美国国旗

美国政府的官方网站

格式

发送至:

选择目的地

ZNF268型锌指蛋白268[智人(人类)]

基因ID:10795,更新日期2024年6月17日

总结

官方符号
ZNF268型由提供HGNC公司
官方全名
锌指蛋白268由提供HGNC公司
主要来源
HGNC:HGNC:13061
请参阅相关
乐团:ENSG0000090612 MIM:604753; 联盟基因组:HGNC:13061
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
智人
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;颅亚目;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类动物;Haplorrhini公司;卡塔里尼;人科;人类
也称为
HZF3型
总结
预测可启用DNA-结合转录激活物活性、RNA聚合酶II特异性和RNA聚合物II顺调控区序列特异性DNA结合活性。参与多个过程,包括NIK/NF-kappaB信号的正向调节;氮化合物代谢过程的正调控;调控凋亡过程。位于肌动蛋白细胞骨架;胞浆;和细胞核。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
甲状腺(RPKM 5.9)、肾脏(RPKM4.2)和25个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

参见中的ZNF268基因组数据查看器
位置:
12季度24.33
外显子计数:
7
注释发布 状态 装配 氯代甲烷 位置
RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 12 NC_000012.12(133181495..133214832)
RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(合同通用条款第009914755.1条) 12 NC_060936.1(133238807..133272083)
105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(合同通用条款000001405.25) 12 NC_000012.11(133758081..133791418)

染色体12-NC_000012.12描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene zinc finger protein 891 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 5135 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 5136 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 7400 Neighboring gene ribosomal protein L23a pseudogene 67 Neighboring gene Neanderthal introgressed variant-containing enhancer experimental_26228 Neighboring gene zinc finger protein 10 Neighboring gene P300/CBP strongly-dependent group 1 enhancer GRCh37_chr12:133731795-133732994 Neighboring gene Neanderthal introgressed variant-containing enhancer experimental_26242 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr12:133757799-133758323 Neighboring gene anomalous homeobox Neighboring gene RNA, U6 small nuclear 717, pseudogene

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
  • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
  • 生物项目:项目编号:4337
  • 出版物:项目管理标识号24309898
  • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

互动

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

潜在的阅读

包含基因:ZNF10型

克隆名称

  • MGC126498型

基因本体论 GOA提供

组件 证据代码 酒吧
位于细胞质中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
定位于胞浆中 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 
在核心中是活动的 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于核内 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
位于核内 北美
不可追踪的作者声明
更多信息
公共医学 

一般蛋白质信息

首选名称
锌指蛋白268
姓名
锌指蛋白3
锌指蛋白HZF3

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001165881.3号NP_001159353.1号锌指蛋白268亚型a

    参见NP_001159353.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    成绩单变体:与变体1相比,该变体(2)在5'UTR上有所不同。变体1和2都编码亚型a。
    源序列
    AC226150、AW138703、BC110542、KF455750
    共识CDS
    CCDS45012.1号
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    问题14587,问题8TDG8,问题96RH4,Q9BZJ9号
    相关的
    ENSP00000228289.5标准,ENST00000228289.9标准
    保守领域(6)总结
    智能00349
    位置:81141
    KRAB公司;krueppel关联框
    COG5048公司
    位置:497910
    COG5048;FOG:Zn手指[仅限一般功能预测]
    sd00017(美元)
    位置:558578
    ZF_C2H2;C2H2锌指[结构图案]
    pfam00096型
    位置:556578
    zf-C2H2;锌指,C2H2型
    pfam01352型
    位置:81120
    克拉布;KRAB箱
    pfam13465型
    位置:710734
    zf-H2C2_2;锌纤维双畴
  2. NM_001165882.3号NP_001159354.1号锌指蛋白268亚型c

    状态:已验证

    描述
    转录变体:与变体1相比,该变体(4)在5'UTR中有所不同,并在下游起始密码子处开始翻译。编码的亚型(c)比亚型a短。
    源序列
    AC026786、AC226150、AW138703、BC110542、CN255799、KF455750
    UniProtKB/TrEMBL公司
    问题2TB61
    保守领域(6)总结
    智能00349
    位置:258
    KRAB公司;krueppel关联箱
    COG5048公司
    位置:414827
    COG5048;FOG:Zn手指[仅限一般功能预测]
    sd00017(美元)
    位置:475495
    ZF_C2H2;C2H2锌指[结构图案]
    pfam00096型
    位置:473495
    zf-C2H2;锌指,C2H2型
    pfam01352型
    位置:237
    KRAB公司;KRAB箱
    pfam13465型
    位置:627651
    zf-H2C2_2;锌纤维双畴
  3. NM_001165883.2号NP_001159355.1号锌指蛋白268亚型d

