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阿布卡1ATP-装订盒，子家族A成员1[小家鼠（家鼠）]

基因ID:11303，更新日期2024年9月18日

总结

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官方符号
阿布卡1由提供MGI公司
官方全名
ATP-装订盒，子家族A成员1由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:99607
请参阅相关
乐团：ENSMUSG00000015243 联盟基因组：MGI:99607
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物；后生动物；弦线；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；肌形态；鼠形目；鼠科；穆里奈；穆斯；穆斯
也称为
抗体1；ABC-1型
总结
该基因编码的膜相关蛋白是ATP结合盒（ABC）转运蛋白超家族的成员。ABC蛋白通过胞外膜和胞内膜运输各种分子。ABC基因分为七个不同的亚家族（ABC1、MDR/TAP、MRP、ALD、OABP、GCN20、White）。该蛋白是ABC1亚家族的成员。ABC1亚家族的成员是唯一一个只在多细胞真核生物中发现的主要ABC亚家族。在人类中，这种蛋白质在细胞脂质清除途径中起到胆固醇外排泵的作用。人类基因突变与丹吉尔病和家族性高密度脂蛋白缺乏症有关。[由RefSeq提供，2008年7月]
表达式
卵巢成体（RPKM 16.1）、皮下脂肪垫成体（RTKM 14.9）和25个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源
人类 全部的
新款
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基因组背景

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位置：
4 B2；4 28.57立方厘米
外显子计数：
51
注释发布 状态 装配 氯代甲烷 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 4 NC_000070.7（53030789..53159988，补遗）
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 4 NC_000070.6（53030789..53159988，补遗）

染色体4-NC_000070.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene nipsnap homolog 3A Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E6179 Neighboring gene nipsnap homolog 3B Neighboring gene predicted gene, 54225 Neighboring gene lipid responsive LXR-induced inhibitor of cholesterol synthesis 1

基因组区域、转录物和产物

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表达式

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  • 项目名称：鼠标ENCODE转录组数据鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述：鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目：PRJNA66167型
  • 出版物：PMID 25409824
  • 分析日期：无

参考文献

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PubMed中的相关文章

  1. 糖尿病肾病中ABCA1缺乏介导的肾小球胆固醇积聚加剧肾小球内皮损伤和功能障碍。 张杰，等代谢，2023年2月PMID 36521550
  2. ABCA1（ATP-Binding Cassette Transporter A1）的特异性丢失抑制TCR（T细胞受体）信号传导并提供抗动脉粥样硬化的保护。 赵毅，等《动脉硬化血栓血管生物学》，2022年12月，PMID 36252122
  3. ABCA1调节的胆固醇稳态对视网膜神经节细胞的存活至关重要。 杨杰，等Sci中国生命科学，2023年2月PMID 35829808
  4. 肝细胞Abca1靶向缺失通过LDL（低密度脂蛋白）受体增加血浆HDL（高密度脂蛋白。 Bashore AC公司，等《动脉硬化血栓血管生物学》，2019年9月，PMID 31167565，免费PMC文章
  5. ABCA1转运体降低哺乳动物细胞中两性霉素B的细胞毒性。 吴安，等《细胞分子生命科学》，2019年12月，PMID 31134303，免费PMC文章

