5JX5型

GH6 Orpinomyces sp.Y102酶

PDB内政部：https://doi.org/10.2210/pdb5JX5/pdb

分类：水解酶
生物体：Orpinomyces sp.Y102菌
表达式系统：大肠杆菌
突变：没有

存款：2016-05-12 发布日期：2017-05-17
存款作者：蔡，L.C。,H.C.黄。
融资组织：国家安全委员会

实验数据快照

方法：X射线衍射
分辨率：1.80 Å
R值自由：0.239
R值工作：2009年10月
观察到的R值：0.211

wwPDB验证 三维报告完整报告

这是条目的1.1版。查看完整信息历史.

文学类

GH6 Orpinomyces sp.Y102 CelC7酶与纤维二糖复合物的晶体结构

H.C.黄。, L.H.齐。, 陈，Y.C。, 蔡，L.C。

（2019）Acta Crystallogr D生物晶体仪

高分子含量

结构总重量：144.34 kDa
原子数：11278
模拟残留物计数：1288
沉积残留物计数：1288
独特的蛋白质链：1

大分子

通过以下方法查找类似蛋白质：

（通过身份截止）|3D结构

实体ID:1
分子	链条	序列长度	有机体	细节	图像
葡聚糖酶	A类,B,C类,D类	322	Orpinomyces sp.Y102菌	突变: 0 基因名称：立方厘米C7 欧盟委员会：3.2.1
UniProt公司
寻找蛋白质A0A076U926型（Orpinomyces sp.Y102）探索A0A076U926型转到UniProtKB：A0A076U926型
实体组
序列簇	30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团	A0A076U926型
序列注释展开
参考序列

