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基因、基因组特征和图谱
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基因、基因组特征和图谱
•
基因和标记查询
通过符号、名称、位置、基因本体分类或表型搜索基因和基因组特征。
•
批量查询
输入基因ID或符号列表,检索其他数据库ID和基因属性(例如表型、GO)。
•
多基因组查看器(MGV)
比较重新测序小鼠菌株的基因组特征。
•
JBrowse基因组浏览器
创建小鼠基因组区域基因组特征的图形显示。
•
鼠标地雷
通过InterMine访问MGI数据。
表型、等位基因和疾病模型
•
表型、等位基因和疾病查询
基于表型、人类疾病、突变类型、基因或基因组位置搜索突变或QTL。
•
哺乳动物表型(MP)浏览器
搜索或浏览表型术语以查找相关突变基因型。
•
人类疾病(DO)浏览器
浏览人类疾病或条件术语以查找小鼠模型。
要进行搜索,请使用任何MGI页面右上角的“快速搜索”框。
•
人类表型(HPO)浏览器
搜索或浏览人类表型术语,以查找具有这些表型的相关人类疾病。
•
人-鼠:疾病联系(HMDC)
一种翻译工具,用于探索和比较人类和小鼠的表型及其与已知人类疾病的关联,并提供快速访问小鼠模型资源和支持参考。
基因表达
•
基因表达数据标准搜索
使用各种搜索参数搜索基因表达结果。
•
基因表达数据差异表达搜索
搜索在解剖结构和/或发育阶段而不是其他阶段表达的基因。
•
基因表达数据档案搜索
通过表达谱搜索基因。
•
基因表达数据批量搜索
使用基因列表搜索基因表达结果。
•
小鼠发育解剖学浏览器
搜索或浏览解剖结构;
包含指向关联表达式结果的链接。
•
基因表达数据矩阵
使用交互式Tissue by Stage Matrix访问详细的基因表达结果。
•
基因表达文献查询
寻找发育过程中基因表达的参考。
•
RNA-Seq与微阵列实验搜索
使用示例元数据注释搜索实验。
GO功能注释
•
GO浏览器
浏览MGI中的基因本体和鼠标注释。
•
基因和标记查询
使用GO术语和其他基因属性搜索基因。
•
批量查询
获取用于GO工具的MGI ID集。
菌株、SNP和多态性
•
应变查询
按名称、同义词或属性搜索菌株。
•
SNP查询
通过菌株、SNP属性、基因组位置或相关基因搜索SNP。
•
多基因组查看器(MGV)
比较重新测序小鼠菌株的基因组特征。
•
更多
序列
•
NCBI爆破
使用NCBI BLAST搜索序列相似性。
•
JBrowse基因组浏览器
创建小鼠基因组区域基因组特征的图形显示。
•
批量查询
下载一批基因ID或符号的数据。
工具书类
•
引用查询
按标题、作者、期刊、年份或摘要搜索参考文献(带摘要)。
•
基因表达文献查询
寻找发育过程中基因表达的参考。
本体论
•
GO浏览器
浏览MGI中的基因本体论和鼠标注释。
•
人类疾病(DO)浏览器
浏览人类疾病或条件术语以查找小鼠模型。
要进行搜索,请使用任何MGI页面右上角的“快速搜索”框。
•
哺乳动物表型(MP)浏览器
搜索或浏览表型术语以查找相关突变基因型。
•
人类表型(HPO)浏览器
搜索或浏览人类表型术语,以查找具有这些表型的相关人类疾病。
•
小鼠发育解剖学浏览器
搜索或浏览解剖结构;
包含指向关联表达式结果的链接。
•
成年老鼠解剖浏览器
广泛的第28阶段词典;
尚未用于表达式数据的注释。
其他搜索
•
重组酶(cre)
获取敲入和转基因等位基因的重组酶(cre)活性数据。
•
人类癌症小鼠模型
MMHCdb提供小鼠自发和诱发肿瘤的频率、病理学和遗传学信息。
贡献项目:
小鼠基因组数据库(MGD)、基因表达数据库(GXD)、人类癌症小鼠模型数据库(MMHCdb)(前身为小鼠肿瘤生物学(MTB))、基因本体(GO)
引用这些资源
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05/14/2024
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