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通用2808预测基因2808[小家鼠(家鼠)]

基因ID:100040500,更新日期2024年2月8日

总结

官方符号
通用2808由提供管理信息
官方全名
预测基因2808由提供管理信息
主要来源
MGI:MGI:3780977
参见相关内容
联盟基因组:MGI:3780977
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
型号
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;Euarchontoglires语;闪光;啮齿动物;变形肌;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
表达式
在全脑E14.5(RPKM 21.8)、中枢神经系统E14(RPKM 18.8)和其他25个组织中普遍表达查看更多
新的
尝试新的基因表
尝试新的成绩单

基因组背景

参见中的Gm2808基因组数据查看器
位置:
17 A1;17 4.04立方厘米
外显子计数:
7
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 17 NC_000083.7(6776485..6803411,补码)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 17 NC_000083.6(6509086..6536014,补遗)

17号染色体-NC_000083.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene transmembrane protein 181B, pseudogene Neighboring gene protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 2, pseudogene 5 Neighboring gene fibrillarin pseudogene Neighboring gene predicted gene, 29721 Neighboring gene predicted gene, 53224 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer mm9_chr17:6657759-6658060 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancers mm9_chr17:6806288-6806589 and mm9_chr17:6654863-6655163 Neighboring gene dynein light chain Tctex-type 1C

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:小鼠ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

一般蛋白质信息

首选名称
管状相关蛋白4样

NCBI参考序列(参考序列)

新的 尝试新的成绩单

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000083.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    6776485..6803411补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. XM_017317770.3号XP_017173259.1号tubby相关蛋白4-样

    保守领域(2)总结
    PHA03247型
    位置:518826
    PHA03247;大表皮蛋白UL36;临时的
    pfam01167型
    位置:9851055
    浴缸;浴盆系列