小分子

配体7独特
身份证件	链条	姓名/配方/InChI密钥	二维示意图	3D交互
最大功率密度 MPD查询下载理想坐标CCD文件 SDF格式，链Y[auth B] MOL2格式，链Y[auth B]	Y[认证B]	（4S）-2-甲基-2,4-戊二醇 C类₆H（H）₁₄O（运行）₂ SVTBMSDMJJWYQN-YFKPBYRVSA-N型		互动焦点链Y[auth B] 相互作用和密度焦点链Y[auth B]
钉 PEG查询下载理想坐标CCD文件 SDF格式，链HA[auth C] SDF格式，链IA[auth C] SDF格式，链TA[auth D] MOL2格式，链HA[auth C] MOL2格式，链IA[auth C] MOL2格式，链TA[auth D]	HA[认证C]， IA[认证C]， TA[认证D]	二（羟乙基）醚 C类₄H（H）₁₀O（运行）₃ MTHSVFCYNBDYFN-UHFFFAOYSA-N公司		互动焦点链HA[auth C] 焦点链IA[auth C] 焦点链TA[auth D] 相互作用和密度焦点链HA[auth C] 焦点链IA[auth C] 焦点链TA[auth D]
PO4（PO4） PO4查询下载理想坐标CCD文件 SDF格式，链E[auth A] MOL2格式，链E[auth A]	E[认证A]	磷酸盐离子 O（运行）₄P（P） NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K公司		互动焦点链E[auth A] 相互作用和密度焦点链E[auth A]
高尔夫球 GOL查询下载理想坐标CCD文件 SDF格式，链CA[auth C] SDF格式，链DA[auth C] SDF格式，链F[auth A] SDF格式，链G[auth A] SDF格式，链PA[auth D] SDF格式，链SA[auth D] SDF格式，链V[auth B] MOL2格式，链CA[auth C] MOL2格式，链DA[auth C] MOL2格式，链F[auth A] MOL2格式，链G[auth A] MOL2格式，链PA[auth D] MOL2格式，链SA[auth D] MOL2格式，链V[auth B]	CA[认证C] DA[认证C] F[认证A] G[认证A] PA【认证D】 CA[认证C]， DA[认证C]， F[认证A]， G[认证A]， PA【认证D】， SA[认证D]， V[授权B]	甘油 C类₃H（H）₈O（运行）₃ PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N公司		互动焦点链CA[auth C] 焦点链DA[auth C] 焦点链F[auth A] 焦点链G[auth A] 焦点链PA[auth D] 焦点链SA[auth D] 焦点链V[auth B] 相互作用和密度焦点链CA[auth C] 焦点链DA[auth C] 焦点链F[auth A] 焦点链G[auth A] 焦点链PA[auth D] 焦点链SA[auth D] 焦点链V[auth B]
EDO公司 EDO查询下载理想坐标CCD文件 SDF格式，链BA[auth B] SDF格式，链EA[auth C] SDF格式，链FA[auth C] SDF格式，链GA[auth C] SDF格式，链H[auth A] SDF格式，链I[auth A] SDF格式，链J[auth A] SDF格式，链K[auth A] SDF格式，链L[auth A] SDF格式，链M[auth A] SDF格式，链N[auth A] SDF格式，链O[auth A] SDF格式，链QA[auth D] SDF格式，链RA[auth D] SDF格式，链U[auth A] SDF格式，链W[auth B] SDF格式，链X[auth B] SDF格式，链P[auth A] MOL2格式，链BA[auth B] MOL2格式，链EA[auth C] MOL2格式，链FA[auth C] MOL2格式，链GA[auth C] MOL2格式，链H[auth A] MOL2格式，链I[auth A] MOL2格式，链J[auth A] MOL2格式，链K[auth A] MOL2格式，链L[auth A] MOL2格式，链M[auth A] MOL2格式，链N[身份验证A] MOL2格式，链O[auth A] MOL2格式，链QA[auth D] MOL2格式，链RA[auth D] MOL2格式，链U[auth A] MOL2格式，链W[auth B] MOL2格式，链X[auth B] MOL2格式，链P[auth A]	BA【认证B】 EA[认证C] FA【认证C】 GA[认证C] H[认证A] BA【认证B】， EA[认证C]， FA【认证C】， GA[认证C]， H[认证A]，本人【授权A】， J[认证A]， K[认证A]， L[认证A]， M[认证A]， N[认证A]， O[认证A]， P[认证A]， QA[认证D]， RA[认证D]， U[auth A]， W[认证B]， X[认证B]	1,2-乙二醇 C类₂H（H）₆O（运行）₂ LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N公司		互动焦点链BA[auth B] 焦点链EA[auth C] 聚焦链FA[认证C] 焦点链GA[auth C] 焦点链H[auth A] 焦点链I[auth A] 焦点链J[auth A] 焦点链K[auth A] 焦点链L[auth A] 焦点链M[auth A] 焦点链N[auth A] 焦点链O[auth A] 焦点链P[auth A] 焦点链QA[auth D] 焦点链RA[auth D] 焦点链U[auth A] 焦点链W[auth B] 焦点链X[auth B] 相互作用和密度焦点链BA[auth B] 焦点链EA[auth C] 焦点链FA[auth C] 焦点链GA[auth C] 焦点链H[auth A] 焦点链I[auth A] 焦点链J[auth A] 焦点链K[auth A] 焦点链L[auth A] 焦点链M[auth A] 焦点链N[auth A] 焦点链O[auth A] 焦点链P[auth A] 焦点链QA[auth D] 焦点链RA[auth D] 聚焦链U[auth A] 焦点链W[auth B] 焦点链X[auth B]
ACT公司 ACT查询下载理想坐标CCD文件 SDF格式，链OA[auth C] MOL2格式，链OA[auth C]	OA[认证C]	醋酸盐离子 C类₂H（H）₃O（运行）₂ QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M公司		互动焦点链OA[auth C] 相互作用和密度焦点链OA[auth C]
NH4气体 NH4查询下载理想坐标CCD文件 SDF格式，链AA[auth B] SDF格式，链JA[auth C] SDF格式，链KA[auth C] SDF格式，链LA[auth C] SDF格式，链MA[auth C] SDF格式，链NA[auth C] SDF格式，链Q[auth A] SDF格式，链R[auth A] SDF格式，链S[auth A] SDF格式，链T[auth A] SDF格式，链UA[auth D] SDF格式，链Z[auth B] SDF格式，链VA[auth D] MOL2格式，链AA[auth B] MOL2格式，链JA[auth C] MOL2格式，链KA[auth C] MOL2格式，链LA[auth C] MOL2格式，链MA[auth C] MOL2格式，链NA[auth C] MOL2格式，链Q[auth A] MOL2格式，链R[auth A] MOL2格式，链S[auth A] MOL2格式，链T[auth A] MOL2格式，链UA[auth D] MOL2格式，链Z[auth B] MOL2格式，链VA[auth D]	AA[认证B] JA[认证C] KA[认证C] LA[认证C] MA【认证C】 AA[认证B]， JA[认证C]， KA[认证C]， LA[身份验证C]， MA[认证C]， NA[认证C]， Q[认证A]， R[认证A]， S[认证A]， T[认证A]， UA[认证D]， VA[认证D]， Z[认证B]	铵离子 H（H）₄N个 QGZKDVDFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O公司		互动焦点链AA[auth B] 焦点链JA[auth C] 焦点链KA[auth C] 焦点链LA[auth C] 焦点链MA[auth C] 焦点链NA[auth C] 焦点链Q[auth A] 焦点链R[auth A] 焦点链S[auth A] 焦点链T[auth A] 焦点链UA[auth D] 焦点链VA[auth D] 焦点链Z[auth B] 相互作用和密度焦点链AA[auth B] 焦点链JA[auth C] 焦点链KA[auth C] 焦点链LA[auth C] 聚焦链MA[身份验证C] 焦点链NA[auth C] 焦点链Q[auth A] 焦点链R[auth A] 焦点链S[auth A] 焦点链T[auth A] 焦点链UA[auth D] 焦点链VA[auth D] 焦点链Z[auth B]

实验数据和验证

实验数据

方法：X射线衍射
分辨率：1.80Å
R值自由：0.239
R值工作：0.209
观察到的R值：0.211
空间组：C 1 2 1

单位单元格:

长度（Ω）	角度（˚）
a=309.859	α = 90
b=87.353	β = 93.95
c=82.551	γ = 90

软件包：

软件名称	目的
电子秤组件	数据缩放
REFMAC公司	精炼
PDB_提取	数据提取
HKL-2000	数据处理

结构验证

查看完整验证报告

进入历史和资金信息

存款数据

发布日期：2017-05-17

存款作者：

,

资金筹措组织	位置	授权编号
国家安全委员会	台湾	NSC101-2311-B-027-001

修订历史记录（完整的详细信息和数据文件）

版本1.0:2017-05-17
类型：首次发布
版本1.1:2019-10-30
更改：数据收集、数据库引用

RCSB PDB核心运营由这个美国国家科学基金会（DBI-2321666），这个美国能源部（数据元素-SC0019749），和国家癌症研究所,国家过敏和传染病研究所,和国家普通医学科学研究所的美国国立卫生研究院拨款R01GM133198。