6右后

亚原子分辨率下氯化物阴离子抑制木霉漆酶的单晶系列研究。15 KGy剂量系列的第一个结构。


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.06 Å
  • R值自由:0.149 
  • R值工作:0.128 
  • 观察到的R值:0.129 

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文学类

利用单晶系列晶体学对氯离子和氟离子抑制漆酶的亚原子分辨研究:酶反应机制的见解。

K.M.波利亚科夫。加夫柳肖夫,S。T.V.费多罗娃。O.A.格拉祖诺娃。A.N.波波夫。

(2019)Acta Crystallogr D Struct Biol公司75: 804-816

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S2059798319010684
  • 相关结构的主要引文:
    6个RGH,6RGP公司,6小时,6RHI型,6RHO型,6RHP基因,6右后,6辆RHU,6辆RHX,6RI0型,6RI2号机组,6RI4号机组,6RI6号机组,6RI8号机组,6RII公司,6风险,6RIL公司

  • PubMed摘要:

    漆酶是一种酶,可以催化各种有机和无机底物的氧化,并将分子氧还原为水。本文用亚原子分辨率的X射线晶体学研究了氯离子和氟离子对担子菌Steccherinum murashkinskyi漆酶的抑制机制。随着吸收X射线辐射剂量的增加,从天然S.murashkinskyi漆酶晶体和漆酶与氯离子和氟离子络合物的晶体中收集了三组X射线衍射数据集。天然漆酶晶体的数据证实了先前推断的分子氧还原酶机制。配合物的结构允许氯离子和氟离子在T2铜离子附近的通道中定位。这些离子取代了这个通道中T2铜离子的氧配体,并且可以在酶反应中扮演这个配体的角色。根据对递增剂量系列结构的分析,氯离子和氟离子对漆酶的抑制作用可以解释为这些负电荷离子在T2铜离子的氧配体位置上的结合阻碍了T2铜的还原。


  • 组织附属关系以下为:

    俄罗斯联邦莫斯科Vavilova街32号俄罗斯科学院恩格尔哈特分子生物学研究所,邮编:119991。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
漆酶2498穆拉什金斯基剑尾草突变: 0 
欧盟委员会:1.10.3.2
UniProt公司
寻找蛋白质I1VE66型 (剑尾草)
探索第66页 
转到UniProtKB:I1VE66型
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团I1VE66型
序列注释
展开
  • 参考序列
低聚糖

帮助

实体ID:2
分子链条长度二维示意图糖基化3D交互
2-乙酰氨基-2-脱氧-beta-D-吡喃葡萄糖-(1-4)-2-乙酰氨基-2-deoxy-beta-D-吡喃糖
B、 C类
2N-糖基化
糖基化资源
GlyTouCan公司:G42666HT型
GlyCosmos公司:G42666HT型
GlyGen基因:G42666HT型
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.06 Å
  • R值自由:0.149 
  • R值工作:0.128 
  • 观察到的R值:0.129 
  • 空间组:第2页12121
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=56.06α = 90
b=83.97β = 90
c=111.97γ = 90
软件包:
软件名称目的
REFMAC公司精炼
XDS公司数据缩减
XSCALE公司数据缩放
摩尔代表阶段划分

结构验证

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进入历史和资金信息

存款数据


资金筹措组织位置授权编号
俄罗斯基础研究基金会俄罗斯联邦16-04-00552

修订历史记录(完整的详细信息和数据文件)

  • 版本1.0:2019-05-01
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2019-09-11
    更改:数据收集、数据库引用
  • 版本2.0:2020-07-29
    类型:补救
    原因:碳水化合物修复
    更改:原子模型、数据收集、派生计算、结构摘要
  • 版本2.1:2024-01-24
    更改:数据收集、数据库引用、细化描述、结构摘要