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nstd213（Pham等人，2021）

生物体：
人类
研究类型：
躯体的
提交人：
明潭范
描述：
Linked-read测序的阶段性结构变异分析可以识别与显色菌和色丛一致的复杂重排链，在单个等位基因上出现断点，进一步证明复杂SV发生在协同事件中，而不是通过多次独立重组的积累。预打印可在https://doi.org/10.101/2021.08.09.455584。请参阅中nstd213的变量摘要计数dbVar变量摘要.
项目：
PRJNA751700型

详细信息：下载5864变体区域,下载5936个变体调用,下载两者,文件传输协议

变体摘要

用于分析的程序集：
重新映射：GRCh38.p13（hg38）
提交：GRCh37（hg19）

序列IDChr公司变量区域数变量调用数放置类型链接到图形显示
NC_0000011.11号叶绿素1448456重新映射编号：_000001.11
NC_000002.12号第2章359363重新映射NC_000002.12号
NC_000003.12号第3章337339重新映射NC_000003.12号
NC_000004.12号第4章359359重新映射NC_000004.12号
NC_000005.10号第5阶段428431重新映射NC_000005.10号
NC_000006.12号第6章327342重新映射NC_000006.12号
NC_000007.14号第7章388388重新映射NC_000007.14号
NC_000008.11号第8章485487重新映射NC_000008.11号
NC_000009.12号第9章275276重新映射NC_000009.12号
NC_000010.11号10氯286296重新映射NC_000010.11号
NC_000011.10号第11章265266重新映射NC_000011.10号
NC_000012.12号第12章325326重新映射NC_000012.12号
NC_000013.11号第13代256258重新映射NC_000013.11号
NC_000014.9号第14章138139重新映射NC_000014.9号
NC_000015.10号第15章133133重新映射NC_000015.10号
NC_000016.10号第16章168172重新映射NC_000016.10号
NC_000017.11号17瑞士法郎168173重新映射NC_000017.11号
NC_000018.10号第18章137138重新映射NC_000018.10号
NC_000019.10号第19章7475重新映射NC_000019.10号
NC_000020.11号第20章218218重新映射新冠_000020.11
NC_000021.9号第21章6969重新映射NC_000021.9号
NC_000022.11号第22章5656重新映射NC_000022.11号
NC_000023.11号换热器X238246重新映射NC_000023.11号
国家电网公司_000024.10ChrY公司3234重新映射NC_000024.10号
国家标准_187516.1Chr1|NT_187516.111重新映射NT_187516.1号
NT_187519.1号Chr1|NT_187519.111重新映射NT_187519.1号
西北_003315907.2Chr1|NW_003315907.211重新映射西北_003315907.2
西北_017852928.1Chr1|NW_017852928.111重新映射西北_017852928.1
西北_018654707.1Chr1|NW_018654707.1910重新映射西北_018654707.1
NT_187531.1号第2章| NT_187531.111重新映射NT_187531.1号
西北_011332690.1频道2 | NW_011332690.122重新映射西北_011332690.1
NT_187536.1号第3章| NT_187536.111重新映射NT_187536.1号
西北_011332691.1第3章|西北_011332691.111重新映射西北_011332691.1
西北_019805489.1第3章| NW_019805489.11011重新映射西北_019805489.1
西北_019805490.1第3章| NW_019805490.1三三重新映射西北_019805490.1
国家标准_187679.1第4章| NT_187679.111重新映射NT_187679.1号
西北_003315914.1第4章| NW_003315914.111重新映射西北_003315914.1
西北_003315915.1第4章| NW_003315915.177重新映射西北_003315915.1
西北_017363814.1时间4 |西北_017363814.111重新映射西北_017363814.1
NT_187651.1号色谱图5 | NT_187651.111重新映射NT_187651.1号
西北_003315917.2第5章| NW_003315917.211重新映射西北_003315917.2
西北_003315918.1第5章| NW_003315918.111重新映射西北_003315918.1
西北_016107298.1第5章| NW_016107298.144重新映射西北_016107298.1
NT_187552.1号第6章| NT_187552.122重新映射NT_187552.1号
NT_187553.1号第6章| NT_187553.122重新映射NT_187553.1号
NT_187556.1号第6章| NT_187556.111重新映射新台币18756.1元
西北_004166862.2色谱6|NW_004166862.211重新映射NW_004166862.2型
西北_009646200.1第6章| NW_009646200.111重新映射西北_009646200.1
NT_187558.1号第7章| NT_187558.111重新映射NT_187558.1号
NT_187560.1号第7章| NT_187560.111重新映射NT_187560.1号
NT_187564.1号颜色7 | NT_187564.111重新映射NT_187564.1号
西北_017852929.1第7章|西北_017852929.111重新映射西北_017852929.1
西北_017852930.1第7章|西北_017852930.111重新映射西北_017852930.1
西北_018654714.1第7章|NW_018654714.1三三重新映射西北_018654714.1
西北_018654715.1第7章|NW_018654715.144重新映射西北_018654715.1
NT_187567.1号第8章| NT_187567.155重新映射NT_187567.1号
NT_187571.1号第8章| NT_187571.122重新映射NT_187571.1号
NT_187577.1号第8章| NT_187577.155重新映射新台币187577.1元
NT_187654.1号第8章| NT_187654.111重新映射NT_187654.1号
