人血浆糖蛋白afamin中的受控脱水、结构柔韧性和钆MRI对比剂结合。
公共医学 : 31793901 内政部: https://doi.org/10.107/S2059798319013500 相关结构的主要引文: 6传真 , 第6季度7 PubMed摘要: Afamin是一种人体血浆糖蛋白,是一种假定的疏水性分子的多功能转运体,也是代谢综合征的标志物,它对晶体结构测定提出了多方面的挑战,无论是在实际中还是在模型分析中。 对数百个晶体进行了分析,尽管与非糖基化人血清白蛋白的序列一致性为~34%,但细胞体积的异常变化和结构求解的困难表明该分子表现出可变和上下文敏感的堆积, 尽管昆虫细胞表达的重组afamin中的糖基化简化了。 晶体的控制脱水能够稳定正交晶型,从单斜晶型减少不对称单元中的分子数量,并改变蛋白质的构象状态。 使用MASSIF-1上可用的全自动实验的迭代策略,快速确定实现相变的最佳方案,该方案应适用于多种类型的样品。 该研究还强调了使用单晶体结构模型进行计算建模的缺点,因为模型之间的结合位点构象状态和结合位点中的电子密度(可能由PEG引起)差异很大。 这也适用于非特异性低亲和力配体的分析,在这种分析中,通常可以对具有类似不确定性的各种片段进行建模,从而引起解释偏差。 作为一种混杂的转运体,阿法明似乎也能在至少两个位点结合钆替啶(一种磁共振成像对比剂化合物)。 一对钆替啶分子位于人白蛋白Sudlow位点附近,另一个钆替哚分子位于IA结构域附近的分子间位点。 来自共晶的数据支持在可以从传统测量中放弃的数据集收集的信息的背景下的数据质量的现代度量。