Sirt2(sirtuin 2)-大鼠基因组数据库

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基因:Sirt2(sirtuin 2)褐家鼠
分析
符号: Sirt2号机组
姓名: 西尔图因2
RGD ID: 621481
描述: 启用NAD依赖性蛋白赖氨酸脱乙酰酶活性和微管蛋白脱乙酰酶活动。参与多个过程,包括外周神经系统的髓鞘形成;神经系统发育调控;和调节突触后神经递质受体的内化。位于几个细胞成分中,包括Schmidt-Lanterman切迹;侧环;和主要轴突。异染色质的一部分。活跃于谷氨酸能突触。用于研究高级胶质瘤和代谢功能障碍相关的脂肪性肝病。可卡因依赖和间歇性跛行的生物标志物。与人SIRT2同源(sirtuin 2);组蛋白修饰途径的参与者;Sirtuin介导的途径;与2,3,7,8-四氯二苯并二恶嗪的相互作用;3-氯丙烷-1,2-二醇;4,4'-磺酰二酚。
类型: 蛋白质编码
RefSeq状态: 已验证
以前称为: 5E5抗原;MGC105900;NAD依赖性脱乙酰酶sirtuin-2;NAD依赖性蛋白脱乙酰酶sirtuin-2;NAD依赖性蛋白脱脂肪酰化酶sirtuin-2;调节蛋白SIR2同源物2;类SIR2蛋白2;sirtuin(无声交配型信息调节2同源物)2(酿酒酵母);sirtuin 2(无声交配型信息调节2,同源)2(酿酒酵母)
RGD正交测井
人类
鼠标
灰鼠
倭黑猩猩
松鼠
清管器
绿猴子
裸鼹鼠
联盟Orthologs
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最新装配: mRatBN7.2-mRatBN7.2组件
职位:
大鼠组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J罗兹美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
GRCr8型193,181,472 - 93,204,499 (+)美国国立生物技术信息中心GRCr8型
额定BN7.2184,053,883 - 84,076,975 (+)美国国立生物技术信息中心额定BN7.2额定BN7.2
mRatBN7.2信号群184,052,903 - 84,076,975 (+)合奏mRatBN7.2信号群
UTH_Rnor_SHR_Utx189,463,787 - 89,486,870 (+)美国国立生物技术信息中心雷诺_SHRUTH_Rnor_SHR_Utx
UTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0197,922,897 - 97,945,932 (+)美国国立生物技术信息中心雷诺_SHRSPUTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0
UTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0191,219,644 - 91,242,728 (+)美国国立生物技术信息中心雷诺_WKYUTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0
雷诺_6.0186,948,866 - 86,971,954 (+)美国国立生物技术信息中心6.0卢比雷诺_6.0第6轮6.0卢比
Rnor_6.0乐团186,948,918 - 86,971,952 (+)合奏6.0卢比第6轮6.0卢比
雷诺_5.0188,130,012 - 88,153,086 (+)美国国立生物技术信息中心雷诺5.0雷诺_5.0第5轮雷诺5.0
RGSC_v3.4183,873,578 - 83,896,121 (+)美国国立生物技术信息中心RGSC3.4标准RGSC_v3.4rn4型RGSC3.4标准
塞莱拉178,446,589 - 78,469,133 (+)美国国立生物技术信息中心塞莱拉
细胞遗传学图1第21季度美国国立生物技术信息中心
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模型



