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九个包含规范和非规范碱基对的A型DNA 18聚体晶体结构的精细化和验证得益于二核苷酸构象类(NtCs)的使用。

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代数几何和拓扑结构链允许人们挑选出一类特殊的离散螺旋结构。这些结构的对称性决定了α-螺旋的结构参数和A类,BZ轴DNA的形式。

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这篇综述提供了目前已鉴定的DNA结构的词汇表,并概述了在Watson和Crick最初发现DNA结构整整50年后对DNA结构的理解。它还强调了在给新的DNA多晶型命名时需要谨慎。

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本文从最终晶体学统计、原子位移参数的描述和电子密度图的质量方面,介绍了利用可转移非球面原子模型对超高分辨率X射线数据进行分子结构精细化的优点,而非经典的独立原子模型方法。

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与蛋白质和小分子相互作用引起的DNA双螺旋的大变形是支持DNA生物功能所必需的。在这里,可以在https://dnatco.org网址将二核苷酸构建块划分为44个不同的结构类和第一个DNA结构字母表的11个字母,并用于分析几种典型的DNA结构。

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外消旋Z-DNA的晶体结构在中心对称空间群中以0.78º的超高分辨率进行了求解,显示出多重构象的大量存在,不仅在主干上,而且在一些碱基对上。该结构还揭示了新的水合模式和不寻常的双螺旋堆积模式。

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在没有二价金属阳离子和多胺的情况下,Z-DNA的晶体结构中观察到磷酸基团的各种结构波动和小沟槽中的水合作用。

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报道了FOXO4-DBD-DNA复合物的1.9μ分辨率结构,并与FOXO-DBD-DNA复合体的其他已知结构进行了比较。

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Runt-domain(RD)蛋白调节靶基因的转录。DNA双链TCTGCGGTC公司/T型GACCGCA公司G、 结合RD转录因子的结合位点(粗体),在空间群中结晶P(P)4对两个晶体进行的X射线分析显示,A-DNA螺旋的两种不同构象,衍射分辨率分别为1.7和2.0º,单位-细胞参数略有变化。

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