
    相关的
    ENSMUSP00000106531.3公司,库存00000110906.9
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:293332
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:109193
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  5. NM_001159570.2NP_001153042.1号同源盒蛋白Meis2亚型6

    参见NP_001153042.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(6)在编码区域有多种差异,在3'UTR上也有所不同。与亚型9相比,编码的亚型(6)较短,并且具有独特的C末端。
    源序列
    AK146633、AK158839、AL929037、CJ143034
    共识CDS
    CCDS50664.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题,Q3TYM2型
    相关的
    ENSMUSP00000073898.7,ENSMUST00000074285.8
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:293332
    Homeobox_KN;Homeobox KN结构域
    pfam16493型
    位置:109193
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  6. NM_001346036.1号NP_001332965.1号同源盒蛋白Meis2亚型9

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:该变体(9)编码最长的亚型(9)。
    源序列
    AK146633、AK158839、AL772135、AL929037、BB612458、BQ572308、CX568764
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题,Q3UJ35型
  7. NM_001346038.1号NP_001332967.1号同源盒蛋白Meis2亚型10

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(10)在编码区中缺少一个替代外显子。编码的同种型(10)比同种型9短。
    源序列
    AK146633、AK158839、AL772135、AL929037、BB612458、CX568764
    UniProtKB/TrEMBL公司
    第3季度73
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:293332
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:109193
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  8. NM_001346041.1号NP_001332970.1同源盒蛋白Meis2亚型11

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(11)在编码区域有多个差异。编码的亚型(11)比亚型9短。
    源序列
    AK146633、AK158839、AL772135、AL929037、BB612458、KM974644
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:293332
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:109193
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  9. NM_001346044.1NP_001332973.1型同源盒蛋白Meis2亚型12

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(12)在编码区域有多种差异,在3'UTR上也有所不同。与亚型9相比,编码的亚型(12)较短,并且具有独特的C末端。
    源序列
    AK146633、AK158839、AL772135、AL929037、BB612458、BQ572308
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题
  10. NM_001346045.1NP_001332974.1号同源盒蛋白Meis2亚型7

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(7)在5'和3'UTR中不同,并且在编码区域中有多个差异。与亚型9相比,编码亚型(7)较短,具有不同的N和C末端。
    源序列
    AK146633、AL772135、AL929037、BQ572308
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题
  11. NM_001346047.1NP_001332976.1号同源异型盒蛋白Meis2亚型8

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(8)在5'和3'UTR中不同,并且在编码区域中有多重差异。与同型9相比,编码的同型(8)更短并且具有不同的N-和C-末端。
    源序列
    AK012325、AK146633、AK158839、AL772135、AL929037、BY012436
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:313352
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:129213
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  12. NM_001346053.1号NP_001332982.1号同源盒蛋白Meis2亚型13

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(14)在5'和3'UTR中不同,并且在编码区域中有多重差异。与亚型9相比,编码亚型(13)较短,具有不同的N和C末端。变体13和14编码相同的亚型(13)。
    源序列
    AK146633、AK158839、AL929037、BY290986
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A0A7EPH8
  13. NM_001346055.1号NP_001332984.1号同源盒蛋白Meis2亚型13

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(13)在5'UTR上不同,使用下游起始密码子,编码区域有多个差异,3'UTR也不同。与同型9相比,编码的同型(13)更短并且具有不同的N-和C-末端。变体13和14编码相同的亚型(13)。
    源序列
    AK146633、AK158839、AL929037、BY290986、CJ143034
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A0A7EPH8
  14. NM_001346056.1号NP_001332985.1号同源盒蛋白Meis2亚型15

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(15)在5'和3'UTR中不同,并且在编码区域中有多重差异。与亚型9相比,编码亚型(15)较短,具有不同的N和C末端。
    源序列
    AK146633、AL929037、BY290986
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A0A7EPH8
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:206245
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:22106
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  15. 纳米_010825.3NP_034955.1号同源盒蛋白Meis2亚型2

    参见NP_034955.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:与变体9相比,该变体(2)在5’UTR中不同,并且在编码区域中有多个差异。与亚型9相比,编码亚型(2)较短,并且具有明显的N末端。
    源序列
    AK146633、AL929037、KM974644
    共识CDS
    CCDS16568.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题,Q6GU28型
    相关的
    ENSMUSP00000099597.4号,ENSMUST00000102538.11号
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:294333
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:110194
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000068.8参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    115691745..115897925补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

信使核糖核酸和蛋白质

  1. XM_036159069.1号支出_036014962.1同源盒蛋白Meis2亚型X12

    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:148187
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:148
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  2. XM_036159067.1号XP_036014960.1型同源盒蛋白Meis2亚型X11

    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:148187
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:148
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  3. 圣诞节_030248227.2XP_030104087.1号同源盒蛋白Meis2亚型X13

    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:148187
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:148
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  4. XM_036159066.1号XP_036014959.1型同源盒蛋白Meis2亚型X10

    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:211250
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:148
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  5. XM_030248221.2号XP_030104081.1号同源盒蛋白Meis2亚型X5

    保守领域(2)总结
    辉瑞05920
    位置:313352
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:129213
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  6. XM_006498871.5号XP_006498934.1号同源盒蛋白Meis2亚型X9

    参见XP_006498934.1的相同蛋白质及其注释位置

    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:313352
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:129213
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  7. 圣诞节_030248224.2XP_030104084.1号同源盒蛋白Meis2亚型X9

    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:313352
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:129213
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  8. XM_036159058.1号XP_036014951.1型同源盒蛋白Meis2亚型X4

    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:313352
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:129213
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  9. XM_036159055.1号XP_036014948.1型同源异型盒蛋白Meis2亚型X2

    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:376415
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:129213
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  10. XM_036159064.1号XP_036014957.1型同源盒蛋白Meis2亚型X7

    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:376415
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:129213
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  11. 圣诞节_011239337.4XP_011237639.1号同源盒蛋白Meis2亚型X1

    参见XP_011237639.1的相同蛋白质及其注释位置

    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:376415
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:129213
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  12. XM_036159061.1号XP_036014954.1型同源盒蛋白Meis2亚型X6

    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:376415
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:129213
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  13. XM_036159065.1号支出_036014958.1同源盒蛋白Meis2亚型X8

    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TY73问题
    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:357396
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:110194
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  14. XM_006498864.5号XP_006498927.1号同源盒蛋白Meis2亚型X3

    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:357396
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    第16493页
    位置:110194
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N-末端
  15. XM_030248225.2号XP_030104085.1号同源盒蛋白Meis2亚型X11

    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:148187
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:148
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端
  16. XM_030248226.2号XP_030104086.1号同源盒蛋白Meis2亚型X12

    保守领域(2)总结
    pfam05920型
    位置:148187
    Homeobox_KN;Homeobox KN域
    pfam16493型
    位置:148
    Meis_PKNOX_N;Homeobox Meis和PKNOX1的N端