基因-化学相互作用注释单击以查看注释详细视图
(S) -苯丙胺(ISO)
1,2-二甲基肼(ISO)
1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氢吡啶(ISO)
17-β-雌二醇(ISO)
2,2',4,4'-四溴二苯醚(ISO)
2,3,7,8-四氯二苯并二恶英(EXP、ISO)
2,4,6-三溴苯酚(ISO)
3,3',5,5'-四溴双酚A(ISO)
3-氯丙烷-1,2-二醇(出口)
3-甲基胆蒽(ISO)
4,4'-二氨基二苯甲烷(ISO)
4,4'-磺酰二苯酚(EXP、ISO)
6-氯-2,3,4,9-四氢-1H-咔唑-1-甲酰胺(ISO)
6-丙基-2-硫氧嘧啶(出口)
乌头碱(出口)
阿米特罗(出口)
氯化铵(出口)
马兜铃酸A(ISO)
阿斯巴甜(ISO)
苯并[a]芘(ISO)
苯并[a]芘二醇环氧化物I(ISO)
小檗碱(ISO)
邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(ISO)
双酚A(EXP、ISO)
双酚F(出口)
咖啡因(ISO)
大麻二酚(ISO)
碳纳米管(ISO)
三氯化铈(ISO)
铬(6+)(ISO)
顺铂(ISO)
氯氮平(ISO)
可卡因(出口)
香豆素(ISO)
十溴二苯醚(ISO)
二嗪酮(出口)
邻苯二甲酸二丁酯(ISO)
狄氏剂(出口)
己烯雌酚(出口)
苯二甲酸二异壬酯(ISO)
乙醇(EXP、ISO)
甲基磺酸乙酯(ISO)
倍硫磷(ISO)
叶酸(ISO)
甲醛(ISO)
庆大霉素(出口)
过氧化氢(ISO)
酮康唑(出口)
脂多糖(ISO)
代森锰锌(ISO)
马内布(ISO)
锰原子(ISO)
锰(0)(ISO)
氯化锰(II)(ISO)
二甲双胍(ISO)
甲基苯丙胺(出口)
杀扑磷(ISO)
甲基咪唑(出口)
甲氨蝶呤(ISO)
甲基磺酸甲酯(ISO)
氯化甲基汞(ISO)
美托兰(ISO)
邻苯二甲酸单(2-乙基己基)酯(ISO)
谷氨酸钠(ISO)
N-甲基-4-苯基吡啶(出口)
N-亚硝基二乙胺(出口)
二氯化镍(出口)
烟酰胺(ISO)
烟酸(ISO)
去甲肾上腺素(ISO)
十八酸(ISO)
紫杉醇(ISO)
全氟辛烷-1-磺酸(ISO)
咖啡酸苯乙酯(出口)
苯巴比妥(EXP、ISO)
吡林酸(ISO)
翼手龙(ISO)
白藜芦醇(ISO)
鱼藤酮(出口)
七氟醚(出口)
西罗莫司(ISO)
西尔蒂诺(ISO)
磺胺二甲氧嘧啶(出口)
牛磺脱氧胆酸(出口)
四氯化碳(ISO)
茶碱(ISO)
硫代乙酰胺(出口)
二氧化钛(ISO)
雷公藤酮(ISO)
氨基甲酸乙酯(ISO)
丙戊酸(ISO)


生物过程
自噬(国际能源署)
细胞分裂(国际能源署)
细胞脂质分解代谢过程(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
细胞对热量限制的反应(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
肾上腺素刺激的细胞反应(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
细胞对缺氧的反应(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
细胞对氧化应激的反应(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
染色质组织(ISO)
染色质重塑(国际能源署)
基因表达的表观遗传调控(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
减数分裂细胞周期(国际能源署)
周围神经系统的髓鞘形成(IEA、IMP、ISO)
细胞凋亡过程的负调控(进口)
自噬的负调控(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
DNA模板转录的负调控(ISO)
脂肪细胞分化的负调控(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
NLRP3炎症小体复合物组装的负调控(国际能源署、国际标准化组织)
少突胶质细胞分化的负调控(进口)
少突胶质细胞祖细胞增殖的负调控(进口)
肽基-卟啉磷酸化的负调控(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
蛋白质分解代谢过程的负调控(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
活性氧代谢过程的负调控(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
横纹肌组织发育的负调控(国际能源署、国际标准化组织)
RNA聚合酶II对转录的负调控(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
NLRP3炎症小体复合物组件(国际能源署、国际标准化组织)
纺锤体微管与动粒结合的正调控(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
细胞分裂的正调控(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
细胞凋亡执行期的正调控(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
脂肪酸生物合成过程的正调控(国际能源署、国际标准化组织)
减数分裂核分裂的正调控(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
卵母细胞成熟的正调控(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
蛋白酶体泛素依赖性蛋白质分解代谢过程的正调控(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
RNA聚合酶II对转录的正向调节(IEA、ISO、ISS)
翻译后蛋白质修饰(国际能源署)
蛋白酶体介导的泛素依赖性蛋白质分解代谢过程(IEA、ISO、ISS)
细胞周期的调节(ISO、ISS)
脂肪细胞分化的调控(ISO)
髓鞘形成的调节(IEA、IMP、ISO)
突触后神经递质受体内化的调控(EXP、IDA、IEP、IMP)
对可卡因的反应(IEP)
黑质发育(ISO)

蜂窝组件
中心粒(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
中心体(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
染色体(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
细胞质(ISO、ISS)
细胞溶质(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
胶质细胞投射(国际开发协会)
谷氨酸能突触(EXP、IDA、IEP、IMP)
生长锥(国际能源署)
异染色质(国际开发协会)
轴突旁帕帕区(国际开发协会)
横向回路(国际开发协会)
减数分裂纺锤体(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
微管(国际能源署、国际标准化组织)
中身(IEA、ISO、ISS)
线粒体(国际能源署、国际标准化组织)
有丝分裂纺锤体(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
髓鞘(IDA、IEA、ISO、ISS)
髓鞘背侧区(国际开发协会)
核仁(国际能源署、国际标准化组织)
(IBA、ISO、ISS)
偏执连接(IDA、IEA、ISO、ISS)
轴突偏执区(国际开发协会)
核周体(IDA、IEA、ISO、ISS)
细胞质核周区(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
质膜(国际能源署、国际标准化组织)
或施-兰切迹(IDA、IEA、ISO、ISS)
主轴(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
终端回路(国际开发协会)

