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动作2肌动蛋白α2[小家鼠(家鼠)]

基因ID:11472,更新日期24年6月18日

总结

官方符号
行动2由提供MGI公司
官方全名
肌动蛋白α2由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:109192
参见相关内容
乐团:ENSMUSG00000052374 联盟基因组:MGI:109192
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
也称为
1110008F24瑞克
总结
启用多种功能,包括LIM域绑定活动;核受体辅活化因子活性;和跨膜转运蛋白结合活性。参与心肌细胞发育;积极调控交通;蛋白定位于质膜。作用于肌肉收缩的上游或内部。位于Z盘中。以多种结构表达,包括消化系统;心脏;肢体;肌肉组织;和躯干体节。该基因的人类同源基因与致心律失常性右心室心肌病和扩张型心肌病1AA有关。与人类ACTN2同源(肌动蛋白α2)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
心脏成体(RPKM 363.9)、肢体E14.5(RPKM39.1)和1个其他组织中的偏倚表达查看更多
直系同源
新的
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

请参阅中的Actn2基因组数据查看器
位置:
13 A1;13.4.54立方厘米
外显子计数:
21
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 13 NC_000079.7(12284312..12355613,补充)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 13 NC_000079.6(12269426..1240732,补码)

染色体13-NC_000079.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene ribosomal protein S7 pseudogene Neighboring gene predicted gene 10336 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer mm9_chr13:12302569-12302869 Neighboring gene 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E7201 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_33665 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_33666 Neighboring gene predicted gene, 40667 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr13:12487435-12487618 Neighboring gene predicted gene 5445 Neighboring gene HEAT repeat containing 1 Neighboring gene predicted gene 5928

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

参考文献

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

变更

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

PubChem的途径

互动

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

克隆名称

  • MGC107582型

基因本体论 由MGI提供

功能 证据代码 酒吧
启用FATZ绑定 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
启用LIM域绑定 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
启用actin绑定 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
使肌动蛋白丝结合 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
使肌动蛋白丝结合 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
使肌动蛋白丝结合 塔斯
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
使钙离子结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
使细胞骨架蛋白结合 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
使细胞骨架蛋白结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
实现相同的蛋白质结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
启用金属离子绑定 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
激活核受体辅活化因子 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
使磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
实现蛋白质域特异性结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
激活蛋白质-大分子适配器活性 塔斯
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
启用titin Z域绑定 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
启用titin绑定 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
实现跨膜转运蛋白结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
实现跨膜转运蛋白结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
流程 证据代码 酒吧
参与肌动蛋白细胞骨架组织 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与肌动蛋白丝开盖 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与心肌细胞发育 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
卷入焦点粘附组件 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
卷入的微型组件 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与肌肉细胞发育 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
动作_上游_of_或肌肉收缩内 塔斯
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 
参与钾离子跨膜转运蛋白活性的负调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与钾离子转运的负调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与蛋白质在细胞表面定位的负调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与磷脂酶C激活血管紧张素激活信号通路 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与阳离子通道活性的正调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与阳离子通道活性的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与内吞再循环的正调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与内吞再循环的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与钾离子跨膜转运蛋白活性的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与钾离子转运的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与蛋白在质膜上的定位 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与蛋白在质膜上的定位 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与膜电位的调节 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
累及肌节组织 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
组件 证据代码 酒吧
Z光盘中的活动 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
定位在Z光盘中 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
定位在Z光盘中 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
细胞连接处的is_active_in 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
单元格投影中的活动 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
is_active_in皮层肌动蛋白细胞骨架 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
与皮质肌动蛋白细胞骨架共定位 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于细胞质中 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
位于丝状体中 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
局部粘着 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
谷氨酸能突触激活 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
is_active_in质膜 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
与质膜共定位 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
突触后肌动蛋白细胞骨架中的is_active 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
突触后密度膜is_active 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
is_active_in突触后密度,细胞内成分 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位于肌节 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
横纹肌细丝定位 塔斯
可追溯作者声明
更多信息
公共医学 

一般蛋白质信息

首选名称
α-肌动蛋白-2
姓名
F-肌动蛋白交联蛋白
α-肌动蛋白骨骼肌

NCBI参考序列(RefSeq)

新的 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_033268.4号NP_150371.4型α-肌动蛋白-2

    参见NP_150371.4的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    源序列
    AF248643、BC089579
    共识CDS
    CCDS26239.1号
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    G3UW84型,Q9JI91型
    UniProtKB/TrEMBL公司
    问题8K3Q4
    相关的
    ENSMUSP00000067708.8,ENSMUST00000064204.14
    保守领域(6)总结
    PTZ00184型
    位置:747851
    PTZ00184;钙调素;临时的
    cd00176
    位置:402629
    规范;镜蛋白重复,发现于参与细胞骨架结构的几种蛋白质中;家族成员包括spectrin、alpha-actinin和dystrophin;spectrin重复序列形成一个三螺旋束,第二螺旋在某些序列中被脯氨酸中断。。。
    pfam00435型
    位置:281391
    Spectrin;Spectrin重复
    pfam08726型
    位置:824890
    EFhand_Ca_insen;Ca2+不敏感EF手
    cd21214
    位置:35139
    CH_ACTN_rpt1;在α-凝集素家族中发现的第一个钙调素同源结构域
    cd21216
    位置:143257
    CH_ACTN_rpt2;α-凝集素家族中发现的第二个钙调素同源结构域

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000079.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    12284312..12355613补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. XM_036157837.1号XP_036013730.1型α-凝集素-2异构体X1

    保守领域(4)总结
    PTZ00184型
    位置:489593
    PTZ00184;钙调素;临时的
    cd00176
    位置:144371
    规范;镜蛋白重复,发现于参与细胞骨架结构的几种蛋白质中;家族成员包括spectrin、alpha-actinin和dystrophin;spectrin重复序列形成一个三螺旋束,第二螺旋在某些序列中被脯氨酸中断。。。
    pfam00435型
    位置:23133
    Spectrin;Spectrin重复
    pfam08726型
    位置:566632
    EFhand_Ca_insen;钙离子不敏感EF手