西北_018654716.1第8章|NW_018654716.111重新映射西北_018654716.1
西北_018654717.1第8章|NW_018654717.11515重新映射西北_018654717.1
新台币187578.1元第9章| NT_187578.111重新映射NT_187578.1号
新台币187580.1元第10章| NT_187580.111重新映射NT_187580.1号
西北_013171806.1Chr10|NW_013171806.1号11重新映射西北_013171806.1
西北_013171807.1Chr10|NW_013171807.1号11重新映射西北_013171807.1
NT_187658.1号Chr12|NT_187658.111重新映射NT_187658.1号
西北_003315938.1频道12|NW_003315938.111重新映射西北_003315938.1
西北_003571050.1Chr12|NW_003571050.1号11重新映射西北_003571050.1
西北_009646204.1Chr12|NW_009646204.11717重新映射西北_009646204.1
西北_011332696.1Chr12|NW_011332696.1号11重新映射西北_011332696.1
西北_015148967.1频道12|NW_015148967.111重新映射西北_015148967.1
西北_018654718.1Chr12|NW_018654718.1号11重新映射西北_018654718.1
NT_187595.1号Chr13|NT_187595.1号11重新映射NT_187595.1号
西北_011332700.1频道13|NW_011332700.111重新映射西北_011332700.1
NT_187601.1号第14章| NT_187601.122重新映射NT_187601.1号
NT_187660.1号第15章| NT_187660.155重新映射NT_187660.1号
NT_187607.1号色谱图16 | NT_187607.145重新映射NT_187607.1号
西北_017852933.1时间16 |西北_017852933.156重新映射西北_017852933.1
NT_187663.1号Chr17|NT_187663.111重新映射NT_187663.1号
NT_187615.1号Chr17|NT_187615.1号11重新映射NT_187615.1号
西北_003315952.3Chr17 | NW_003315952.3号11重新映射西北_003315952.3
西北_003315954.1Chr17 |西北_003315954.111重新映射西北_003315954.1
西北_016107299.1Chr17 | NW_016107299.1号2三重新映射西北_016107299.1
西北_019805503.1Chr18|NW_019805503.177重新映射西北_019805503.1
西北_003315964.2Chr19 | NW_003315964.2号11重新映射NW_003315964.2型
西北_003315965.1Chr19 | NW_003315965.1号11重新映射西北_003315965.1
NT_187623.1号第20章| NT_187623.111重新映射NT_187623.1号
NT_187626.1号第21章| NT_187626.111重新映射NT_187626.1号
NT_187635.1号基督色|NT_187635.111重新映射NT_187635.1号
西北_009646195.1Chr1|NW_009646195.1号三三重新映射西北_009646195.1
NT_187562.1号第7章| NT_187562.178重新映射NT_187562.1号
NT_187653.1号第7章| NT_187653.111重新映射NT_187653.1号
NT_187576.1号第8章| NT_187576.111重新映射NT_187576.1号
NT_187593.1号Chr13|NT_187593.1号22重新映射NT_187593.1号
西北_011332698.1Chr13|NW_011332698.1号22重新映射西北_011332698.1
NT_187603.1号第15章| NT_187603.111重新映射国家标准_187603.1
西北_011332701.1Chr15 | NW_011332701.1号44重新映射西北_011332701.1
NT_187661.1号Chr17|NT_187661.111重新映射NT_187661.1号
NT_187614.1号Chr17|NT_187614.11415重新映射NT_187614.1号
编号：0009646206.1Chr19|NW_009646206.111重新映射西北_009646206.1
编号187633.1第22章| NT_187633.155重新映射NT_187633.1号
序列IDChr公司变量区域数变量调用数放置类型链接到图形显示
NC_000001.10号叶绿素1448456提交NC_000001.10号
NC_000002.11号第2章359363提交NC_000002.11号
NC_000003.11号氯代甲烷3337339提交NC_000003.11号
NC_000004.11号第4章359359提交NC_000004.11号
NC_ 000005.9第5章428431提交NC_ 000005.9
NC_000006.11号第6章330345提交NC_000006.11号
NC_000007.13号第7章389390提交NC_000007.13号
NC_000008.10号第8章485487提交国家电网公司_000008.10
NC_000009.11号第9章275276提交NC_000009.11号
NC_000010.10号10氯286296提交NC_000010.10号
NC_000011.9号第11章265266提交NC_000011.9号
NC_000012.11号第12章325326提交NC_000012.11号
NC_000013.10号第13代256258提交NC_000013.10号
NC_000014.8号第14章138139提交NC_000014.8号
NC_000015.9号第15章133133提交NC_000015.9号
NC_000016.9号第16章168172提交NC_000016.9号
NC_000017.10号第17页168173提交NC_000017.10号
NC_000018.9号第18章137138提交NC_000018.9号
NC_000019.9号第19章7475提交NC_000019.9号
NC_000020.10号第20章218218提交NC_000020.10号
NC_000021.8号第21章6969提交NC_000021.8号
NC_000022.10号第22章5959提交国家电网公司_000022.10
NC_000023.10号换热器X238246提交NC_000023.10号
NC_000024.9号ChrY公司3234提交NC_000024.9号

