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CDKN1B型细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B[智人(人类)]

基因ID:1027,更新于2024年5月5日

总结

官方符号
CDKN1B型由提供HGNC公司
官方全名
细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B由提供HGNC公司
主要来源
HGNC:HGNC:1785
请参阅相关
乐团:ENSG00000111276 MIM:600778; 联盟基因组:HGNC:1785
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已审核
有机体
智人
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡塔里尼;人科;人类
也称为
KIP1;MEN4;CDKN4;男性1b;第27KIP1页
总结
该基因编码一种细胞周期素依赖性激酶抑制剂,与CDK抑制剂CDKN1A/p21具有有限的相似性。编码蛋白结合并阻止细胞周期蛋白E-CDK2或细胞周期蛋白D-CDK4复合物的激活,从而控制细胞周期在G1的进展。该蛋白的降解由其依赖CDK的磷酸化和随后SCF复合物的泛素化触发,是细胞从静止状态过渡到增殖状态所必需的。该基因突变与IV型多发性内分泌肿瘤(MEN4)相关。[由RefSeq提供,2014年4月]
表达式
脂肪(RPKM40.2)、卵巢(RPKM35.6)和25个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

参见中的CDKN1B基因组数据查看器
位置:
12页13.1
外显子计数:
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 12 NC_000012.12(12717368..12722369)
RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 12 NC_060936.1(12590905..12595906)
105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 12 NC_000012.11(12870302..12875303)

染色体12-NC_000012.12描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene cAMP responsive element binding protein like 2 Neighboring gene uncharacterized LOC124902880 Neighboring gene BRD4-independent group 4 enhancer GRCh37_chr12:12796246-12797445 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 4260 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6017 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6018 Neighboring gene OCT4-NANOG hESC enhancer GRCh37_chr12:12829332-12830160 Neighboring gene G protein-coupled receptor 19 Neighboring gene MPRA-validated peak1575 silencer Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6019 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6020 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6021 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6022 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6023 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6024 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6025 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 4261 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6026 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6027 Neighboring gene ReSE screen-validated silencer GRCh37_chr12:12870680-12870868 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6028 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6029 Neighboring gene uncharacterized LOC105369663 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 4262 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 4263 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 4264 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 4265 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 4266 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 6030 Neighboring gene apolipoprotein L domain containing 1 Neighboring gene microRNA 613

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
  • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
  • 生物项目:项目编号:4337
  • 出版物:项目管理标识号24309898
  • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

PubMed中的相关文章

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

表型

相关条件

描述 测验
4型多发性内分泌肿瘤
MedGen公司:C1970712号 OMIM公司:610755 基因审查:4型多内分泌肿瘤
比较实验室

副本编号响应

描述
副本编号响应
三色灵敏度

无可用证据(上次评估时间:2020-07-08)

ClinGen基因组治疗页面
单倍体不足

剂量致病性的充分证据(上次评估2020-07-08)

ClinGen基因组治疗页面公共医学

EBI GWAS目录

描述
随后进行的荟萃分析和复制发现,CDKN1B、TET3、CD80、DRAM1和ARID5B中或附近的基因座与亚洲人的系统性红斑狼疮相关。

HIV-1相互作用

蛋白质相互作用

蛋白质 基因 互动 酒吧
包膜表面糖蛋白gp120 环境价值 HIV-1 gp120诱导人系膜细胞NF-κB活化并增加p21(cip1/waf1)和p27(kip1)蛋白水平 公共医学
Tat公司 塔特 HIV-1 Tat在神经元细胞中将细胞周期素依赖性激酶抑制剂1B(p27)从核重定位到细胞质 公共医学
塔特 当HIV-1 Tat在星形胶质细胞、神经元和非胶质细胞293T中表达时,它与许多细胞周期相关蛋白相互作用,包括细胞周期蛋白a、细胞周期蛋白B、细胞周期素D3、Cdk2、Cdk 4、Cdk1/Cdc2、cdc6、p27、p53、p63、hdlg和PCNA 公共医学