    参见NP_001159355.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    转录变体:该变体(5)在编码区中缺少两个外显子,与变体1相比,这会导致移码。与亚型a相比,生成的亚型(d)具有较短且独特的C末端。
    源序列
    AC026786、AC226150、AF317549、BC058548、KF455750
    共识CDS
    CCDS59240.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    问题14587
    相关的
    ENSP0000467781.1号文件,ENST00000539248.6号
  4. NM_001165884.3号NP_001159356.2号锌指蛋白268亚型e

    状态:已验证

    描述
    转录变体:该变体(6)在编码区中缺少三个交替的外显子,与变体1相比,这会导致移码。与亚型a相比,生成的亚型(e)较短,并且具有独特的C末端。
    源序列
    AC226150、AF317549、AF432217、AW138703、KF455750
    共识CDS
    CCDS53854.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    功能5小时1
    相关的
    ENSP0000438941.1号文件,ENST00000536899.6标准
  5. NM_001165885.2号NP_001159357.1号锌指蛋白268亚型f

    状态:已验证

    描述
    转录变体:该变体(7)在编码区中缺少一个替代外显子,与变体1相比,这会导致移码。与亚型a相比,生成的亚型(f)具有较短且独特的C末端。
    源序列
    AC026786、AC226150、AF317549、DQ057356、KF455750
    共识CDS
    CCDS53851.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    F5H7L3层
    相关的
    ENSP0000442446.2号文件,ENST00000541211.6标准
  6. 纳米_001165886.2NP_001159358.1号锌指蛋白268亚型g

    状态:已验证

    描述
    转录变体:该变体(8)在编码区中缺少两个交替的外显子,与变体1相比,这会导致移码。与亚型a相比,生成的亚型(g)具有较短且独特的C末端。
    源序列
    AC026786、AC226150、AF317549、DQ057357、KF455750
    共识CDS
    CCDS53853.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    F5H670型
    相关的
    ENSP0000437858.1标准,ENST00000542711.6标准
  7. NM_001165887.2号NP_001159359.1号锌指蛋白268亚型h

    参见NP_001159359.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    转录变体:该变体(9)缺少一个交替的框架内外显子,并且包含一个交替编码外显子。与变体1相比,这会导致框架移位。与亚型a相比,产生的亚型(h)缺少一个内部片段,并且具有较短且独特的C末端。
    源序列
    AC026786、AC226150、AF317549、DB079580、DQ057360、KF455750
    共识CDS
    CCDS53852.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A087WV54型,K7EQP6号机组
    相关的
    ENSP0000467922.1号文件,ENST00000592241.5标准
    保守领域(1)总结
    智能00349
    位置:1474
    KRAB公司;krueppel关联框
  8. NM_003415.3号NP_003406.1号锌指蛋白268亚型a

    参见NP_003406.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    转录变体:该变体(1)编码最长的亚型(a)。变体1和2都编码亚型a。
    源序列
    AC226150、AF317549、KF455750
    共识CDS
    CCDS45012.1号
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    问题14587,问题8TDG8,Q96RH4型,Q9BZJ9号
    相关的
    欧洲标准P0000044412.3,恩斯特00000536435.7
    保守领域(6)总结
    智能00349
    位置:81141
    KRAB公司;krueppel关联框
    COG5048公司
    位置:497910
    COG5048;FOG:Zn手指[仅限一般功能预测]
    sd00017(美元)
    位置:558578
    ZF_C2H2;C2H2锌指[结构图案]
    pfam00096型
    位置:556578
    zf-C2H2;锌指,C2H2型
    pfam01352型
    位置:81120
    KRAB公司;KRAB箱
    pfam13465型
    位置:710734
    zf-H2C2_2;锌纤维双畴
  9. NM_152943.3号NP_694422.2锌指蛋白268亚型b

    状态:已验证

    描述
    转录变体:这个变体(3)包含一个替代编码外显子,与变体1相比,它会导致移码。与亚型a相比,生成的亚型(b)具有较短且独特的C末端。
    源序列
    AC226150、AF317549、AF385187、KF455750
    共识CDS
    CCDS59239.1号文件
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A075B6T9型,第7页第44页,H3BUM2型
    相关的
    ENSP0000439539.2号文件,ENST00000541009.6标准
    保守领域(2)总结
    智能00349
    位置:81141
    KRAB公司;krueppel关联框
    pfam01352型
    位置:81120
    KRAB公司;KRAB箱

注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCh38.p14一次组件

基因组学

  1. NC_000012.12参考GRCh38.p14初级组件

    范围
    133181495..133214832
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

备选T2T-CHM13v2.0

基因组学

  1. NC_060936.1替代T2T-CHM13v2.0

    范围
    133238807..133272083
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)