4QKH(四开)

人类LLT1的二聚体形式,NKR-P1的配体


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.80 Å
  • R值自由:0.250 
  • R值工作:0.175
  • 观察到的R值:0.180 

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文学类

人NKR-P1配体LLT1在不同糖基化和齐聚状态下的四种晶体结构

斯科洛娃,T。J·布拉哈。K.哈洛斯。J.杜斯科娃。科瓦尔,T。J.斯特兰斯基。J·哈塞克。O.瓦内克。J·多纳雷克。

(2015)Acta Crystallogr D生物晶体仪71: 578-591

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S1399004714027928
  • 相关结构的主要引文:
    4个千克,4QKH(四开),4QKI公司,4QKJ公司

  • PubMed摘要:

    人类LLT1是NKR-P1(CD161,基因KLRB1)的C型凝集素样配体,是自然杀伤细胞的C型凝集素样受体。利用X射线衍射,确定了人类LLT1的第一个实验结构。在不同条件下测定了LLT1的四种结构:单体,在第一个N-乙酰氨基葡萄糖单元之后以两种形式二聚脱糖基,以及具有均匀GlcNAc2Man5糖基化的六聚体。二聚体形式遵循人CD69的经典二聚模式。单体形式保持相同的折叠,但长环区域外部的位置除外。糖基化LLT1的六聚体由三个经典二聚体组成。六聚物包装可能表明糖基化形式的C型凝集素样蛋白的可能相互作用模式。


  • 组织附属关系

    捷克共和国科学院生物技术研究所,v.v.i.,vídeňská1083,142 20 Praha 4,Czech Republic。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
C型凝集素结构域家族2成员D135智人突变: 1 
基因名称:CLAX公司CLEC2B型CLEC2D公司LLT1型OCIL公司
UniProt&NIH共同基金数据资源
寻找蛋白质Q9UHP7型 (智人)
探索Q9UHP7型 
转到UniProtKB:Q9UHP7型
PHAROS公司:Q9UHP7型
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团Q9UHP7型
序列注释
展开
  • 参考序列
实验数据与验证

实验数据

单位单元格以下为:
长度(Ω)角度(˚)
a=50.87α = 90
b=57.82β = 90
c=82.25γ = 90
软件包:
软件名称目的
棒球阶段划分
REFMAC公司精炼
MOSFLM公司数据缩减
无目标的数据缩放

结构验证

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  • 版本1.0:2015-03-11
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2016-01-27
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  • 版本1.3:2018-06-20
    更改:数据收集、数据库引用
  • 版本1.4:2020-07-29
    类型:补救
    原因:碳水化合物修复
    更改:数据收集、数据库引用、派生计算、结构摘要
  • 版本1.5:2023-11-08
    更改:数据收集、数据库引用、细化描述、结构摘要