5个UU9

用40%木糖作为冷冻保护剂将四方嗜热菌蛋白酶冷冻至100K


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.60 Å
  • R值自由:0.178 
  • R值工作:0.159 
  • 观察到的R值:0.160 

wwPDB验证  3D报告 完整报告


配体结构质量评估 


这是条目的2.1版。查看完整信息历史


文学类

冷冻溶液热收缩对蛋白质和蛋白质晶体的影响:体积、构象和顺序。

D.H.朱尔斯。C.A.法利。C.P.萨克斯比。科特,R.A。卡恩,J.K.B。R.C.霍尔顿-伯克。哈里森,K。Wu,Z。

(2018)Acta Crystallogr D Struct Biol公司74: 922-938


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
嗜热菌蛋白酶316热蛋白分解芽孢杆菌突变: 0 
基因名称:核动力反应堆
欧盟委员会:3.4.24.27
UniProt公司
寻找蛋白质P00800号 (热蛋白分解芽孢杆菌)
探索P00800号 
转到UniProtKB:P00800号
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团P00800号
序列注释
展开
  • 参考序列
小分子
配体4独特
身份证件链条名称/公式/InChI密钥二维示意图3D交互
XYP公司
查询XYP

下载理想坐标CCD文件
本人[授权A]
J[认证A]
K[认证A]
L[认证A]
M[认证A]
本人【授权A】,
J[认证A],
K[认证A],
L[认证A],
M[认证A],
N[认证A],
O[认证A],
P[认证A]
β-D-木吡喃糖
C类5H(H)105
SRBFZHDQGSBBOR-KKQCNMDGSA-N
DMS系统
DMS查询

下载理想坐标CCD文件
Q[认证A]二甲基亚砜
C类2H(H)6操作系统
IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N公司
ZN公司
ZN查询

下载理想坐标CCD文件
C[认证A],
F[认证A],
G[认证A],
H[认证A]
锌离子

PTFCDOFLOPIGGS-UHFFFAOYSA-N公司

CA查询

下载理想坐标CCD文件
B[认证A],
D[认证A],
E[认证A]
钙离子

BHPQYMZQTOCNFJ-UHFFFAOYSA-N公司
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.60Å
  • R值自由:0.178 
  • R值工作:0.159 
  • 观察到的R值:0.160 
  • 空间组:第4页1212
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=96.819α = 90
b=96.819β = 90
c=106.9γ = 90
软件包:
软件名称目的
菲尼克斯精炼
菲尼克斯阶段划分
CrysalisPro公司数据缩减
SCALA公司数据缩放

结构验证

查看完整验证报告



配体结构质量评估


条目历史记录

存款数据

修订历史记录(完整详细信息和数据文件)

  • 版本1.0:2017-03-08
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2018-09-19
    更改:数据收集、数据库引用
  • 版本2.0:2020-07-29
    类型:补救
    原因:碳水化合物修复
    更改:原子模型、数据收集、派生计算、结构摘要
  • 版本2.1:2024-03-06
    更改:数据收集、数据库引用、结构摘要