5AEC公司

II型Baeyer-Villiger单加氧酶。恶臭假单胞菌CAM质粒3,6-二酮环丙烷单加氧酶与FMN复合物中的氧化成分。


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.93 Å
  • R值自由:0.221 
  • R值工作:0.171 
  • 观察到的R值:0.174 

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文学类

恶臭假单胞菌Cam质粒中3,6-二酮环丙烷单加氧酶的加氧成分:Ⅱ型Baeyer-Villiger单加氧酶类的第一晶体结构。

M.N.伊苏波夫。施罗德,E。R.P.吉布森。J.比彻。G.多纳迪奥。萨内伊,V。Dcunha股份有限公司。E.J.麦基。塞耶,C。达文波特,C.F。P.C.刘。Y.长谷川。岩崎,H。M.卡多。Balke,K。美国犹他州Bornscheuer。G.布伦科夫。Littlechild,J.A。

(2015)Acta Crystallogr D生物晶体仪71: 2344

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S1399004715017939
  • 相关结构的主要引文:
    4UWM(超宽带),5AEC公司

  • PubMed摘要:

    II型Baeyer-Villiger 3,6-二酮环丙烷单加氧酶氧化组分过表达形式的天然酶和FMN复合物的三维结构已被测定为1.9º分辨率。这种编码在恶臭假单胞菌大CAM质粒上的二聚体FMN依赖酶的结构,通过溴晶体浸泡的多重异常分散和使用细菌荧光素酶模型的分子替换相结合来解决。FMN辅因子的异alloxazine环在该TIM-相关折叠酶活性部位的取向与以前在细菌荧光素酶样超家族的酶中观察到的取向有显著不同。Ala77残基呈顺式构象,在β链3的C末端形成一个β隆起,这是该超家族中许多蛋白质的特征。


  • 组织附属关系

    英格兰埃克塞特EX4 4QD斯托克路埃克塞大学生命与环境科学学院生物催化亨利·韦尔科姆大楼。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
3,6-二酮腺嘌呤1,6-单氧化酶378恶臭假单胞菌突变: 0 
欧盟委员会:1.14.13
UniProt公司
寻找蛋白质d7用户1 (恶臭假单胞菌)
探索D7燃料1 
转到UniProtKB:D7燃料1
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团D7燃料1
序列注释
展开
  • 参考序列
小分子
配体4独特
身份证件链条姓名/配方/InChI密钥二维示意图3D交互
PIN码
PIN查询

下载理想坐标CCD文件
C[认证A],
M[认证B]
哌嗪-N,N'-双(2-乙基磺酸)
C8H(H)18N个2O(运行)6S公司2
IHPYMWDTONKSCO-UHFFFAOYSA-N公司
二氧化硫
SO4查询

下载理想坐标CCD文件
本人【授权A】,
J[认证A],
T[认证B],
U[认证B]
硫酸根离子
O(运行)4S公司
QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L公司
高尔夫球
GOL查询

下载理想坐标CCD文件
D[认证A]
E[认证A]
F[认证A]
G[认证A]
H[认证A]
D[认证A],
E[认证A],
F[认证A],
G[认证A],
H[认证A],
N[认证B],
O[认证B],
P[认证B],
Q[认证B],
R[认证B],
S[认证B]
甘油
CH(H)8O(运行)
PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N公司

CL查询

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K[认证A],
L[认证A],
V[认证B],
W[认证B]
氯离子

VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M公司
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.93Å
  • R值自由:0.221美元
  • R值工作:0.171 
  • 观察到的R值:0.174 
  • 空间组:第2页12121
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=54.963α = 90
b=93.317β = 90
c=161.893γ = 90
软件包:
软件名称目的
CCP4型模型建筑物
没有目标的数据缩放
摩尔代表阶段划分
MLPHARE公司阶段划分
DM公司阶段划分
CCP4型阶段划分
REFMAC公司精炼

结构验证

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