8小时

1.4埃分辨率下的波氏假丝酵母甲酸脱氢酶晶体结构


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.40Å
  • R值自由:0.190 
  • R值工作:0.167 
  • 观察到的R值:0.168 

wwPDB验证  3D报告 完整报告


这是条目的1.1版。查看完整信息历史


文学类

X射线晶体学对野生型和Val120Thr突变体boidinii甲酸假丝酵母脱氢酶的结构分析。

居尔,M。B.Yuksel。布卢特,H。德米尔奇,H。

(2023)《晶体学报D结构生物学》79: 1010-1017

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S2059798323008070
  • 相关结构的主要引文:
    8小时8像质计78IVJ型

  • PubMed摘要:

    博伊迪假丝酵母NAD+-依赖性甲酸脱氢酶(CbFDH)因其在无机二氧化碳生产生物燃料和各种工业化学品中的潜在应用而备受关注。本研究报告了野生型CbFDH在低温和环境温度下的原子X射线晶体结构,以及在土耳其光源“土耳其DeLight”下测定的Val120Thr突变体在低温下的原子X射线晶体结构。这些结构揭示了突变CbFDH活性位点中Thr120和水分子之间的新氢键,表明活性位点的稳定性增强,反应期间电子转移效率更高。需要进一步的实验数据来检验这些假设。总之,这些发现为未来可能提高CbFDH效率和有效性的蛋白质工程研究提供了宝贵的见解。


  • 组织附属关系

    塔基耶伊斯坦布尔34450号科克大学分子生物学和遗传学系。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
甲酸脱氢酶364[念珠菌]波迪尼突变: 0 
基因名称:FDH公司
UniProt公司
寻找蛋白质A0A0A1EQY0型 (博伊迪尼念珠菌)
转到UniProtKB:A0A0A1EQY0型
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团A0A0A1EQY0型
序列注释
展开
  • 参考序列
小分子
配体1独特
身份证件链条姓名/配方/InChI密钥二维示意图3D交互
二氧化硫
SO4查询

下载理想坐标CCD文件
E[认证A]
F[授权A]
G[认证A]
H[认证A]
本人[授权A]
E[认证A],
F[认证A],
G[认证A],
H[认证A],
本人【授权A】,
J[认证A],
K[认证B],
L[认证B],
M[认证B],
N[认证B],
O[认证C],
P[认证C],
Q[认证D],
R[认证D]
硫酸根离子
4S公司
QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L公司
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.40 Å
  • R值自由:0.190 
  • R值工作:0.167 
  • 观察到的R值:0.168 
  • 空间组:第1页
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=54.132α = 78.14
b=68.959β = 89.48
c=109.792γ = 81.11
软件包:
软件名称目的
菲尼克斯精炼
相位器阶段划分
CrysalisPro公司数据缩减
CrysalisPro公司数据缩放

结构验证

查看完整验证报告



进入历史和资金信息

存款数据


资金筹措组织位置授权编号
未提供资金--

修订历史记录(完整详细信息和数据文件)

  • 版本1.0:2023-01-18
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2023-11-08
    更改:数据收集、数据库引用