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GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？
  1. ABCA1缺乏导致小鼠SREBP2通路的组织特异性失调。
    标题：ABCA1缺陷导致小鼠SREBP2通路的组织特异性失调。
  2. miR-223通过上调ABCA1，加速脊髓损伤后小胶质细胞内脂滴的清除。
    标题：miR-223通过上调ABCA1，加速脊髓损伤后小胶质细胞中脂滴的清除。
  3. 通过调控ABCA1的表达，靶向泡沫巨噬细胞，以促进损伤脊髓的损伤愈合。
    标题：通过调控ABCA1的表达，靶向泡沫巨噬细胞，以促进损伤脊髓的损伤愈合。
  4. CircRNA痒性E3泛素蛋白连接酶通过靶向microRNA-214-3p/ATP-结合盒A1轴改善脓毒症诱导的急性肾损伤中的线粒体功能障碍。
    标题：CircRNA痒性E3泛素蛋白连接酶通过靶向microRNA-214-3p/ATP结合盒A1轴改善脓毒症诱导的急性肾损伤中的线粒体功能障碍。
  5. Circ-ABCA1促进氧化低密度脂蛋白诱导的血管平滑肌细胞炎症和表型转换。
    标题：Circ-ABCA1促进氧化低密度脂蛋白诱导的血管平滑肌细胞炎症和表型转换。
  6. 小管ABCA1缺乏增加雄性小鼠体内胆固醇和钠依赖性血压效应。
    标题：ABCA1的小管缺陷增加了雄性小鼠体内胆固醇和钠（+）依赖性血压效应。
  7. Abeta对C57BL/6小鼠星形胶质细胞、小胶质细胞和神经元中ABCA1蛋白水平的矛盾作用：一项旨在阐明Abeta在脑细胞中对ABCA1的影响的体外和电子研究。
    标题：Aβ对从C57BL/6小鼠分离的星形胶质细胞、小胶质细胞和神经元中ABCA1蛋白水平的矛盾作用：一项旨在阐明Aβ对脑细胞中ABCAl的影响的体外和电子研究。
  8. 巨噬细胞Gpx4缺乏通过调节清道夫受体、ABCA1和ABCG1的表达加剧泡沫细胞的形成。
    标题：巨噬细胞Gpx4缺乏通过调节清除剂受体ABCA1和ABCG1的表达来加重泡沫细胞的形成。
  9. ABCA1调节的胆固醇稳态对视网膜神经节细胞的存活至关重要。
    标题：ABCA1调节的胆固醇稳态对视网膜神经节细胞的存活至关重要。
  10. ABCA1介导的EMT通过ERK/Fra-1/ZEB1途径促进乳头状甲状腺癌恶性肿瘤。
    标题：ABCA1-介导的EMT通过ERK/Fra-1/ZEB1途径促进乳头状甲状腺癌恶性肿瘤。
提交： 新GenerRIF 更正 查看所有GeneRIF（308）

变更

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等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载（MGI）

PubChem的途径

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互动

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产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

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标记

同源性

基因本体论 由MGI提供

功能 证据代码 酒吧
启用ABC型转运器活动 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
启用ATP绑定 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
启用ATP绑定 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
启用ATP水解活性 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
启用ATP酶绑定 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
启用ATP酶绑定 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
激活ATP酶偶联的跨膜转运蛋白活性 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
激活ATP酶偶联的跨膜转运蛋白活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
启用载脂蛋白A-I结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
启用载脂蛋白A-I结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
激活载脂蛋白A-I受体活性 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
激活载脂蛋白A-I受体活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
启用载脂蛋白结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
促进胆固醇转移活性 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
促进胆固醇转移活性 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
促进胆固醇转移活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
启用floppase活动 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
启用floppase活动 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  
使高密度脂蛋白颗粒结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
实现高密度脂蛋白颗粒结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
使磷脂酰胆碱结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
使磷脂酰胆碱结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
激活磷脂酰胆碱脱羧酶活性 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
使磷脂酰胆碱floppase具有活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
激活磷脂酰胆碱脱羧酶活性 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  
激活磷脂酰丝氨酸转肽酶活性 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
激活磷脂酰丝氨酸转肽酶活性 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
激活磷脂酰丝氨酸转肽酶活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
激活磷脂转运蛋白活性 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
激活磷脂转运蛋白活性 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
激活磷脂转运蛋白活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
实现蛋白质结合 易激肽
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
使蛋白质跨膜转运活性 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
启用信号受体结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
启用信号受体结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
启用小GTPase绑定 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
启用小GTPase绑定 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
使鞘磷脂floppase活性 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
使鞘磷脂floppase活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
启用syntaxin绑定 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
启用syntaxin绑定 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
过程 证据代码 酒吧
参与G蛋白偶联受体信号通路 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
参与腺苷酸环化酶激活G蛋白偶联受体信号通路 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与腺苷酸环化酶激活G蛋白偶联受体信号通路 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
参与载脂蛋白A-I介导的信号通路 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与细胞对胆固醇的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与细胞对细胞因子刺激的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
不参与细胞对高密度脂蛋白颗粒刺激的反应 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与细胞对脂多糖的反应 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与细胞对维甲酸的反应 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与细胞对外来刺激的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
acts_upstream_of_of_within胆固醇流出 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
胆固醇流出中的上游作用 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
胆固醇流出受累 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
胆固醇流出受累 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
参与胆固醇稳态 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与胆固醇稳态 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
胆固醇代谢过程中的上游活动 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
参与胆固醇代谢过程 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
参与胆固醇转运 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
受累的内体转运 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
受累的内体转运 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
acts_upstream_of_or或在细胞定位建立内 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
涉及跨膜输出 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与高密度脂蛋白颗粒组装 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与高密度脂蛋白颗粒组装 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
参与细胞内胆固醇转运 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与细胞内胆固醇转运 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
脂蛋白生物合成过程中上游的acts 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与脂蛋白生物合成过程 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
脂蛋白代谢过程中的上游活动 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与溶酶体组织 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与溶酶体组织 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
acts上游of或肽分泌内 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
吞噬、吞没中的上游行为 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
磷脂流出受累 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
磷脂流出中的上游作用 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
磷脂流出中的上游作用 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
磷脂流出受累 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
磷脂内稳态 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与磷脂稳态 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
磷脂转运中的上游作用 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
磷脂转运受累 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
参与磷脂转运 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
参与血小板致密颗粒组织 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与血小板致密颗粒组织 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
参与胆固醇流出的正调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与高密度脂蛋白颗粒组装的正调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
蛋白质脂质化上游或内部的作用 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与蛋白分泌 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与蛋白分泌 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
参与蛋白质跨膜转运 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与Cdc42蛋白信号转导的调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与Cdc42蛋白信号转导的调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
涉及层流剪切应力的响应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
涉及层流剪切应力的响应 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
参与维生素B3反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与胆固醇逆向转运 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与胆固醇逆向转运 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
涉入信号释放 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
涉入信号释放 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
鞘磷脂易位 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
组件 证据代码 酒吧
高尔基体中的位置 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
基底外侧质膜定位 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
基底外侧质膜定位 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
位于单元格表面内 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
定位于内吞小泡 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
定位于内体 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
定位于内体 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
  