变量区域重新映射状态变量调用重新映射状态
序列IDChr公司源上的变量区域完美的很好通过失败多重对源的变量调用完美的很好通过失败多重
NC_000001.10号叶绿素144835531501404563593270141
NC_000002.11号第2阶段35930620三09536331020三095
NC_000003.11号第3章337276230079339277230080
NC_000004.11号第4章359306132086359306132086
NC_ 000005.9第5章42831917403304313221740330
NC_000006.11号第6章330277125三71345287175三71
NC_000007.13号第7章389317407032390317408032
NC_000008.10号第8章48537740501664873784060166
NC_000009.11号第9章275249111037276250111037
NC_000010.10号10氯28622315三011429622721三0114
NC_000011.9号第11章2652338三0602662348三060
网络中心_000012.11第12章32526215三09032626315三090
NC_000013.10号第13章2562209506325822295063
NC_000014.8号第14章1381176103513911861035
NC_000015.9号第15章133104141026133104141026
NC_000016.9号第16章168136150031172137160033
NC_000017.10号17瑞士法郎168112185050173115185052
NC_000018.9号第18章137105112061138106112061
NC_000019.9号第19章74411560297541157029
新冠_000020.10第20章21818127三01921818127三019
NC_000021.8号第21章69442000116944200011
NC_000022.10号第22页59192441235919244123
NC_000023.10号换热器X23815479三0524615487三05
NC_000024.9号ChrY公司322010006342111006

样品集

样本数量：1

姓名：
前列腺癌细胞系大结构变异调用
描述：
普通前列腺癌细胞系的大结构变异呼叫（>30kb）和拷贝数变异
尺寸：
12
生物体：
智人
样本表型：
前列腺肿瘤
性别：
男性
  • 将示例下载为CSV文件
    • 样本集1的样本
    样本ID单元格类型主题ID性别受试者表型
    SAMN20524660标准去势小鼠异种移植LnCAP的去势抗性亚克隆LNCaP_C42b公司男性未报告
    SAMN20524663标准人乳头瘤病毒18永生化前列腺上皮细胞系RWPE-1型男性未报告
    SAMN20524656号雄激素敏感型前列腺癌淋巴结转移LAPC4号机组男性未报告
    SAMN20524655号脑转移性前列腺癌DU145型男性未报告
    第0524664页雄激素敏感型前列腺癌椎骨转移VCaP公司男性未报告
    SAMN20524665标准去势小鼠异种移植VCAP的去势抗性亚克隆VCaP-CR公司男性未报告
    SAMN20524654标准原发性前列腺癌CWR22Rv1型男性未报告
    SAMN20524657号去势小鼠异种移植LAPC4的去势抗性亚克隆LAPC4-CR公司男性未报告
    SAMN20524658标准雄激素反应性转移性前列腺癌至淋巴结LNCaP公司男性未报告
    SAMN20524662标准前列腺癌骨转移PC3公司男性未报告
    SAMN20524659号雄激素缺乏细胞培养获得的LnCAP抗去势亚克隆LNCaP_Abl公司男性未报告
    SAMN20524661标准男性激素反应性前列腺癌骨转移MDA-Pca-2b型男性未报告

    实验细节

    实验ID类型方法分析平台变量调用数
    1发现排序成对end映射Illumina高序列X十5,936

    验证

    本研究未提交验证数据。