5K4季度

布鲁斯锥虫与NAD+结合的L-苏氨酸3-脱氢酶的三维结构精炼至2.3埃


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.30 Å
  • R值自由:0.244 
  • R值工作:0.174 
  • 观察到的R值:0.177 

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文学类

X射线结晶学和几何模拟揭示了寄生原生动物布鲁斯锥虫L-苏氨酸-3-脱氢酶的结构和功能。

Adjogatse,E。厄斯金,P。Wells,S.A.公司。J.M.凯利。J.D.威尔登。陈,A.W.E。塞尔伍德,D。焦化,A。伍德,S。库珀,J.B。

(2018)Acta Crystallogr D Struct Biol公司74电话:861-876

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S2059798318009208
  • 相关结构的主要引文:
    5K4季度,5K4T型,5K4单元,5千4伏,5千瓦,5K4年,5千50,5L9A型,5LC1型

  • PubMed摘要:

    世界上最被忽视的两种热带疾病,非洲人类锥虫病(HAT)和恰加斯病,是由锥虫属原生动物寄生虫引起的。这些生物体具有特殊的代谢途径,通常与人类不同,有可能被开发为新的药物靶点。本研究阐明了HAT病原体布鲁斯锥虫L-苏氨酸-3-脱氢酶(TDH)的结构和功能。TDH是L-苏氨酸代谢中的关键酶,TDH抑制剂已被证明在布氏锥虫的前环形式中具有杀锥虫活性。TDH是人类中的一种无功能假基因,这表明可能通过靶向这种寄生虫酶来合理设计安全、特异的锥虫病治疗方法。作为第一步,表达布鲁氏菌的TDH基因,并通过X射线晶体学求解酶的三维结构。在多晶体结构中,布鲁斯锥虫TDH是一种二聚体短链脱氢酶,在其配体结合区域显示出相当程度的构象变化。结构的几何模拟为了解这种酶的动态行为提供了依据。此外,还测定了TDH与其天然底物和已知抑制剂结合的结构,从而揭示了该酶的催化机理。总之,这些结果为未来靶向TDH或相关酶的药物设计提供了重要细节。


  • 组织附属关系

    英国伦敦WC1E 7HT Gower街伦敦大学学院医学部蛋白质晶体学实验室。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
L-苏氨酸3-脱氢酶320布氏锥虫突变: 0 
欧盟委员会:1.1.1.103
UniProt公司
寻找蛋白质Q7YW97型 (布氏锥虫)
探索Q7YW97型 
转到UniProtKB:Q7YW97型
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团Q7YW97型
序列注释
展开
  • 参考序列
小分子
配体3独特
身份证件链条名称/公式/InChI密钥二维示意图3D交互
北美
NAD查询

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G[认证A]
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L【认证C】
O[认证D]
S[认证E]
G[认证A],
本人【授权B】,
L【授权C】,
O[认证D],
S[认证E],
U[验证F]
烟酰胺腺嘌呤二核苷酸
C类21H(H)27N个714P(P)2
BAWFJGJZGIEFAR-NNYOXOHSSA-N公司
二氧化硫
SO4查询

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R[认证D],
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硫酸根离子
4S公司
QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L公司
高尔夫
GOL查询

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J[认证B]
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P[认证D]
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H[认证A],
J[认证B],
M[认证C],
P[身份验证D],
T[认证E],
V[验证F]
甘油
C类H(H)8
PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N公司
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.30 Å
  • R值自由:0.244 
  • R值工作:0.174 
  • 观察到的R值:0.177 
  • 空间组:第2页1212
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=133.63α = 90
b=277.72β = 90
c=56γ = 90
软件包:
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