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抄送68CD68抗原[小家鼠(家鼠)]

基因ID:12514,更新日期2024年9月18日

总结

官方符号
抄送68由提供MGI公司
官方全名
CD68抗原由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:88342
请参阅相关
乐团:ENSMUSG00000018774 联盟基因组:MGI:88342
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;Mus公司;穆斯
也称为
灯4;gp110;疤痕1
总结
参与多种过程,包括细胞对脂多糖的反应;细胞对氧化低密度脂蛋白颗粒刺激的反应;以及树突状细胞抗原处理和呈递的负调控。作用于衰老和细胞对有机物质的反应的上游或内部。位于溶酶体和质膜中。表达于多种结构,包括中枢神经系统;胚胎间充质;心脏血管;肝脏;和脾脏。与人CD68(CD68分子)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
在脾成体(RPKM 35.5)、胸腺成体(RTKM 25.5)和26个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源
新款
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基因组背景

参见中的Cd68基因组数据查看器
位置:
11 B3;11 42.86立方厘米
外显子计数:
6
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 11 NC_000077.7(69555039..69556996,补码)
108.20200622 上一次装配 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 11 NC_000077.6(69664213..69666170,补体)

染色体11-NC_000077.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene SRY (sex determining region Y)-box 15 Neighboring gene mannose-P-dolichol utilization defect 1 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E3965 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr11:69476301-69476484 Neighboring gene microRNA 1934 Neighboring gene eukaryotic translation initiation factor 4A1 Neighboring gene predicted gene, 24029 Neighboring gene predicted gene, 25835

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

参考文献

PubMed中的相关文章

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

变化

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
  • 核酸内切酶介导(9)
  • 捕获的基因(1)
  • 目标(4)1条引文

PubChem的途径

互动

产品 交互作用者 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

基因本体论 由MGI提供

组件 证据代码 酒吧
定位内体膜 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
晚期内体膜中的is_active 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
溶酶体膜中的活性 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
定位溶酶体膜 区域协调机构
根据已审查的计算分析推断
更多信息
公共医学 
位于溶酶体中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
血浆中的is_active 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
定位于质膜 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
定位于质膜 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 

NCBI参考序列(RefSeq)

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独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

信使核糖核酸和蛋白质

  1. NM_001291058.1号NP_001277987.1巨唾液酸前体

    参见NP_001277987.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    转录变体:该变体(1)代表较长的转录并编码功能蛋白。
    源序列
    AW123877、BY210951、X68273
    共识CDS
    CCDS70216.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    O54688号,O70321型,1996年第3页,问题3S4A9,问题5F2A8,问题9DD15
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A0R4J1C8型
    相关的
    恩斯穆斯0000018918.6,ENSMUST00000018918.12
    保守领域(2)总结
    1999年1月1日
    位置:36326
    灯具;溶酶体相关膜糖蛋白(Lamp)
    pfam05647型
    位置:43102
    表多糖_TR;粘蛋白的鞣质重复区,表甘氨酸样

核糖核酸

  1. 编号_110993.1RNA序列

    状态:已验证

    描述
    转录变体:与变体1相比,该变体(2)缺少一个内部外显子。由于预测的蛋白质不符合RefSeq质量标准,因此该变体表示为非编码。
    源序列
    AW123877、BY207885、BY210951、X68273

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000077.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    69555039..69556996补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

抑制的参考序列

以下参考序列已被抑制。解释

  1. NM_009853.1号:抑制序列

    描述
    NM_009853.1:此RefSeq被永久抑制,因为目前对转录物和蛋白质的支持不足。