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阿尔卡姆活化白细胞粘附分子[小家鼠（家鼠）]

基因ID:11658，更新日期2024年6月4日

总结

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官方符号
阿尔卡姆由提供MGI公司
官方全名
活化白细胞粘附分子由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:1313266
请参阅相关
乐团：ENSMUSG00000022636 联盟基因组：MGI:1313266
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；变形肌；鼠形目；鼠科；穆里奈；穆斯；穆斯
也称为
本；SC1；MuSC；CD166；DM-GRASP公司
总结
预计可实现相同的蛋白质结合活性。作用于运动神经元轴突引导的上游或内部。位于轴突内；质膜外侧；和神经元细胞体。以多种结构表达，包括消化系统；中枢神经系统；泌尿生殖系统；感觉器官；还有触须。与人类ALCAM（活化白细胞粘附分子）同源。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
表达式
在成人肺组织（RPKM 24.3）、CNS E11.5（RPKM16.7）和24个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源
人类 全部的
新款
尝试新的基因表
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基因组背景

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请参阅中的Alcam基因组数据查看器
位置：
16 B5；16 32.88立方厘米
外显子计数：
16
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 16 NC_000082.7（52069359..52273444，补码）
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 16 NC_000082.6（52248996..52453081，补码）

16号染色体-NC_000082.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E2463 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E7459 Neighboring gene predicted gene, 29686 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E5546 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_41007 Neighboring gene Casitas B-lineage lymphoma b Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_41008 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer mm9_chr16:52149538-52149839 Neighboring gene predicted gene, 23513 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer mm9_chr16:52182153-52182454 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E10910 Neighboring gene predicted gene, 32597 Neighboring gene predicted gene, 41461 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E5547 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E7461 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_41009 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E4178 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E2464 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_41011 Neighboring gene predicted gene, 52279 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_41012 Neighboring gene RIKEN cDNA 4930404A05 gene

基因组区域、转录物和产物

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表达式

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  • 项目名称：鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述：鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目：PRJNA66167型
  • 出版物：PMID 25409824
  • 分析日期：无

参考文献

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PubMed中的相关文章

  1. ALCAM缺乏通过抑制炎症反应减轻LPS诱导的急性肺损伤。 李R，等.炎症，2023年4月PMID 36418761
  2. 激活的白细胞粘附分子（ALCAM/CD166）调节食物过敏小鼠模型中的T细胞反应。 Kim YS，等《临床实验免疫学》，2018年5月，PMID 29363753，免费PMC文章
  3. 活化白细胞粘附分子的基质表达促进肺肿瘤生长和转移。 Willrodt AH，等《美国病理杂志》，2017年11月，PMID 28822802
  4. ALCAM在神经炎症和血脑屏障稳态中的双重作用。 Lécuyer文学硕士，等美国国家科学院院刊，2017年1月24日。PMID 28069965，免费PMC文章
  5. 活化的白细胞粘附分子（ALCAM或CD166）调节骨表型和造血。 胡克·RA，等肌肉骨骼神经相互作用杂志，2015年3月，PMID 25730656，免费PMC文章

