6盎司

非四面体孪晶葡萄糖异构酶的晶体结构


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.60 Å
  • R值自由:0.220 
  • R值工作:0.190 
  • 观察到的R值:0.190 

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文学类

非四面体孪生:从矿物到蛋白质。

塞夫瓦纳,M。Ruf,M。Uson,I。谢尔德里克(G.M.Sheldrick)。赫伯斯特·伊尔默,R。

(2019)Acta Crystallogr D Struct Biol公司75: 1040-1050

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S2059798319010179
  • 相关结构的主要引文:
    6盎司,6或0

  • PubMed摘要:

    与merohedry孪晶不同,非merohedril孪晶不同畴的倒易晶格并不完全重叠。这将导致三种反射:无重叠的反射、精确重叠的反射和第二域反射的部分重叠的反射。这使得X射线衍射数据的单位-细胞测定、索引、数据集成和缩放变得复杂。然而,事后来看,可以确定数据,因为存在不受孪晶影响的反射。本文介绍了用一种通用的方法成功地解决和精制一种矿物、一种有机金属和两种蛋白质的非汞合金孪晶。单位细胞常数和取向矩阵由程序cell_NOW确定。然后将数据与SAINT整合。TWINABS用于缩放、经验吸收校正和生成两个不同的数据文件,一个文件具有用于结构求解和细化的详细数据,另一个文件用于(通常更准确)针对总积分强度的结构细化。用SHELXT对前两个结构和SHELXC/D/E对两个蛋白质结构进行实验定相求解结构;所有模型都用SHELXL进行了改进。


  • 组织隶属关系

    美国印第安纳州西拉斐特普渡大学生物科学系47907。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|三维结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
木糖异构酶386锈棕色链霉菌突变: 0 
欧盟委员会:5.3.1.5
UniProt公司
寻找蛋白质第24300页 (红色链霉菌)
探索第24300页 
转到UniProtKB:第24300页
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团第24300页
序列注释
展开
  • 参考序列
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.60 Å
  • R值自由:0.220 
  • R值工作:0.190 
  • 观察到的R值:0.190 
  • 空间组:I 2 2 2
单位单元格以下为:
长度(Ω)角度(˚)
a=92.931α = 90
b=97.935β = 90
c=102.706γ = 90
软件包:
软件名称目的
SHELX公司精炼
圣保罗数据缩减
SADABS公司数据缩放
SHELXDE公司阶段划分

结构验证

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进入历史和资金信息

存款数据


筹资组织位置授权编号
西班牙科学、创新和大学部西班牙生物技术2015-64216-P
欧盟(EU)欧洲联盟2014年4月35日

修订历史记录(完整详细信息和数据文件)

  • 版本1.0:2019-12-11
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2024-03-13
    更改:数据收集、数据库引用、派生计算