转到HIV-1人类交互数据库

PubChem的途径

互动

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

基因本体论 GOA提供

功能 证据代码 酒吧
使Hsp70蛋白结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
启用cyclin绑定 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
启用cyclin绑定 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
公共医学 
使细胞周期素依赖性蛋白激酶激活激酶调节器活性 经验
根据实验推断
更多信息
公共医学 
激活细胞周期蛋白依赖性蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶抑制剂活性 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
激活细胞周期蛋白依赖性蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶抑制剂活性 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
激活细胞周期蛋白依赖性蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶抑制剂活性 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
启用分子适配器活动 经验
根据实验推断
更多信息
公共医学 
启用分子功能抑制剂活性 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
使蛋白激酶结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
激活蛋白激酶抑制剂活性 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
使蛋白磷酸酶结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
实现含蛋白复合物结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
实现蛋白折叠伴侣结合 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
启用泛素连接酶激活剂活性 经验
根据实验推断
更多信息
公共医学 
使泛素蛋白连接酶结合 经验
根据实验推断
更多信息
公共医学 
过程 证据代码 酒吧
参与DNA损伤反应,p53类介体的信号转导导致细胞周期阻滞 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
参与有丝分裂细胞周期的G1/S转变 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与有丝分裂细胞周期的G1/S转变 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
involved_in-Notch信号通路 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与自噬细胞死亡 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
涉及细胞对抗生素的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与细胞缺氧反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
acts上游of或细胞内对锂离子的响应 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与细胞对有机环状化合物的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与细胞衰老 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
参与上皮细胞凋亡过程 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
上皮细胞增殖参与前列腺发育 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与心脏发育 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
公共医学 
参与内耳发育 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与DNA模板转录的负调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与心肌组织再生的负调控 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
公共医学 
参与细胞生长的负调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与细胞群体增殖的负调控 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与细胞群体增殖的负调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶活性的负调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与细胞周期蛋白依赖性丝氨酸/苏氨酸激酶活性的负调控 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与细胞周期蛋白依赖性丝氨酸/苏氨酸激酶活性的负调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与上皮细胞凋亡过程的负调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
上皮细胞增殖负调控参与前列腺发育 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与激酶活性的负调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与有丝分裂细胞周期的负调控 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与磷酸化的负调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与血管相关平滑肌细胞增殖的负调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
涉及核出口 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与胎盘发育 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与DNA复制的正调控 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
参与细胞群体增殖的正调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与微管聚合的正调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
acts上游of或蛋白质分解代谢过程的正调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与蛋白质磷酸化的正调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与钾离子转运 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与有丝分裂细胞周期G1/S转换的调节 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与细胞周期调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与细胞周期调控 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
公共医学 
参与细胞周期G1/S相变的调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与细胞迁移的调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
细胞周期蛋白依赖性蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性的调控 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与有丝分裂退出调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
晶状体纤维细胞分化的调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与对氨基酸的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与对镉离子的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
与雌二醇反应有关 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与葡萄糖反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与肽激素反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
参与对外来刺激的反应 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
涉及声音的感觉 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 

一般蛋白质信息

首选名称
细胞周期素依赖性激酶抑制剂1B
姓名
细胞周期素依赖性激酶抑制剂1B(p27,Kip1)

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

基因组学

  1. NG_016341.1参考序列基因

    范围
    5001..10002
    下载
    GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. NM_004064.5号NP_004055.1号细胞周期素依赖性激酶抑制剂1B

    参见NP_004055.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    源序列
    AC008115型
    共识CDS
    CCDS8653.1公司
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第46527页问题16307质量5u0h2Q9母线6
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q6I9V6型第9季度纽约6
    相关的
    ENSP00000228872.4标准ENST00000228872.9号
    保守领域(1)总结
    pfam02234型
    位置:3177
    CDI;激酶抑制剂

注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCh38.p14一次组件

基因组学

  1. NC_000012.12参考GRCh38.p14初级组件

    范围
    12717368..12722369
    下载
    GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

备选T2T-CHM13v2.0

基因组学

  1. NC_060936.1替代T2T-CHM13v2.0

    范围
    12590905..12595906
    下载
    GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)