分子功能
β-微管蛋白结合(ISO)
染色质结合(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
DNA结合转录因子结合(国际能源署、国际标准化组织)
组蛋白乙酰转移酶结合(国际能源署、国际标准化组织)
组蛋白脱乙酰酶活性(ISO、ISS)
组蛋白脱乙酰酶结合(国际能源署、国际标准化组织)
NAD+ADP-核糖基转移酶活性(国际能源署、国际标准化组织)
NAD+绑定(IBA、IEA、ISO)
NAD依赖性组蛋白脱乙酰酶活性(IBA、IEA、ISO)
NAD依赖性组蛋白H4K16脱乙酰酶活性(IEA、ISO、ISS)
NAD依赖性蛋白脱肉豆蔻酰酶活性(IEA、ISO、ISS)
NAD依赖性蛋白去棕榈酰化酶活性(国际能源署、国际标准化组织、国际空间站)
NAD依赖性蛋白赖氨酸脱乙酰酶活性(IDA、ISO、ISS)
蛋白质结合(ISO)
蛋白赖氨酸脱乙酰酶活性(ISO、ISS)
转移酶活性(国际能源署)
微管蛋白脱乙酰酶活性(国际开发协会、国际能源署、国际标准化组织)
泛素结合(国际能源署、国际标准化组织)
锌离子结合(国际能源署、国际标准化组织)

参考文献

参考文献-策划
# 引用标题 参考文献引用
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10 GOA管道 RGD自动化数据管道
11 化学-基因相互作用的数据导入 用于基因-化学相互作用的RGD自动导入管道
12 全面的基因审查和管理 RGD综合基因治疗
13 神经系统中一种可能的DNA结合蛋白5E5 cDNA的克隆和序列分析。 铃木E等。,生物化学杂志(东京)1995年7月;118(1):122-8.
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PubMed的其他参考文献
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PMID:16933150  PMID:17172643  PMID:17488717  PMID:17521387  PMID:17634366  PMID:17681146  PMID:17726514  PMID:18624766  PMID:18640115  PMID:18722353  PMID:19037106  PMID:20543840 
PMID:20562830  PMID:21841822  PMID:22871113  PMID:22926577  PMID:23126280  PMID:23502856  PMID:23886946  PMID:23908241  PMID:23932781  PMID:24177535  PMID:24239092  PMID:24334550 
PMID:24535021  PMID:24681946  PMID:25672834  PMID:26022124  PMID:26089639  PMID:26209361  PMID:26767982  PMID:27264719  PMID:28078537  PMID:29222643  PMID:29304479  PMID:29325994 
PMID:29476059  PMID:31238070  PMID:31255733  PMID:31651707  PMID:32122297  PMID:32134743  PMID:32711564  PMID:32882218  PMID:33159115  PMID:33611744  PMID:33754030  PMID:33821324 
PMID:34666848  PMID:34708398  PMID:34979841  PMID:36915976  PMID:38063126  PMID:38161044 


