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氯化物1克劳丁1[小家鼠(家鼠)]

基因ID:12737,更新于2024年5月12日

总结

官方符号
氯化物1由提供MGI公司
官方全名
水蛭素1由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:1276109
请参阅相关
乐团:ENSMUSG00000022512 联盟基因组:MGI:1276109
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
检验过的
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;Mus公司
总结
该基因编码克劳丁家族的一个成员。Claudins是完整的膜蛋白和紧密连接链的组成部分。紧密连接的股线起着物理屏障的作用,阻止溶质和水自由通过上皮细胞或内皮细胞片之间的细胞旁空间,并在维持细胞极性和信号转导方面发挥关键作用。缺乏该基因的敲除小鼠出生后不久就会因经皮失水脱水而死亡,这表明该基因对于建立和维持表皮屏障是不可或缺的。该基因编码的蛋白也具有抑制胃肿瘤的活性,是丙型肝炎病毒(HCV)进入的关键因素。[由RefSeq提供,2010年8月]
表达式
肝E18(RPKM 82.6)、肝成体(RPKM15.9)和6个其他组织中的偏倚表达查看更多信息
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单

基因组背景

请参阅中的Cldn1基因组数据查看器
位置:
16 B2;16 18.0立方厘米
外显子计数:
4
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 16 NC_000082.7(26175395..26190589,补码)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 16 NC_000082.6(26356645..26371839,补充)

染色体16-NC_000082.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene prolyl 3-hydroxylase 2 Neighboring gene VISTA enhancer mm1097 Neighboring gene expressed sequence AU015336 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40483 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40484 Neighboring gene predicted gene, 41436 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40485 Neighboring gene claudin 16 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_40486 Neighboring gene transmembrane protein 207

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:由Mouse ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

参考文献

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

变更

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
  • 核酸内切酶介导(4)
  • 目标(5)1条引文

PubChem的途径

互动

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

基因本体论 由MGI提供

流程 证据代码 酒吧
卷入双细胞紧密连接组件 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
卷入双细胞紧密连接组件 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
通过质膜细胞粘附分子参与钙非依赖性细胞间粘附 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与细胞粘附 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与细胞连接维护 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
acts_upstream_of_of_或细胞内连接组织 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与血神经屏障的建立 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
内皮性肠屏障的建立 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
皮肤屏障的建立 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
皮肤屏障的建立 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与双细胞紧密连接组装的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细胞迁移的正调控 国际标准化组织
从序列正交推断
更多信息
 
参与创伤愈合中上皮细胞增殖的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与创伤愈合的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与蛋白复合物齐聚 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
白介素-18的参与反应 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与跨血神经屏障的外源性转运 国际标准化组织
从序列正交推断
更多信息
 
组件 证据代码 酒吧
定位于锚固接头 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
定位于心尖质膜 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
定位于心尖质膜 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
基底外侧质膜定位 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
双细胞紧密连接中的is_active 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
定位于双细胞紧密连接 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
定位于双细胞紧密连接 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位于单元连接 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
定位于单元连接 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
定位于细胞间连接 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
定位于外侧质膜 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
定位于外侧质膜 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位膜 北美
不可追踪的作者声明
更多信息
公共医学 
血浆中的is_active 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
定位于质膜 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
定位于质膜 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位于质膜 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
部分含蛋白复合物 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于紧密连接处 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
位于紧密连接处 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_016674.4号NP_057883.1号第1条

    参见NP_057883.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    源序列
    AK036780、CK626537
    共识CDS
    CCDS28087.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    O88551号机组
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A7UKX1系列第四季度FJV3
    相关的
    ENSMUSP000000023154.3号ENSMUST00000023154.3
    保守领域(1)总结
    pfam00822型
    位置:5182
    PMP22_香豆素;PMP-22/EMP/MP20/Claudin家族

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000082.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    26175395..26190589补码
    下载
    GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)