自组装DNA寡核苷酸的序列依赖性结构变化。
公共医学 以下为: 26627654 内政部: https://doi.org/10.107/S1399004715019598 相关结构的主要引文: 5亿新西兰元 , 5BZ7型 , 5BZ9型 , 5BZY系列 PubMed摘要: 由于互补Watson-Crick碱基配对提供的可编程性和结构可预测性,DNA已被证明是构建复杂二维和三维结构的显著分子。然而,DNA寡核苷酸可以表现出大量的局部结构多样性。 DNA构象与环境条件和寡核苷酸序列中固有的碱基恒等式密切相关,但序列与局部结构之间的确切关系尚不完全清楚。 这项研究考察了一类自组装DNA 13单体中的单核苷酸是如何在相同的结晶条件下导致显著不同的整体结构的。 DNA 13-mers在Mg(2+)存在下通过Watson-Crick和非经典碱激发相互作用的组合自组装。 这里描述的晶体结构表明,所有预测的Watson-Crick碱基对都存在,主要区别在于非经典碱基对的重大重排。 这包括剪切a-G碱基对的形成,由碱基-三元相互作用形成的链的连接,以及产生类似于串联剪切G-a碱基对结构特征的第三方相互作用。 这种交替非经典结构的采用部分取决于Watson-Crick双链区的序列。 这些结果为短DNA寡核苷酸的序列结构关系提供了重要的新见解,并证明了Watson-Crick和负责结晶命运的非经典碱基对之间的独特相互作用。