基因组学

比较地图数据
Sirt2号机组
(褐家鼠-挪威鼠)
大鼠组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J罗兹美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
GRCr8型193,181,472 - 93,204,499 (+)美国国立生物技术信息中心GRCr8型
额定BN7.2184,053,883 - 84,076,975 (+)美国国立生物技术信息中心额定BN7.2额定BN7.2
mRatBN7.2信号群184,052,903 - 84,076,975 (+)合奏mRatBN7.2信号群
UTH_Rnor_SHR_Utx189,463,787 - 89,486,870 (+)美国国立生物技术信息中心雷诺_SHRUTH_Rnor_SHR_Utx
UTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0197,922,897 - 97,945,932 (+)美国国立生物技术信息中心雷诺_SHRSPUTH_Rnor_SHRSP_BbbUtx_1.0
UTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0191,219,644 - 91,242,728 (+)美国国立生物技术信息中心雷诺_WKYUTH_Rnor_WKY_Bbb_1.0
雷诺_6.0186,948,866 - 86,971,954 (+)美国国立生物技术信息中心6.0卢比雷诺_6.0第6轮6.0卢比
Rnor_6.0乐团186,948,918 - 86,971,952 (+)合奏6.0卢比第6轮6.0卢比
雷诺_5.0188,130,012 - 88,153,086 (+)美国国立生物技术信息中心雷诺5.0雷诺_5.0第5轮雷诺5.0
RGSC_v3.4183,873,578 - 83,896,121 (+)美国国立生物技术信息中心RGSC3.4标准RGSC_v3.4rn4型RGSC3.4标准
塞莱拉178,446,589 - 78,469,133 (+)美国国立生物技术信息中心塞莱拉
细胞遗传学图1第21季度美国国立生物技术信息中心
SIRT2型
(智人-人类)
人类装配Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J罗兹美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
GRCh38型1938,878,555 - 38,899,618 (-)美国国立生物技术信息中心GRCh38型GRCh38型汞38GRCh38型
GRCh38.p14信号群1938,878,555 - 38,899,862 (-)合奏GRCh38型汞38GRCh38型
GRCh37型1939,369,195 - 39,390,258 (-)美国国立生物技术信息中心GRCh37型GRCh37型汞19GRCh37型
构建361944,061,040 - 44,082,201 (-)美国国立生物技术信息中心NCBI36标准构建36hg18型NCBI36标准
构建341944,061,039 - 44,082,193美国国立生物技术信息中心
塞莱拉1936171632-36192939(-)美国国立生物技术信息中心塞莱拉
细胞遗传学图19问题13.2美国国立生物技术信息中心
HuRef(HuRef)1935815856-35837294(-)美国国立生物技术信息中心HuRef(HuRef)
CHM1_1型1939,369,665 - 39,390,970 (-)美国国立生物技术信息中心CHM1_1型
T2T-CHM13v2.01941,682,611 - 41,703,673 (-)美国国立生物技术信息中心T2T-CHM13v2.0
Sirt2号机组
(小家鼠-家鼠)
鼠标组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J罗兹美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
GRCm39型728,466,192 - 28,488,086 (+)美国国立生物技术信息中心GRCm39型GRCm39型毫米39
GRCm39信号群728,466,160 - 28,488,086 (+)合奏GRCm39信号群
GRCm38型728,766,752 - 28,788,665 (+)美国国立生物技术信息中心GRCm38型GRCm38型毫米10GRCm38型
GRCm38.p6信号群728,766,735 - 28,788,661 (+)合奏GRCm38型毫米10GRCm38型
MGSC第37版729,551,771 - 29,573,684 (+)美国国立生物技术信息中心GRCm37型MGSC第37版毫米9国家商业银行37
MGSCv36728,475,543 - 28,497,420 (+)美国国立生物技术信息中心MGSCv36毫米8
塞莱拉723,327,529 - 23,349,457 (+)美国国立生物技术信息中心塞莱拉
细胞遗传学图7B1美国国立生物技术信息中心
cM地图716.92美国国立生物技术信息中心
Sirt2号机组
(龙猫-长尾龙猫)
钦奇拉组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J罗兹美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
ChiLan1.0乐团西北_004955468626,365 - 644,441 (+)合奏奇兰1.0
奇兰1.0西北_004955468626,365 - 644,441 (+)美国国立生物技术信息中心奇兰1.0奇兰1.0
SIRT2型
(Panpaniscus-倭黑猩猩/侏儒黑猩猩)