查看PubMed中的所有（112）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？
  1. 活化的白细胞粘附分子通过调节MAPK信号通路调节RSV诱导的气道炎症中白细胞介素-33的表达。
    标题：活化的白细胞粘附分子通过调节MAPK信号通路调节RSV诱导的气道炎症中白细胞介素-33的表达。
  2. 成骨细胞通过巨核细胞诱导Embigin和CD166的上调促进小鼠造血的维持。
    标题：Osteomacs通过巨核细胞诱导的Embigin和CD166上调促进小鼠造血维持。
  3. ALCAM缺乏通过抑制炎症反应减轻LPS诱导的急性肺损伤。
    标题：ALCAM缺乏通过抑制炎症反应减轻LPS诱导的急性肺损伤。
  4. 活化白细胞细胞粘附分子在肺纤维化发病机制中的新调节作用。
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  5. CD6/ALCAM通路通过T细胞介导的反应促进狼疮性肾炎。
    标题：CD6/ALCAM通路通过T细胞介导的反应促进狼疮性肾炎。
  6. 活化的白细胞粘附分子调节B淋巴细胞跨越中枢神经系统屏障的迁移。
    标题：活化的白细胞粘附分子调节B淋巴细胞跨越中枢神经系统屏障的迁移。
  7. 细胞粘附分子ALCAM（CD166）可以作为细胞外基质，通过与粘附分子的跨嗜热相互作用，选择性地促进小鼠中脑多巴胺神经元轴突的生长
    标题：中脑多巴胺神经元的轴突生长由细胞粘附分子ALCAM通过与L1cam、Chl1和信号素的跨嗜热相互作用调节。
  8. 骨细胞的ALCAM+巨细胞瘤具有自我更新的干细胞特性，并具有分化能力。
    标题：ALCAM（+）基质细胞：在骨巨细胞瘤进展中的作用。
  9. 这些结果表明，ALCAM通过影响T细胞活化来调节食物过敏。
    标题：激活的白细胞粘附分子（ALCAM/CD166）在食物过敏小鼠模型中调节T细胞反应。
  10. 我们的数据表明，ALCAM KO小鼠发生了更严重的活动性实验性自身免疫性脑脊髓炎，这可以通过其BBB通透性增加来解释。BBB完整性的丧失是由于在TJ分子水平上缺乏ALCAM导致连接分子的失调。
    标题：ALCAM在神经炎症和血脑屏障稳态中的双重作用。
提交： 新GenerRIF 更正 查看所有GenerRIF（30）

变更

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等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载（MGI）
  • 核酸内切酶介导（4）
  • 目标（1）1条引文

互动

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产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

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标记

同源性

克隆名称

  • MGC27910型

基因本体论 由MGI提供

功能 证据代码 酒吧
实现相同的蛋白质结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
过程 证据代码 酒吧
适应性免疫反应中的上游活动 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
actits_upstream_of_or轴突引导内 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与细胞粘附 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
通过质膜细胞粘附分子参与异质性细胞间粘附 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
acts_upstream_of_of_or_within免疫系统过程 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
actits_upstream_of_or运动神经元轴突内导向 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
组件 证据代码 酒吧
T细胞受体复合体的一部分 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
位于轴突中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
在单元格投影中定位 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
位于质膜外侧 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
定位免疫突触 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
定位膜 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
定位于神经元细胞体 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
血浆中的is_active 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
定位于质膜 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  

一般蛋白质信息

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首选名称
CD166抗原

NCBI参考序列（RefSeq）

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新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组学

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_00133110.1号→NP_001318039.1号CD166抗原亚型2前体

    状态：已验证

    描述
    转录变异体：与变异体1相比，该变异体（2）在3'编码区缺少一个交替的框内外显子。编码的亚型（2）比亚型1短。
    源序列
    AC117780、AC154383、BE654940
    共识CDS
    CCDS84242.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    E9Q3Q6期,E9Q4G8号机组
    相关的
    ENSMUSP00000129714.2,ENSMUST00000170035.8

  2. NM_009655.3号→NP_033785.1号CD166抗原亚型1前体

    参见NP_033785.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    描述
    转录变体：该变体（1）代表较长的转录，编码较长的亚型（1）。
    源序列
    AC154383、AK031391、AK161090、BE654940
    共识CDS
    CCDS37356.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    O70136号,Q61490问题,问题8CDA5,问题8R2T0
    UniProtKB/TrEMBL公司
    E9Q4G8号机组,Q54AJ5问题
    相关的
    ENSMUSP00000023312.8号,ENSMUST00000023312.14号
    保守领域（4）总结
    智能00410
    位置：255→329
    IG_类；免疫球蛋白样
    pfam08205型
    位置：137→231
    C2集合2；CD80样C2-set免疫球蛋白结构域
    pfam13927型
    位置：256→313
    Ig_3；免疫球蛋白结构域
    第11960条
    位置：415→488
    免疫球蛋白；免疫球蛋白结构域

注释基因组参考序列：GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000082.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    52069359..52273444补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）
核苷酸 蛋白质 应变
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
问题61490.3 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q61490

基因链接输出

以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

化学信息
分子生物学数据库
研究材料
工具