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用Phaser替代分子时应对强烈的平移非晶体对称性和极端各向异性：人类Rab27a。

（2019）Acta Crystallogr D Struct Biol公司75: 342-353

• 公共医学: 30950405 在PubMed上搜索在PubMed Central上搜索
• DOI（操作界面）：https://doi.org/10.107/S2059798318017825
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  衍射各向异性和平移非晶体对称性（tNCS）等效应引起的数据病理会使大分子晶体结构的求解变得非常复杂。在确定Rab GTP酶成员Rab27a的突变形式的结构时遇到了这样的问题。突变体Rab27a构建物以自由形式结晶，设计用于发现减少原发性肿瘤侵袭和转移的药物。一个构造，hRab27a^静音，在24小时内结晶并衍射至2.82Å分辨率，单位细胞具有容纳大量蛋白质拷贝的空间。最初使用Phaser分子替换来解决结构问题的努力并不成功。对数据集的分析表明，晶体既存在极端各向异性，也存在较强的tNCS。因此，大量反射已估计出标准偏差，其远大于其测量强度和预期强度，揭示了当时在Phaser中使用此类数据的问题。通过消除具有最大各向异性和tNCS综合效应的极弱反射，可以避免这些问题，从而找到分子置换解决方案。在解决这种结构的过程中吸取的经验教训指导了Phaser中使用的数值分析的改进，特别是在识别传递很少信息的衍射测量方面。信息含量的计算也可以作为椭球体截断的替代方法。事后分析还表明，在核算快速旋转功能中的测量误差时存在疏忽。虽然突变体Rab27a的晶体不适合药物筛选，但其结构可以指导新的修饰以获得更合适的晶体形式。

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