Bonobo组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J罗兹美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
NHGRI_mPanPan1-v22045,181,332 - 45,202,521 (-)美国国立生物技术信息中心NHGRI_mPanPan1-v2
NHGRI _面板11947,051,896 - 47,073,091 (-)美国国立生物技术信息中心NHGRI _面板1
穆迪布鲁_PPA_v01935,984,453 - 36,005,582 (-)美国国立生物技术信息中心穆迪布鲁_PPA_v0穆迪布鲁_PPA_v0潘潘3
窗格1.11944,533,965 - 44,554,838 (-)美国国立生物技术信息中心面板1.1窗格1.1面板面板2
PanPan1.1信号群1944,533,965 - 44,554,799 (-)合奏面板1.1面板面板2
SIRT2型
(犬狼疮-犬)
爪形组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J罗兹美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
CanFam3.1系列1114,224,922 - 114,235,041 (+)美国国立生物技术信息中心CanFam3.1系列CanFam3.1系列canFam3频道CanFam3.1系列
CanFam3.1乐团1114,224,900 - 114,234,583 (+)合奏CanFam3.1系列canFam3频道CanFam3.1系列
狗10K_盒子_Tasha1113,618,889 - 113,636,581 (+)美国国立生物技术信息中心狗10K_盒子_Tasha
ROS_Cfam_1.0型1114,817,111 - 114,834,816 (+)美国国立生物技术信息中心ROS_Cfam_1.0型
ROS_Cfam_1.0乐团1114,817,428 - 114,834,812 (+)合奏ROS_Cfam_1.0乐团
UMICH_缩放3.11114,375,328 - 114,392,089 (+)美国国立生物技术信息中心UMICH_缩放3.1
UNSW_扫描FamBas_1.01114,008,029 - 114,025,710 (+)美国国立生物技术信息中心UNSW_扫描FamBas_1.0
UU_Cfam_GSD_1.01115,003,788 - 115,021,492 (+)美国国立生物技术信息中心UU_Cfam_GSD_1.0
Sirt2号机组
(Ictiomys tridecommineatus-黄毛松鼠)
松鼠组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J罗兹美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
高C_Itri_2西北_02440934913,400,802 - 13,421,980 (-)美国国立生物技术信息中心高C_Itri_2
SpeTri2.0合奏西北_0049366611828831-1850000(-)合奏SpeTri2.0标准SpeTri2.0合奏
SpeTri2.0标准西北_0049366611828868-1849892(-)美国国立生物技术信息中心SpeTri2.0标准SpeTri2.0标准SpeTri2.0标准
SIRT2型
(Sus scrofa-猪)
清管器组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J罗兹美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
Sscrofa11.1合奏647,682,429 - 47,703,384 (-)合奏斯克罗法11.1susScr11斯克罗法11.1
斯克罗法11.1647682427-47703408(-)美国国立生物技术信息中心斯克罗法11.1斯克罗法11.1susScr11斯克罗法11.1
Sscrofa10.2系列643,218,298 - 43,228,967 (-)美国国立生物技术信息中心Sscrofa10.2系列Sscrofa10.2系列susScr3
SIRT2型
(绿叶猴-绿猴)
绿猴组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J罗兹美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
ChlSab1.1标准633,493,106 - 33,518,793 (-)美国国立生物技术信息中心ChlSab1.1标准ChlSab1.1标准叶绿素Sab2
ChlSab1.1信号群633,493,079 - 33,518,647 (-)合奏ChlSab1.1标准ChlSab1.1信号群叶绿素Sab2
版本_WHO_p1.0西北_02366607311,514,410 - 11,540,709 (-)美国国立生物技术信息中心版本_WHO_p1.0版本_WHO_p1.0
Sirt2号机组
(黑头鼹鼠-裸鼹鼠)
裸鼹鼠-捕鼠器组件Chr公司位置(股)来源基因组浏览器
J罗兹美国国立生物技术信息中心UCSC公司合奏
HetGla_female_1.0恩森布尔西北_00462479412,235,263 - 12,259,276 (-)合奏HetGla_电子邮件_1.0HetGla_female_1.0恩森布尔hetGla2型
HetGla 1.0型西北_00462479412,239,363 - 12,259,561 (-)美国国立生物技术信息中心HetGla_电子邮件_1.0HetGla 1.0型hetGla2型

