6千克

人激肽释放酶6(I218Y)与GSK144配合物的晶体结构


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.68 Å
  • R值自由:0.219 
  • R值工作:0.191 
  • 观察到的R值:0.193 

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文学类

评估激肽释放酶5的晶体替代物在Netherton综合征新型抑制剂发现中的作用。

J.H.索普。Edgar,E.V.公司。K.J.史密斯。X.Q.Lewell。雷拉,M。白色,G.V。O.波利亚科娃。拿骚,P。A.L.沃克。D.S.霍姆斯。A.C.皮尔斯。王,Y。J.利德尔。A.霍夫纳尼安。

(2019)《晶体学报F结构生物通讯》75: 385-391

  • 内政部:https://doi.org/10.1107/S20533230X19003169
  • 相关结构的主要引文:
    6QFE公司,6QFF(质量失效框架),6QFG公司,6平方英尺

  • PubMed摘要:

    抑制激肽释放酶5(KLK5)已被确定为治疗遗传性皮肤病Netherton综合征的一种潜在策略,其中SPINK5基因的功能缺失突变导致内源性抑制剂LEKTI-1的下调,并伴有严重过敏表现的深度皮肤屏障缺陷。为了帮助开发针对该靶点的药物,开发了X射线晶体学系统,以促进碎片引导化学和基于知识的药物发现方法。在这里,描述了替代KLK5的替代晶体系统的开发,该系统被证明具有结晶挑战性。证明了晶体学替代物的生物化学稳健性以及该系统用于研究小的非肽片段和类铅分子的适用性。


  • 组织附属关系

    葛兰素史克公司,药物研究中心,Gunnels Wood Road,Stevenage SG1 2NY,England。


大分子
通过以下方式查找相似的蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
卡利克林-6223智人突变: 4 
基因名称:KLK6号机组减贫战略18减贫战略9
欧盟委员会:3.4.21
UniProt&NIH共同基金数据资源
寻找蛋白质Q92876问题 (智人)
探索Q92876问题 
转到UniProtKB:Q92876问题
PHAROS公司:Q92876问题
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团Q92876问题
序列注释
展开
  • 参考序列
小分子
配体2独特
身份证件链条姓名/配方/InChI密钥二维示意图3D交互
J08型 (调查对象/LOI)
J08查询

下载理想坐标CCD文件
D[认证A],
F[授权B]
4-[(5-苯基-1~{H} -咪唑-2-基)甲胺基]-2-(吡啶-3-甲氧基)苯甲酰胺
C类23H(H)22N个6O(运行)
ZDLCAMFQMDNCSU-UHFFFAOYSA-N公司
高尔夫
GOL查询

下载理想坐标CCD文件
C[认证A],
E[认证B]
甘油
C类H(H)8O(运行)
PEDCQBHIVMGVHV-uhffaoysa-N
绑定相关性批注
身份证件来源绑定相关性
J08型 绑定MOAD: 6QFG公司 IC50:3010(nM)来自1次化验
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.68 Å
  • R值自由:0.219 
  • R值工作:0.191 
  • 观察到的R值:0.193 
  • 空间组:第12页11
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=58.4α = 90
b=45.9β = 93.64
c=89.35γ = 90
软件包:
软件名称目的
XDS公司数据缩减
无目标的数据缩放
相位器阶段划分
巴斯特精炼
PDB_提取数据提取

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  • 版本1.0:2019-05-08
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2019-05-15
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    更改:数据收集、数据库引用、优化描述