一种新型卤代烷脱卤酶的结构和功能分析

查洛普科娃,T.普鲁德尼科娃,P.雷扎科娃,Z.普罗科普,T.库德拉科娃,L.丹尼尔,J.布雷佐夫斯基,W.Ikeda-Ohtsubo公司,Y.佐藤,M.库蒂,Y.Nagata（永田）,I.库塔·斯马塔诺娃和J.丹博斯基

在新分离的卤代烷脱卤酶DbeA的晶体结构中鉴定出两个卤素结合位点埃氏慢生根瘤菌USDA94。消除第二个卤化物结合位点显著改变了酶的底物特异性、催化活性和在氯化物存在下的稳定性。卤代烷脱卤酶突变后底物特异性类别发生了变化，这是首次证明。

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一种新型卤代烷脱卤酶的结构和功能分析

查洛普科娃,T.普鲁德尼科娃,P.雷扎科娃,Z.普罗科普,T.库德拉科娃,L.丹尼尔,J.布雷佐夫斯基,W.Ikeda-Ohtsubo公司,Y.佐藤,M.库蒂,Y.Nagata（永田）,I.库塔·斯马塔诺娃和J.丹博斯基

在新分离的卤代烷脱卤酶DbeA的晶体结构中鉴定出两个卤素结合位点埃氏慢生根瘤菌USDA94。消除第二个卤化物结合位点显著改变了酶的底物特异性、催化活性和在氯化物存在下的稳定性。卤代烷脱卤酶突变后底物特异性类别发生了变化，这是首次证明。

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卤代烷烃脱卤酶DbjA的结晶和初步晶体学分析慢生型大豆根瘤菌110美元

Y.佐藤,夏目漱石,M.Tsuda先生,J.丹博斯基,Y.Nagata（永田）和T.森达

以聚乙二醇4000为沉淀剂，采用悬挂滴气相扩散法结晶卤代烷脱卤酶DbjA。晶体属于正交系，空间群P（P）2₁2₁2并衍射至1.75º分辨率。

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来自日本鞘翅目UT26型

O.Degtjarik先生,查洛普科娃,P.雷扎科娃,M.库蒂,J.丹博斯基和I.库塔·斯马塔诺娃

为了研究酶的功能，构建了两个携带单点和双点突变的卤代烷烃脱卤酶变体LinB32和LinB70，并在不同的结晶条件下结晶。LinB变体及其与卤化底物的配合物的衍射分辨率为1.6至2.8º。

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冷适应卤代烷脱卤酶DpcA的晶体结构嗜冷核菌K5公司

K.Tratsiak公司,T.普鲁德尼科娃,I.德里诺夫斯卡,J.丹博斯基,J.布林达,P.帕科尔,M.库蒂,查洛普科娃,P.雷扎科娃和I.库塔·斯马塔诺娃

嗜冷细菌卤代烷脱卤酶DpcA的结构嗜冷核菌K5是一种生物技术应用中很有吸引力的酶，其原子分辨率为1.05 Au。与其他卤代烷脱卤酶相比，该酶具有最短的主通道和狭缝通道。结构比较显示了帽状结构域α4螺旋区域的主要差异，这是隧道特性的决定因素之一。DpcA的结构信息为理解其催化特性奠定了基础，并可以指导这种冷适应酶的修饰以用于各种生物技术应用。

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卤代烷脱卤酶DhaA31降解1,2,3-三氯丙烷的结晶分析

M.拉霍达,J.R.梅斯特,A.Stsiapanava公司,查洛普科娃,M.库蒂,J.丹博斯基和I.库塔·斯马塔诺娃

蒸汽浸泡红色R卤代烷脱卤酶变体DhaA31与1,2,3-三氯丙烷在室温和pH 6.5条件下促进了蛋白质底物复合物的产生。将无底物的DhaA31结构与DhaA31-底物络合物的结构进行比较，揭示了亲核残基Asp106的两种可选构象和卤化物释放的可能途径，而将DhaA31-DhaA与野生型DhaA进行比较，则揭示了活性位点的尺寸减小和溶剂可及性。

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卤代烷脱卤酶DhaA31降解1,2,3-三氯丙烷的结晶分析

M.拉霍达,J.R.梅斯特斯,A.Stsiapanava公司,查洛普科娃,M.库蒂,J.丹博斯基和I.库塔·斯马塔诺娃

晶体的蒸汽浸泡红色R卤代烷脱卤酶变体DhaA31与1,2,3-三氯丙烷在室温和pH 6.5条件下促进了蛋白质底物复合物的产生。将无底物的DhaA31结构与DhaA31-底物络合物的结构进行比较，揭示了亲核残基Asp106的两种可选构象和卤化物释放的可能途径，而将DhaA31DhaA与野生型DhaA进行比较，则揭示了活性位点的尺寸减小和溶剂可及性。

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具有两个卤素结合位点的新型卤代烷脱卤酶的结构-功能关系

T.普鲁德尼科娃,查洛普科娃,P.雷扎科娃,J.丹博斯基和I.库塔·马塔诺娃

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实验室进化的醛还原酶的晶体结构和动力学研究解释了其新底物特异性的急剧变化

S.Sridhar公司,A.扎瓦雷斯,T.-R.基马,S.达尔瓦尼,T.埃里克森,Y.哈吉,T.Reddy Enugala公司,R.K.维伦加和M.Widersten先生

在实验室导向的进化活动中，细菌NADH依赖性还原酶（FucO）的底物特异性已通过两步进化途径改变为接受大量芳香底物，其中每一步都由一点突变组成。新变体（DA1472）的酶动力学数据和晶体结构解释了底物特异性的巨大变化。

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新型卤代烷脱卤酶DpaA的四聚体结构伞形肺吸虫二氧化氮

A.迷宫,T.普鲁德尼科娃,P.格林科维奇,J.R.梅斯特斯,D.姆拉佐娃,查洛普科娃,J.丹博斯基,M.库蒂,P.科伦科和I.库塔·斯马塔诺娃

来自的DpaA琼脂拟杆菌NO2是一种新型的卤代烷脱卤酶，已被成功纯化和结晶。基于本文报道的晶体学数据的DpaA模型提供了卤代烷脱卤酶亚家族I中四聚体结构的第一个例子。

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