变体

.
Sirt2中的变量
总共122个变体
miRNA靶状态

的预测目标
摘要值
预测计数:68
miRNA基因计数:54
相互作用的成熟miRNAs:60
抄本:ENSRNOT00000064153号
预测方法:Miranda、Rnahybrid、Targetscan
结果类型:miRGate_预测

详细报告可在此处获得: 完整报告 CSV公司 桌棋类游戏 打印机

从miRGate导入的miRNA目标状态数据(http://mirgate.bioinfo.cnio.es/).
有关miRGate的更多信息,请参阅PMID:25858286或访问全文在这里.


区域QTL(mRatBN7.2)
以下内容QTL与此区域重叠。    完整报告 CSV公司 桌棋类游戏 打印机 Gviewer(Gviewer)
RGD ID(RGD ID)符号姓名LOD(检测限)P值特质次要特征Chr公司起点停止物种
1554320数据库1骨密度QTL 112.20.0001股骨矿物质块(VT:001011)体积骨密度(CMO:0001553)150910886060548老鼠
631688Hcas2型肝癌易感性QTL 20.0001肝脏完整性特征(VT:0010547)肝肿瘤病变数(CMO:0001068)15925874115540829老鼠
631495第96页血压QTL 964.52动脉血压特征(VT:2000000)收缩压(CMO:0000004)122340647102268831老鼠
1358359Srard1号机组应激反应性肾上腺重量QTL 14.74肾上腺肿块(VT:0010420)双侧肾上腺湿重(CMO:0000164)130882023123479925老鼠
70225第58页血压QTL 583.3动脉血压特征(VT:2000000)收缩压(CMO:0000004)132356093162846471老鼠
1300172Bp172页血压QTL 1723.56动脉血压特征(VT:2000000)舒张压(CMO:0000005)13273727390665040老鼠
10059597Bp377页血压QTL 3773.420.025动脉血压特征(VT:2000000)收缩压(CMO:0000004)132737458199368955老鼠
2313051Bss57号骨结构和强度QTL 573.70.0001胫骨强度特征(VT:1000284)骨极惯性矩(CMO:0001558)143284731118944897老鼠
2313059英国标准55骨结构和强度QTL 553.20.0001胫骨尺寸特征(VT:0100001)胫骨中段截面积(CMO:00001717)143284731118944897老鼠
2313072Bss53号骨结构和强度QTL 534.30.0001胫骨长度(VT:0004357)胫骨长度(CMO:0000450)143284731118944897老鼠
2313078Bss54号骨结构和强度QTL 543.50.0001胫骨面积(VT:1000281)胫骨中轴横截面积(CMO:0001717)143284731118944897老鼠
2313094Bss58号骨结构和强度QTL 583.70.0001胫骨强度特征(VT:1000284)胫骨断裂前吸收的总能量(CMO:0001736)143284731118944897老鼠
2313098Bmd70型骨密度QTL 703.60.0001胫骨矿物质块(VT:1000283)致密体积骨密度(CMO:0001730)143284731118944897老鼠
2313099Bss56号骨结构和强度QTL 562.40.0001胫骨尺寸特征(VT:0100001)胫骨中轴骨内横截面积(CMO:0001716)143284731118944897老鼠
2302059皮亚36庚烷诱发的关节炎QTL 363.80.001血液免疫球蛋白量(VT:0002460)血清免疫球蛋白G1水平(CMO:0002115)14333300288333002老鼠
2313402安xrr24焦虑相关反应QTL 24攻击相关行为特征(VT:0015014)驯服性/攻击性综合得分(CMO:0002136)148963584144267916老鼠
1578649数据库8骨密度QTL 84.9股骨矿物质块(VT:001011)骨小梁体积密度(CMO:0001729)14939317294393172老鼠
1578654英国标准10骨结构和强度QTL 104股骨形态特征(VT:0000559)股骨颈皮质横截面积(CMO:0001702)149393172159356837老鼠
634314尼多姆44非胰岛素依赖型糖尿病QTL 44血糖量(VT:0000188)血糖水平(CMO:000046)149393289199050459老鼠
6903308第36页血清胆固醇QTL 3620.0125血胆固醇含量(VT:0000180)血浆总胆固醇水平(CMO:0000585)15386304190532583老鼠
61342第27页血压QTL 273.40.0006动脉血压特征(VT:2000000)收缩压(CMO:0000004)15673266898773277老鼠
2300164Bmd44型骨密度QTL 445.40.0001腰椎矿物质块(VT:00010511)体积骨密度(CMO:0001553)156949932101949932老鼠
2298545Neuinf8号机组神经炎QTL 84.6神经系统完整性特征(VT:0010566)脊髓β-2微球蛋白mRNA水平(CMO:0002125)157336763151090257老鼠
1300121小时1心率QTL 13.7心跳特征(VT:20000009)心率(CMO:0000002)165789093115540829老鼠
7421628Bp361页血压QTL 3610.001动脉血压特征(VT:2000000)平均动脉血压(CMO:0000009)166023617118608521老鼠
631512第六等级血清胆固醇水平QTL 69.6血胆固醇含量(VT:0000180)血清总胆固醇水平(CMO:0000363)17219768090508767老鼠
1358192电子产品13雌激素诱导垂体肿瘤发生QTL 133.4垂体肿块(VT:0010496)垂体湿重(CMO:0000853)177494165122494165老鼠
10054135Gmadr2公司肾上腺肿块QTL 21.970.0129肾上腺肿块(VT:0010420)双侧肾上腺湿重(CMO:0000164)177857876122857876老鼠
1549903Bp267页血压QTL 267动脉血压特征(VT:2000000)收缩压(CMO:0000004)177876254106047988老鼠
61344第29页血压QTL 297.5动脉血压特征(VT:2000000)收缩压(CMO:0000004)178350581123350581老鼠
7411712钢筋4中风敏感性QTL 48.7大脑完整性特征(VT:0010549)一段时间内发生脑血管病变的研究人群百分比(CMO:0000932)178430536123430536老鼠
61433Cia2公司胶原诱导关节炎QTL 25关节完整性特征(VT:0010548)关节炎症综合评分(CMO:0000919)17843075491209302老鼠
1582234葡萄糖18葡萄糖水平QTL 183.40.0003血糖量(VT:0000188)血糖水平(CMO:000046)178479925123479925老鼠
4889494评分2血清皮质酮水平QTL 24.2血皮质酮含量(VT:0005345)血浆皮质酮水平(CMO:0001173)180592172125592172老鼠
1578780抄送52心脏质量QTL 523.30.0001心脏质量(VT:0007028)心脏湿重(CMO:000069)181591954219808434老鼠
2313083床位74骨密度QTL 7440.0001胫骨矿物质块(VT:1000283)总体积骨密度(CMO:0001728)182174743118944897老鼠
738022安xrr13焦虑相关反应QTL 134.60.00039运动行为特征(VT:0001392)在实验装置中,穿过、穿过或位于离散空间内的20 x 20 cm地板正方形的数量(CMO:0001514)183547917128547917老鼠