位于质膜外侧 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
细胞内膜结合细胞器中is_active 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
位于细胞内膜结合的细胞器中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
定位于细胞内小泡 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
定位膜筏 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
定位膜筏 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
位于细胞质核周区 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
位于细胞质核周区 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
位于吞噬泡中 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
位于吞噬小泡内 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
定位于质膜 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
定位于质膜 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  

一般蛋白质信息

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首选名称
磷脂转运ATP酶ABCA1
姓名
ATP装订盒1
ATP-装订盒式运输机1
ATP-装订盒，子家族A（ABC1），成员1
NP_038482.3号
XP_006537617.1号
XP_006537619.1号

NCBI参考序列（RefSeq）

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新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_013454.3号→NP_038482.3号磷脂转运ATP酶ABCA1

    参见NP_038482.3的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    源序列
    AK019548、AK045442、AK051920、AL772397、AL807243、BP761367、CD351490、CD351847、CF734665、CF745062、CN702062
    共识CDS
    邮编18187.1
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B1AWZ8型,第41233页
    相关的
    ENSMUSP00000030010.4,ENSMUST00000030010.4号
    保守领域（1）总结
    钨极氩弧焊01257
    位置：6→2236
    边缘蛋白；视网膜特异性轮辋ABC运输机

注释基因组的参考序列：GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000070.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    53030789..53159988补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. XM_006537556.1号→XP_006537619.1号磷脂转运ATP酶ABCA1亚型X2

    保守领域（1）总结
    钨极氩弧焊01257
    位置：6→2213
    边缘蛋白；视网膜特异性轮辋ABC运输机

  2. XM_006537554.2号→XP_006537617.1号磷脂转运ATP酶ABCA1亚型X1

    参见XP_006537617.1的相同蛋白质及其注释位置

    保守领域（1）总结
    钨极氩弧焊01257
    位置：6→2238
    边缘蛋白；视网膜特异性轮辋ABC运输机
核苷酸 蛋白质 应变
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
第412334页 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:P41233

基因链接输出

以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

化学信息
分子生物学数据库
研究材料
工具
其他