4个XP0

抑制剂配合物中ERK2的晶体结构


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.46 Å
  • R值自由:2014年2月
  • R值工作:0.190 
  • 观察到的R值:0.192 

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文学类

结合“干”共结晶和原位衍射,以便于通过X射线晶体学进行配体筛选。

杰林,M。弗吉尼亚州德尔佛斯。阿勒曼德,F。胡,F。Y·萨尔拉兹·达马兹。M.皮罗奇。布尔盖,W。费雷尔,J.L。拉布西,G。吉丘,J.F。

(2015)Acta Crystallogr D生物晶体仪71: 1777-1787

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S1399004715010342
  • 相关结构的主要引文:
    第三代RDC,4XLD(4XLD),4XN6型,4XNC(4XNC),4XNE公司,4XOY系列,4XOZ型,4个XP0,4XP2型,4XP3型,4XRJ型,4XRL系列,4ZSC型,4年

  • PubMed摘要:

    X射线结晶学是基于片段的药物设计项目中配体筛选的一种既定技术,但所需的手动操作步骤(用配体浸泡晶体和随后的采集)繁琐且限制了该过程的吞吐量。这里,报告了一种替代方法:在蛋白质结晶之前,结晶板预先涂上潜在的粘合剂,并直接“原位”(或板内)进行X射线衍射。它的性能在目前正在研究的不同和相关的治疗靶点上得到了证明,以通过使用弯曲磁铁束线或旋转阳极发生器的X射线晶体学进行配体筛选。使用待涂覆配体的DMSO储备溶液的可能性为筛选大多数化学库开辟了一条途径。


  • 组织附属关系

    CNRS,UMR5048-蒙彼利埃大学,生物结构中心,34090蒙彼利耶,法国。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
有丝分裂原活化蛋白激酶1351褐家鼠突变: 0 
基因名称:地图1Erk2型马普项目1
欧盟委员会:2.7.11.24
UniProt公司
寻找蛋白质P63086页 (褐家鼠)
探索P63086页 
转到UniProtKB:第63086页
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团第63086页
序列注释
展开
  • 参考序列
小分子
配体3独特
身份证件链条姓名/配方/InChI密钥2D图表3D交互
42安
查询42A

下载理想坐标CCD文件
E[认证A]1H-吡咯[2,3-b]吡啶-3-碳腈
C类8H(H)5N个
MUCWDACENIACBH-UHFFFAOYSA-N公司
二氧化硫
SO4查询

下载理想坐标CCD文件
B[认证A]硫酸根离子
O(运行)4S公司
QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L公司
DMS系统
DMS查询

下载理想坐标CCD文件
C[认证A],
D[认证A]
二甲基亚砜
C类2H(H)6操作系统
IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N公司
改性残留物 1独特
身份证件链条类型公式2D图表起源
芝加哥商品交易所
CME查询
A类
L-肽连接C类5H(H)11S公司2CYS公司
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.46 Å
  • R值自由:0.214 
  • R值工作:0.190 
  • 观察到的R值:0.192年
  • 空间组:第12页11
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=48.91α = 90
b=70.79β = 108.99
c=60.41γ = 90
软件包:
软件名称目的
标量数据缩放
菲尼克斯精炼
PDB_提取数据提取
菲尼克斯阶段划分

结构验证

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进入历史和资金信息

存款数据


资金筹措组织位置授权编号
法国国家研究局法国ANR-10-INSB-05-01

修订历史记录(完整详细信息和数据文件)

  • 版本1.0:2015-08-12
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2015-08-19
    更改:数据库引用
  • 版本2.0:2017-09-06
    更改:咨询、原子模型、作者支持证据、数据收集、派生计算