区域中的标记
RH143384型 
大鼠组件Chr公司位置(股)来源J罗兹
额定BN7.2184,057,170 - 84,057,304 (+)MAPPER公司额定BN7.2
雷诺_6.0186,952,154 - 86,952,287美国国立生物技术信息中心6.0卢比
雷诺_5.0188,133,286 - 88,133,419UniSTS大学雷诺5.0
RGSC_v3.4183,876,319 - 83,876,452UniSTS大学RGSC3.4标准
塞莱拉178,449,330 - 78,449,463UniSTS大学
RH 3.4地图1840.7UniSTS大学
细胞遗传学图1第21季度UniSTS大学


表达式


RNA-SEQ表达
高:>1000 TPM值  中等:11至1000 TPM之间
低:0.5至10 TPM之间  低于截止线:<0.5 TPM

胃肠系统的消化部分 循环系统 内分泌系统 外分泌系统 溶血性软脑膜系统 肝胆系统 表皮系统 肌肉骨骼系统 神经系统 肾系统 生殖系统 呼吸系统 附属物
中等 43 57 41 19 41 8 11 74 35 41 11 8
截止线以下

顺序


参考序列帐户Id: ENSRNOT00000064153⟹ENSRNOP00000059450
类型: 编码
职位:
大鼠组件Chr公司位置(股)来源
mRatBN7.2信号群184,053,985 - 84,076,975 (+)合奏
Rnor_6.0乐团186,949,413 - 86,971,952 (+)合奏
参考序列帐户Id: ENSRNOT00000084839⟹ENSRNOP00000069934
类型: 编码
职位:
大鼠组件Chr公司位置(股)来源
mRatBN7.2信号群184,052,903 - 84,076,956 (+)合奏
Rnor_6.0乐团186,948,918 - 86,971,495 (+)合奏
参考序列帐户Id: ENSRNOT00000095928⟹ENSRNOP00000080491
类型: 编码
职位:
大鼠组件Chr公司位置(股)来源
mRatBN7.2信号群184,053,862 - 84,076,960 (+)合奏
参考序列帐户Id: ENSRNOT00000105704⟹ENSRNOP00000086968
类型: 编码
职位:
大鼠组件Chr公司位置(股)来源
mRatBN7.2信号群184,054,158 - 84,076,973 (+)合奏
参考序列帐户Id: NM_001399630⟹NP_001386559
RefSeq状态: 已验证
类型: 编码
职位:
大鼠组件Chr公司位置(股)来源
GRCr8型193,181,472 - 93,204,499 (+)美国国立生物技术信息中心
额定BN7.2184,053,947 - 84,076,975 (+)美国国立生物技术信息中心
参考序列帐户Id: NM_001399631⟹NP_001386560
RefSeq状态: 已验证
类型: 编码
职位:
大鼠组件Chr公司位置(股)来源
GRCr8型193,181,472 - 93,204,499 (+)美国国立生物技术信息中心
额定BN7.2184,053,947 - 84,076,975 (+)美国国立生物技术信息中心
参考序列帐户Id: XM_063266417⟹XP_063122487
类型: 编码
职位:
大鼠组件Chr公司位置(股)来源
GRCr8型193,181,963 - 93,204,499 (+)美国国立生物技术信息中心
参考序列帐户Id: ENSRNOP00000069934⟸ENSRNOT00000084839
参考序列帐户Id: ENSRNOP00000059450⟸ENSRNOT00000064153
参考序列帐户Id: ENSRNOP00000080491⟸ENSRNOT00000095928
参考序列帐户Id: ENSRNOP00000086968⟸ENSRNOT00000105704
参考序列帐户Id: NP_001386559⟸NM_001399630
-肽标签: 亚型1
-UniProtKB: A0A8L2UN46型(UniProtKB/TrEMBL)A6J9K9型(UniProtKB/TrEMBL)
参考序列帐户Id: NP_001386560⟸NM_001399631
-肽标签: 亚型2
参考序列帐户Id: XP_063122487⟸XM_063266417
-肽标签: 亚型X1
蛋白质结构域
脱乙酰酶sirtuin型

蛋白质结构
姓名 建模者 蛋白质Id AA系列 蛋白质结构
AF-Q5RJQ4-F1-型号_v2 AlphaFold公司 问题5RJQ4 1-350 查看蛋白质结构

转录组

eQTL公司   查看Phenogen
WGCNA公司   查看Phenogen
组织/菌株表达   查看Phenogen

促销员
RGD ID:13689887
促销员ID:乙丙橡胶_R407
类型:起始区域
姓名:Sirt2_1号机组
描述:西尔图因2
SO ACC ID:销售订单:0000170
资料来源:EPDNEW(真核启动子数据库,http://epd.vital-it.ch/)
备选推荐人:无效;另请参见乙丙橡胶_R408 
实验方法:单基因测序。
职位:
大鼠组件Chr公司位置(股)来源
雷诺_6.0186,948,945 - 86,949,005EPDNEW公司
RGD ID:13689884
促销员ID:乙丙橡胶_R408
类型:起始区域
姓名:Sirt2_2号机组
描述:西尔图因2
SO ACC ID:销售订单:0000170
资料来源:EPDNEW(真核启动子数据库,http://epd.vital-it.ch/)
替代发起人:无效;另请参见乙丙橡胶_R407 
实验方法:单基因测序。
职位:
大鼠组件Chr公司位置(股)来源
雷诺_6.0186949398-86949458EPDNEW公司

其他信息

数据库 帐户Id 来源
AGR基因 RGD:621481 AgrOrtholog公司
BioCyc基因 G2FUF-60220型 生物周期
集合基因 ENSRNOG00000020102公司 Ensembl、ENTREZENE、UniProtKB/TrEMBL公司
  ENSRNOG00055033286公司 UniProtKB/Swiss-Prot公司
  ENSRNOG00060031851公司 UniProtKB/Swiss-Prot公司
  ENSRNOG00065034052公司 UniProtKB/Swiss-Prot公司
合奏成绩单 ENSRNOT00000064153号 ENTREZGENE公司
  ENSRNOT00000064153.2号文件 UniProtKB/TrEMBL公司
  ENSRNOT00000084839.2号 UniProtKB/TrEMBL公司
  ENSRNOT00000095928号 ENTREZGENE公司
  ENSRNOT00000095928.1号 UniProtKB/TrEMBL公司
  ENSRNOT00000105704.1标准 UniProtKB/TrEMBL公司
  ENSRNOT00055057524号 UniProtKB/Swiss-Prot公司
  ENSRNOT00060055219号 UniProtKB/Swiss-Prot公司
  ENSRNOT00065058483号 UniProtKB/Swiss-Prot公司
通用3D-CATH 3.30.1600.10 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
  TPP-结合域 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
图像_克隆 图片:7134377 图像-MGC_LOAD
InterPro公司 类似DHS-NAD/FAD-binding_dom UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
  Sirtuin公司 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
  Sirtuin_cat_small_dom_sf公司 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
  Sirtuin类_I UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
  Ssirtuin_cat_dom公司 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
KEGG报告 注册号:361532 UniProtKB/Swiss-Prot公司
MGC_克隆 MGC:105900 图像-MGC_LOAD
NCBI基因 Sirt2号机组 ENTREZGENE公司
黑豹 NAD依赖性蛋白脱乙酰酶SIRTUIN-2 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
  NAD依赖性蛋白脱羧酶SIRTUIN-5,线粒体相关 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
Pfam公司 证券投资风险2 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
PhenoGen公司 Sirt2号机组 PhenoGen公司
PIRSF公司 SIR2_euk(英语) UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
PROSITE公司 SIRTUIN公司 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
费率GTEx ENSRNOG00000020102公司 费率GTEx
  ENSRNOG00055033286公司 费率GTEx
  ENSRNOG00060031851公司 费率GTEx
  ENSRNOG00065034052公司 费率GTEx
超级家庭-SCOP SSF52467号 UniProtKB/Swiss-Prot、UniProtKB/TrEMBL
UniProt公司 A0A0G2JWM2_RAT UniProtKB/TrEMBL公司
  A0A8I5ZQA3_RAT UniProtKB/TrEMBL公司
  大鼠 UniProtKB/TrEMBL公司
  a0a8年12月46日 ENTREZGENE,UniProtKB/TrEMBL公司
  A6J9K8_额定值 UniProtKB/TrEMBL公司
  A6J9K9 ENTREZGENE,UniProtKB/TrEMBL公司
  问题5RJQ4 ENTREZGENE,UniProtKB/Swiss-Prot公司


命名历史
日期 当前符号 当前名称 上一个符号 曾用名 描述 参考 状态
2011年8月1日 Sirt2号机组 西尔图因2 Sirt2号机组 sirtuin(无声交配型信息调节2同源物)2(酿酒酵母) 更新命名以反映人类和鼠标命名 1299863 经核准的
2005-01-20 Sirt2号机组 sirtuin(无声交配型信息调节2同源物)2(酿酒酵母)   sirtuin 2(无声交配型信息调节2,同源)2(酿酒酵母) 名称已更新 1299863 经核准的
2002-08-07 Sirt2号机组 sirtuin 2(无声交配型信息调节2,同源)2(酿酒酵母)     符号和名称状态设置为临时 70820 临时的

RGD管理说明
票据类型 注意 参考
基因域 含有一个基本氨基酸区域,特别是精氨酸,还包括一个富含甘氨酸的区域和一个脯氨酸簇 633963
基因蛋白 825个氨基酸 633963